SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003258_2.0
Identity
Transcripttocopherol (alpha) transfer proteins (TTPA)
SpeciesManis javanica (Pangolin)
Transcript IDSPT00003258
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003136_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003258_2.0 # Transcript # tocopherol (alpha) transfer proteins (TTPA) # Pangolin (Manis javanica) # Full length # Forward
ATGGCGGAGACGCGGCCGGGCCAGGCGGCCGGGGTGCAGCTCAGCTCGCTGCCCGACCAC
TCGCCGGTGCTGCAGCCGAGCCTGGCAGAGCTGCGGCGAAGGGCCCGGGCGGCGGGCACC
CCTCCCGCGCCGCTGCAGCTCACCGACTCCTTCCTGCTGCGGTTCCTGCGCGCCCGGGAC
TTCGACCTGGACCTGGCCTGGCGGGTAAGGAGGCCTCCCGCCGCGCCACCCCGCGGCTTC
GCGCAGGCGACGCGAAAGCCCGAGCTGTGGTGCGCGCGGCCGTGGGACGCGCCGCCGCGC
ACCTGGCGGCGGGCGTGCCTGCAGGTGTTCGTAGAAATCGCGCCCCGGTGCTTCCAAGTT
CTCTCGGCCGTGGAAAAGGGCAACCTGGAAAAAGCTGGTACACTCTGGGGTAATGGCCCG
TTTGACCCCAAACCCTGGAACTCTGCCTTAGACGAGTCTCCCGACCTGCACAATTTGGGG
GAAATGCTTTTGCAGAAGGCCGGTGGTATAAAAATCCGAAGAGCTGAAATGCAGGAAGCT
TTGATTTATCACATTTTAGTGGATAACGTGGAGGGGAAAATGAAATCGCCCTTAAAACTG
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CTACGGCAAGCCCTCAGCAGTTGGACCTGATCTAGTCTTTTCTCCAGGTGGCTTGCCTAG
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AAAAATACTCATAATAGTAAAAGGGGCAAAGTAAATTTCTAAAAATTAACTTTCTAAAGG
AAAAAATGTCCCCACCCCAAACCTTGTTTGCCAGTCATCTGTCTAGAGGCATTTACTGTT
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CATCTTGTCTTTTTTACCTGGTTTATCACAGAGATCAAACTATTACAGAATGTGTACATA
CGTCTTATTATTTGGGGGCTATGTTCTATTCCATTTATTGTACTAAAGGTCAGCAGTCCC
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TTCCTTCATTCAATGACTAGTTTCTGAATTACAATTTTCCTGCAGTAGGGGAAAGGTGGT
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GGATGGAGATGCACGTTTTCAGTGTTGAGGAATATAACAACTGTTCTCCACAGTGTTTGC
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GAAAAAAGTTTGCCTCCAGCCTCTGTTACATATATACATGTATGTTACAGACATATATAT
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AAGTGGTGGAGCAGGGATTTGAACTTGGGTTGAACTCTGGGTGAGCCTGTGCTCTCAAGT
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TGTCTATTCCACATATTCTTGTGAATTTCTGTGTTTCACAAGTGAATAATTCACTTCCTT
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AAAATTCCACTGACTGTCCCTGCTAGTTTTCCTCTAAATGTAGCTTCTTTTGTAAAACAT
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TTTTCCAGTGTGTGGATCCTGCTGGTTTACTCAGGCACTAATTTATTTTCATTCAGCACA
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CTCTTACCTAGAAAATGTTTTCTAATGAAGCTACAGCTTTTTTTCATTTCCTGGGAAAAT
AAAATCATTATTTCTATATAGAAGTTAATATACAGCTTCTAGTGTTTTGCTTCAATTAGA
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CTATTAGCACTTATTCTGATGGCCCCTAAGACAGCAAGAGGAAGAGATATTCATCTCATA
GAAGAGAATGAATATGTCAGAATCTACAATGTGTCTTTTGTTCTTACTGCTTTTGGAAAC
TGCTATTTAGGTCACCAGTTAGTTCTCTGTTGGCAAATTTACTGACTTTTTCTTTCTTAC
CTCTTTGTTGCATGTAACTCTTAGAATCATTCTCTTTTTTAAAATAGTTAAGAAAAATTC
ATTAAATGCATAAATGAAAGGAGAGAAAGATAGGGAGGTAATATCAGGGAAAGTGAGAGG
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GGTTTTTGGTTACATTTATCATGTTGTTGTTTCAATGACTCTCAAGTATAAAGTTTGTAT
TTTCCTTTCATCTGAACTTCAGTTCACATTGCTAGTAGATCTCTTTAAACTCAAAACAAA
TATATTGTCATTTTACGAAAACTGAGAATGCTGAAAATCATGAAGAGGAAAATTCAAATA
TAATATCTCTTAACTGTATAAATTGATTTTAGTGTTCTCCACAATGCACTGACAATGTTT
GTATTATTTGCTAATATAAAGTAACCATTATTGGTGGTTCTTTTGGAAAACAAAAAGAAA
ACAGAATTTCTTCAAAGTATATTTTGCCAAGACTTAATATCCAAGTATACCGTTTCTTAG
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AGCAATTAACCCAGATAACTTTCCTTACTGCAAGAACAGCAGTGGTTAACTACCAGGCAT
GATGCCCATATATGCTTTACACATAAACTTACAAGGCAGATATTAAGGAAATAGAATGCA
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TGAAGAAGCAGAAACTGAACTTTTCACTATCTAGAATGACCTATATCATCCAGTTGTCAC
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CCTAACACAGTTTGTGGAACATTGTAGCTGCTCAAAAAATATTTGTAAAACTAATTCACT
TGATTTCTACTCTTATTAAAAAAAACTAAATGTGGGTGTTTCAGTTATCTATTGCTGAGT
AACAAATTACCCCCACATGTAGTCACTTAAGCCACAACTATTTATTTGTTTGTGATTCTT
CAGTCAGGGCAGGGCTCAGTGGGGATGGTTCATCTCTGCTCTGCAGTGTTAGCAGAGGGG
AACATGGCTGAGGTCGGACTATCCGAGAGAGCATCTCATTGTCCAGCACCTCACTCCACA
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TTCTAGGCTCCTTAACCTAGCACAGTGCCACTTCTGCCAAAGCAAAACAGAAGGCCAGGC
CAGCCCAGATGCAAGGGGAAAGATCAGAAGGGTTCCTCCTCTTGATGGGAAGAATGGCAT
GTATATACCAGAAGGGGAGGTATCATTGGCAGCTATCTTTGGAGACTCCCCACCTTAGGA
GACAATTGAAGAGTACTCAACTTCAATTTGCAATGAACTCTTAATCACCTGAGGTCCTTG
ATGTAGGGAACTTTTTAGTTTTTGTAGTTCAAATGATACCCTGGATTAAAATCAGTGTAT
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TAAAATGTTGACCATGTATGCTCTCTGTAGACAATTTTTATTTTATTTTTCAGCTACTAA
AAAACTATTATAAATGGAGAGCAGAATGTCCAGAAATAAGTGCAGATCTACATCCTAGAA
GTATCCTTGGCCTTCTGAAGGCTGGCTACCTTGGAGTCCTGAGAGCCAGAGATCCCACTG
GCAGCAAAGTTCTTATTTACAGAATCGGTAAGTCATAAGCATTTCTTTTTCATTTTTCTT
GATACCATATCAAAAGCTTTAATGAGTCCACATTGATGGATTTGGCTTTTTAGGTTTTAA
CTTAGGTTTAATTTAGATTTTAATGCCCCCCGAATACAAAAAAAAACTGTCAGTCATGAG
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GAGAAAAAGAAAATAGAGAAGGTAATAGGAGGAAAAGGTGTAAAAAGGAAAGTAAAGTGT
TGCAAAAATGCTTAATAGGAAATCCAAATAAGAATTCTGAACTATGTAATGTATGCTCCA
TGAGAGCATGTGAATTCTGTCTGTTCTGCTCAGTATATATATTCTGAGCACTGAAACCAG
GGCCTGCACAAAGTAGGTATTATTAAGTAAGTTTGAGATGAGTGAGGGAATGGCTAGTTG
GATGCTGCCCAGGCTTTGGAACAAAGCGGAAGCCCTGCCGTGTGTCAAAGGTACTGTACA
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TGGTGTGTTAACTGAGGACTCACACCGCTCCAAGTATCCTCTCATGAGAAGACAAAGCTA
GCCAACATTTCATGAGCAGAATCTTATGAATTATAATCTTACAGAAATTTTGACCTCTGT
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TGAAAGGGTATCAGAAGACTAAGTATAAGGACTGTTTTTTTTGCTCCAGCTTATGTGTCA
AGTACAGCTGGGTTAGTCATGAAGTCATTGTCTATAAAATAGGTATTACAGTGTCTTTCT
TTGTCCTTTTCTTGCCATACTTGTTTAATAGCAAGTTGAATAAAGTTTTCCAACTCCCTT
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TTTTATAAAAATATAGTGTCCAATTGCATTTGAATTTCAGATACATAGCAAATAATTTTT
AGTATGCATGGAGCATATTTATACTAAGAAATTGTATCCTGGCTGTCTGCAATTCTACTT
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TACAGCTGAAATCAGTCAAAGGGAGAAATAAAGTTTAAAACCTGTTTATTGCTTACAAAC
TGCTGTCTGGGGGCCATCTCTTCCCTGCTCCAGCAGAGCAAGAGAAACCTCCCACCAAAC
TCGCAGTTTCAGAAAAGCCCTCTGTCACCCAGGTAACTACCCATTGATATGGAGATGAAC
TTCTCTCCACCCCTTAGGAACGCCTGTTCATATGGTAATGCACTAATGCCAGATGAGATA
TTCTGGAATATTACAATTTTAACCACATAGTGAAAAAGCAAATATGCTATGTTGCCCATA
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CCTCTCTTCATTGTGTGTTTTTGAAGATACTGTAGTTCTTAGTGTATGCATATCTGTTTC
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TTCGTTCTTTTTTCCCCTCCAATCTGCTATTTGCAAGGAATCTGAGGAGGGAGAGAGAAG
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TAAATGGTGGTATAGCCATTTGATGTATTATTGCAACAATATTAAAACTCACGATGTTTA
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GTAATTATTTTTAGCTAAAATTACACATAAAAAGAATCTGGAAGGAAAGCCCCAACTTGA
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GGTTTTTCTTTCAATTGTTAACTTTTAAACTTAAAAAAGCCTATATTTCTTTGATGTGAA
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TTATGAAAGTTGGATTTTTTTCTCAAAATAAAAATTTGGGGGAAAAGTTAAATATAAATA
TCCAAATGACTCATTGGTTCTTTTAAAGAACATGTATATATGTGACTGGGGAAATATATT
CTATGTCTTACTTATGAAAGATGTAGTATTTCTTAAAATACTTTGCCTAAGCTACAAGGT
GAAACCTTTTTAGAGATCTTTTCTTAATCTAATGACAGTGAACTATGAAGCTGGCTATTG
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GTTTGAAAATGGAACTTATCAATAAGAATTTATATTGATTTATGCTTTGTTATTAATAAG
GTGTTTTCTTTATTTTTAAAAGGACTCATTTCCATTAAAAGTTCGTGGTATCCATTTGAT
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TCATTTCTAGCCATGCGAATGTAGAATTTATGAATTTTGAAAGTAAATCTATTTAAGTTA
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TGATAATGGCTGACCACCTTCTATTTAACTCTGAAAGATCTAAAAATAAATATTTCTATT
TTGGGTTATATTCTGGATAAATAACAAAAACAACAATAAACTGAACCTAATAAATAAGAG
AATAGAGGCAAAAAAGAAAGAAAAATAAAAAATTGAGAAGGTAGGTAAAGCATTTCAGTG
AAAGTTACTTGCCATGAAATGGACTTCTCAAAATGGGTATGGGGACTCAGTCTGTCCACT
TTTCTCCTTTTCAACATTTTGACTGTACCTTGCGAATGTTCTTATTTCCCCCTTCCTAAC
GTGATAGTACGGTTTCTTTTCAATTAGCTGGCAATATTTAATTTAAATTAACTTATTTTG
TGCCTCTTTATCCTCTGGTAATATTCTAAGTTTTCAGAAAAAAACAAGTATTGGGACAGT
GAAGCTTCCTGAGTGTAGGAAACTTGTCTCATTCATCTTTCAATCCTTGTCCCTTAACAC
ATAGTAGGTGCTCATTAAATGATTGTTGGCTATATAGATGAACACTTTGCGCTAGCAGAT
GGAGAAAGATCATTTATTCATTTATTTTTAACAAGATGTACTTTGAGCTGAAGGTTCCAA
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TTTAAGCTTCTCCACCATCATAATCTCTTAAGTTTGTACTAGCCAAGAGTATCCATTAAC
TGTACTACACAAATTATTCCCATGTACCTACTTGTGTGCTCAGATATATGCTTTTATTTA
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ATATTTTGCTAAGAATCACCTATACATTAGAGAATAGAATGAACAAAATAATTTTAGAGT
TTAAAAAATCTACTTTTGAAAGAGGAAAATAATATATTTTATTTTATAAATCTTGTATAG
TTATAAGAATACAAAAGTAAGAAAACAGTAAGATAATCAGATTAATGAGAAGCACAATCT
AAATACAGGTAGATTCTTAGATTTACAAGCAGAGGAATAAAAGTTGTAGCACCTATACAT
GTTCTTCTATGTTGGGAGTTACTAAAGTACTTTGTTTTATGGCATTGATTTTTCTACTGG
AAATGCACTTAATAAACTGAGAGGTAGAGGGCATACCTTCTAAAATGTTTTGGCTATTTC
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Chart Advanced