SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003263_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein I (SelI)
SpeciesXiphophorus couchianus (Monterrey platyfish)
Transcript IDSPT00003263
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003141_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003263_2.0 # Transcript # Selenoprotein I (SelI) # Monterrey platyfish (Xiphophorus couchianus) # Full length # Forward
TACGAATATGTCACAAAGGAGCAGCTGGCGGGGTTCGACAGATATAAAGTAAGAGAGAAA
ATGATGGGCTGAGAGCTGTCACGATCCTGGTCGCTGATGCTGGGGAATTACACATTTACC
GGATGTTAGTCCGGTCTTAAGCCTTGATAAAGCTTTTTATCAACTAAATGTAATCGGGAT
GTGTGTATCTTCATTCGTGTCATGCTAAAAAATGTTCTTTGTTTAGTTGTCGATTCTAAC
TTTTTATTTAGTAATTTTATAGAACATCCCTACTGCTTATAATTGTTGTTTGTGGCTTAC
CCTTTATCGCCACTGAGCATTAAGGCGCGTTTCTCACCATACCTAATGTAATGTTCTTAA
TTAAACATCCTTTTTATATTGACCGGAAGTGTAGTGGCATGCAGCCTCCTGCTTTACAAT
GGTGCAGAGGCTAATGGCTAGCCATCCTCTCTCTATCCTATTTGACAAGAAGCTTTTTTC
AAAGTTTTCAGAGAGGTTTGGTTTGTATGGAAGGCTCATTTGGTATTTATTGTTGAAGTA
TATCTGTAATAATACGCTAGTGAACCAGAGGGAGGGATGGGAACTGTACACTAGCATAAA
GCCGGAGGCTGTCTCACATTTTGTTTTCACTTTATATGTTGTGATATTTCTGTTTAGGTA
GTTCCTAAGTTTCTCACTTCCTGTTTGGACTGGAAGTGAATTTGTCCCAAGTTTATTGAT
CATGCAGTTTATCTCAAAACTAAGCAGAAAAAAAAAAAGATTTAATGTAAAGTATGAGCT
GTATTTATAGTTGGTTACCGCCTACAATTACATTGCAAGCTACACTTGAATTTTCTTAGT
TGTGTTTTTGTATTTCTTGTTAGTCATGAGAGGCGTTTTGCTAGTAATTGTCTTTTCATT
GCCTTCCTCCACTTGCTACATCACTGTGTTCCAAGTAGACACTCAGTTGGTGTTATAAAC
TTGCGTAAAAATCACCACAGTTGCAGAAATGAATTTAAAAAAAAAATAAAGTAGCCATAT
AATATCATCTGAGTGCATCTATTTAATACAGAAAAAAATGACAAAATATTCTTAATGCTA
ATGAAAAAGAAGCAATACATTTATTATGGCGGTCCGTTTAATGTTTTCTGGATTATTATT
ATTATTATTATTATTATAGTTTGAACACATAGACCTCAAGCAGGGATAAATTAGCCCGTC
TAAGTTGTTTGTCTTAATTGATGTAGATGTTAAATGTAGAGGGGTGTCCAGACTTTGAAT
TGTAGAGTGGGATCTACTCATGGGCCACAAAAACTTGACTTTTAATTAAAAAAACACACA
CAAAAAAGAAATAATTAAAAATGTCTCCTTCTTACATTTACATGCTCAACAGTAAATTAA
ACATAAGATATTTTAATGGAAGAAACAAATTGGCTAGATCTGTAATTCATGATTCATTCG
TAACCTGCTTCTCACTAGTATTCAGAAACAAGTGGGGGTCACTCCAGACCTTGCAAATTT
TCATAAAGACTTTCAACAGGCAGAACAACACGATGGGAAAATTTTAATGTTTTTATTTTA
AACCACAAGCTTTAAAACCCCTGCTACCCGCCACTACATTGCAGCCTCTGCTTTATATTT
TAGCTCCTTCAGTTTGTTTATAACGAGAATCGATTTTCAAATAATTTACCAAAGCGTACA
GATGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACTGTGCTGCTATGATTGGTGTGCA
GTTTCGCTCCTCCAGTTTTCTTCCTCGGAGATAAGAGTGCAACGTGTGATCTGACTTAGA
AAAGTCTTACAGCGTGAGTAACGTGTAGAAATTCTCACTTACAGGAAGAAGAAAAATACA
ACATTGATACAGCTGTATTGCAGTAACATTATGTTAAACATTAGTGGGGCGTGGCTGCAT
TTTCTTGCTGCTCTACAGACAGTAAACACACCTGTGGCTCCTGTGAAATATTTATTTTAA
ATAAAGAAGATCCTGCTCCTCCTTTAAGGGGATACAGATTGGAAGGTAGATTAAAAATCC
ACAGGAAAGGGGCCCGGTTGACCAAAATAGCGACGTGACGAGGGGCCGTACAGCGTGTAC
TCCTGACAGCAGCCACTGGATCTCTTACGCGTGTTTGTCATACCTAGATAAAGTTACAGA
CACTGGAGCCGGGTTTGTTTTGCTCTCAAGGCTCACTGGAGGATCCTGTAAACATGAAAC
ACGTGGAATTAAATGACATAGAAAATGTGTGTGAATTATTTTACGTGTAAAATATATATA
TATATATATATATATATATATATNNNNNNNNNNNTTTTTAATGACGGGCTTTATTTGTTT
GTTTTCGCAGTACAGCGCCGTGGACACGAACCCCCTGTCCGTCTACGTTATGCATCCTTT
CTGGAACTTTTTAGTGAAGGTAAGAGCCAGTGGAGAGCTCCATCATTCATGACGTTTTCC
AGCCATCCGCGACAGCTGTGGACTTCGACAGAGCGTCCCAAAATATGCCTGACTAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAGAACCGATTTTTCATTTGCTTTGTGAAATGTATACGTCTTTTTAAAA
AATATATATTTACAGCCCTTTCATTCCTCACATATTTTCTGCCATTTAGAGCTGCATAAC
GATAATAACAAGTAAGCAAATCTGATAAAGTGATATCAAAACACGATCCAAAGGTCGTCG
ACGGACGGCTGATTGCGCTGCGGGGTGAAAGCTCTAAGGCTTCCGGCTCGCGTTACCTCA
AGCTGCACCCAGAGAGCCGAGACCAGGGCAGACGGGGCTTTTAGGAAGGGTTTCATTCCC
ATTAAAAACGACGATAAGCCTAAAATGCTTTAATAGTAACACACTATTGGTAGTACGTTG
GAAGTCTACGGCCTGCAATTAGTCGCACTTTTTCTGGAGCGTGGCGTTTTTGGAAAAAAT
GTCTCACCAGACTTTACTGTGCTTCCACAAAACCTGGCGATTCATTGTACTACATAAAGT
ACTTTTGTACTAGGCGCTCTTGGAAAAATTGAAAAACCTTTCCAATCATCACCTTTTACC
AACAAAATAAAAGCTTCACCTTGTGACGTTATGTCCCGTAAATGGTAAGGTAGAGGCATT
TTCCATATCCAGCCGGCAATGCAGAAAATAAAGTATTTTTGCTGACCCAAAATCATCCAA
ACTGAAGAAAAGTATGTCGAAAGGGAATCAGGCAGATTTCCTTATTATATTAAAATATTG
TTTTTGTGTGTTTAATTTGGAGGTAAAAATAAAAAAGGTTTCTGCAATCATGATTAAAAA
GAAAAAAATTTCATTTTGCCAAAAAGTTTGGACTTCCAGCTTTCTTGTAGTGGAAAAAAA
TATGAGGTAACATATTTAGCCGGATAAAGAGTTTTAATAAAATAACGAGTAAAATATGAC
TCAGATTAATCGCTCTGACCTGGTTACAAGATTTTCTTTTTCCAAGTACTTTGCTTCATC
TATGCACAGAAACGTGTTTTACATGCTCTTTTAACTTTTGTGCTTCATTTCTAATGGATA
AAACTCCATCAACTGTGTTTCCCTCTCTCTTCCAACAGTTTTTACCAACATGGCTGGCTC
CGAACCTCATCACATTTACTGGTTTCATGTTCCTCGTGCTGAACTTCCTCATGTTGGCCT
TCTACGACTTCGACTTCACTGCCTCTTGTAGGTCCATCACTTCGTTCCCGCTGGGCGTAC
GTTGCCGTGACACACAACTGTTTAAGGGGGAGCAGCTCCGTCTTTGTTTATGCGGGGCCA
AAGTGCGTCACTCACGGAAACGGGACTGACGCTTGTTGCTCAGGACAATTTTTAACTTAT
TAAATCCTTCACACACATACACAGAGAATGTTATCAGTGTTGCCACGTCGGTGCGTATCT
GTAATGCAGAAACAAAGGCTAGCCTTTGCAGTCTGTGTTGACATTCTGTGTTTTGGTGTG
TCGTCTTACCACAGACACTTTGACCTAAAAAAAAAAATCACTGTATCTTAAATAGATTTA
TGTTGAATAAGAAAAGTAGAAACCAGTTGCTTTGTGTGTTTCTGACTGTAAATGTTCGGG
TCGTGTGTTAACGTCACTCGTGTCTCAGCTGCAGGAAACCAGCATGTGCCTAGCCTGGTG
TGGGTGGCTGCTGGGATCTTCAACTTCTTAGCCTACACTCTCGGTGAGTTCTGACCTCGT
CGACCTCTGGAGATGGAGTCATCTCCCTCCTCTCTCTGACTTTCTGAGAAGATCAGCGAT
GGGGAGCTTTTCCCAAAAATCTGTTTGGTGGTCAGTTTATTATTTTTGACTCGGAGTCTC
GGAGGCACTCAGCAGTGCTGAGAGCGAGGGGTCACACGTAACGCAGGCGCATGGAAACGG
GTCACATGAGGAAGAGCAGTCAGTTTGTAACACACAGCAGTCGGCTAACATTAGAGGTGC
AGAAGGAAACGATTATGTTGAGAATCGCAATTCCTAGCCCCGGAAAATACTCAAAATGTG
ATGTTAGTTTGTCAATTTTTTGATAAAATTATATTTTGAATATATTTTTTTTAATTTTAC
TGAATGATTGAGTGATGGTGTCAGTGAGAACTTTACATCCACTTTTTTTGAGCGTGAATC
TCATTATTCTGGGTTTTCTGTGATGGGTTTGGACCAGAATAAACATACAGCTTCAGTCTC
TTTTTTTAAGAACTATATTCAGCTGCACAAGTTTTACTTTATTTTGGTTTCATTCAACCC
GCACAGGGTCAAAAATGTACATAGAAACACAAATATCTACATACTGCAGGCTAGAATCCT
TCTGGAGGAAATGTTCGTGTCCAGATGAGACGCAGGTTGAGTTATCTGGACACAATCAGA
TACAAACACGTGAGGGAGTCATGGTGAGGCTTTCAGATTTAAGAATACAGTGTCAGCCGT
CAGACATGGCAGTGATTAGCATCTTCTGGTGCTGTTCCACAGTTGACAGTGAGATCGTAA
TCGTCTAGATTGTACGCAGACAGTGAAACACATTAGAACTGGTTTTGACGTGGATAAACC
AGCTTCTGCAATGTTTTTTTTTTCTTAACTTCAACCAAAGAAAGAAATTGTGGATTGTTT
AAACTTTTATTTTAAAGAAATTAAGAAATGTTGTTTTTTTTTTTACATATTTGTCAAAAC
TGTCAGACAGATAATCTGTAAAAAAAAAATTGAGTTCCTCTGCTTTCTCCCAGTGCTAAT
ATTGTCATCTACAATGGGCTCTTTGCACGCGGCTTTCTTGATCCCGCTTTGAGTTACCAT
GGCAGCTAGAAAAGACAAAGTCTTATTTCAGTCGCAAATAAAACAATACTATGAACATTG
CTGTCTTCCTAATATAATGGGCTTTTAAGTTTTCATGGATTTCCAAGCGGTCCTGAATTA
AGAAGACGGTAGCTTGTAAATATTCGTCGCTACCAGTTAAAGCTAACGCCGCACAGCAAA
GTTTACAGCCTTCACATCACTCCGGATCAACTTCTTCAGCCTAAAGAAGACGGTAAAGGA
GCCTCCTGTGTTATTTCCATGGACTCACTTCTGTATTCAGCCTGAATGATCGAGTTTATG
GGAACCAGAGAGCAGAGCAACTGATCCGCCTGTACACACTGCTGTAAACACCGTCCTATT
TGAGTTCTTAACAAGAAGCATGTAAAAGTACTAAAACTAAGTAACACGGAGACCTTAAGA
AACACGACCATATTTTTCTAAAAGCAACAACTATGAACCTGAAAATTCATAGATTCAGCT
GACTCAGAGTTTGAGTCAGCTGAACTCAAACTCAGACACCGGTGCTGCCCTACTTTTAAG
CTATGGGGCTTGTTGTGCTTCCTCATGCCTCAGAAGCAAAAAGCCCAAACCTTTAACTTC
CTCCGTTACTTGCTCTCTGACACTAACGACAATAAACACACATAATATACTTGAAAATAA
GTACAAAGCAAGGTAAAAACATCTAACGTCCGTTAGAATGGATTAAAATGTTTAGATACT
TAAATATCCCATTTTTATAAGAAAAATGTCAGAGAATATTGTCTACTAGCATAAGCTAAA
GCTAATGTTAGCCACAAAGTTTAAGGAAAGTAAAACTCACCTTCGTATCTGTGGACGTAT
AACGAGGCGAACATCTTAAAACCTTTCTCCAGATTACTTGTTGGGGCTTTGGATCGATGT
TCATCATTAATTGCTACGTTGGACAAGCCCCAACAGGCCCCGAGTGTAAAATGCCATATT
CAATAGACCGGAAACGACCGAGCCGCTTTTCCCCGAACACGGAAGCTAACCAGCAAAGAG
CCAGCGCTCGGTCAAAACCAACCAATCAGAGCCTGTAAGAGGGTCTTAGCGCTGTCAGTC
AAGCTCGTGTACGTGCTTGCTCTCTACAGCTGGCACACACCAGCACAGCCTGCCATGAAT
GCTAAGGCTAGTTAGCATGCCTGCCAATAACGATAAACAGTTTTTTTGTAACGGTAAGTT
GTTTCTCTGCCATTAGCACATTGAGAAACGTTAAGACCGACCTCCTGCCTCTGATTGGTT
GTTTTTGCATTTCTTCAGATGGCAGTAAGACCACAAGCAGGTGATGGAGGAGCTCGATTT
TATTTATTTATGTATTTTTTCACAGATTATGTCTCATATTACACTATTACAACACGGTGA
CCATTTTATAAAATATGTTAAAAAATGTTTTTGTAAATGTTACGTACTGGTCAATGACAC
AAAACCAACCACTTTAACTCAATTCTAATTTAAGGTTTGAATAAATATCTATGCAAAATT
ATGAATTTTGAAGGCAACAAAAAAGGATGTAGTTTCTGTGTCAGTCTGTGTATAATTGTG
CAACGGGACTGTTGCATGTTTGGTTTATAGAAAATCCACCACAAATTCAACTTTCTTTTT
TTATAGATATATAATTCATAGAACTTTTTAATGTTATTTCCATTCCGCTCTGTAAAACAC
GACACTTGTAACAAGTTAGCAAAATATGAATCAGATCTCCTTTTGACTTCAGTCACAACT
TCTCAAGTTTATTTCCCAAAGACGCCGCCTTAGTAATCATGTGGCTGTTAAGTTAAAGGG
AAACCCAGTCAACTGTTTCTCCATAAGCACCTCTTTGTTCTGAAGTTTGCTCCATAAATC
ATATTAACCCATTTCCATGGGACTCTTGGGTGGAAGTCCATATGTGCTGCAGCAGCAGTG
GGACGTAGGAATGTGTGTAACTCTAAGGAATTTCTCTGGAGTGAGCAGCAGTTTTATCTG
GGTGGAGGTGTCACACATCTGCGTCTCTTTGTTTGCATCGTTCGTCTGTAAACGCGTAAC
GTTTTTTTGTTGTTGTTTTTTTTCACCAGACGGCGTCGACGGGAAACAGGCCCGCCGCAC
CAACTCCTCGACGCCGCTGGGGGAGCTGTTCGACCACGGCCTGGACAGCTGGGCGTGCAT
CTTCTTCGTGGCCACCGTGTACTCCATATTTGGGCGCGGGGAGAGCGGCGTGGGCGTGGT
CACGCTCTACTACATCCTGTGGGTGGTGCTGTTCTCCTTCATCCTGTCCCACTGGGAGAA
ATACAACACGGGCATCTTGTTTTTGCCCTGGGGCTACGACATCAGCCAAGTGGTGAGGAC
GCCCCCCCCCGCCCACACACACACATATCATATGTAGTGATTTTGGTTTCAGTATGCTGG
GCTCACAAAACATTATTGTTTATTTTTGTCCCGTCTCCTTCTAGACGATCTCCCTTGTTT
ACTTGGTGACTGCTGTGGTGGGAGTGGAGACCTGGTACCAGCCAGTGATCTTTAACCTTC
TCTACAGGGACCTCTTCACCTTCATGATCATAGGTGGGCTCTGATTGGTCGCTTTAAAAT
GTTTTGCGTTTGTGTTTTTGCTCCGGCTGCTTTTAACATGAATTTCTGCTGGTTTCCAGG
CTGTTCGTTTACTGTGACGTTACCCATGAGCCTCTACAACGTCTTGAAGTGAGTATTTAT
GGAGGTGTTGCAAAAGGATTCATACTGCTTGAACCTTTTCACACCGTCTCACATTCCAAC
CACGAACGTCATCATATTTTATTGTAATTTTTAGGTAATCAACTAAGTAGCATGTAATTG
AGTAGGCCTGTCACGATAACAAATTTCACTGGAATTGTCAGCATTGCGATAAATGCTAAT
ATTTTTATTTTGTGACCATTTTCAAGTAATATTTTGATAATGGTATAATAATGCACGTTT
GCCTTCTTAAAGATGAATCAGACTTTCCTTTTCTGCATAACTTCACACTGGAAAAGGAAA
ACATTTTAAATATGTAAAATAGAACACAATAACCAAAAAGAGTGGGTAAAAGGGACATAA
AATCCACATGTTGCCAAAGTCATAAATAAAATGGGTCAGGAAGCTTTTGTACACAACCTT
AGTCAGAGTTGGTCCTACTTTCCCAGTTGATTTTTTTTCCAACTGGGAAGTCAGAATTTC
CCAGTTCAGAGTATGACTGGAACGCAGCATAAATGCAGTCCTGAACAAAAACCTGTCAGA
CGCTGGAAAAGACCCTTAAATATACAGCCAGAGCTAAAGCAGAATGGTTTATACCGAAGC
ACAGTAATGTGTTGGATTGGTCTAGTCAAAGTCTAGACCTCTAGACTTTGACTAGATTGA
GGTCTAGTCAAAGTCTAGACCTCAATCCACTAGATAATCTGTGGAGAATTGCAAAGAATT
GTCAGAACTTTCCAGCTGTCAAAAGCTGATAGAAACCTGCCCCCTCATGGCTTGCAGTGG
TAAAAAGTCGTCAAAAAGTGGTTCTGCAAAGTGTCGACTCAGGAGGCTGATTCCAAATGC
ACACCACACTTTTCAGGTTTCATTTGTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTGAAATATTCCAT
CTCCCAGTTGTGCGCTACTTTGTGCTCTGAAATGAAACCTTTGAATTCTGCGGTTGCCTT
GCTACGACGTGAAGACGTCTCGGCCTTGCGGATGTTTCAGGGCTTACAGGAGCAACACTC
TGAAGCACAGCAACCTGTACGAAGCCTTCCTGCCTTTCCTGTCCCCCGTCCTCCTCTTCG
TCTTGTCCACCGCCTGGGTCGTCTTCTCCCCGTCCAAGATCCTGGAGCTGCAGCCCAGGA
TGTACTGCCTCATGGTGGGGACGGCGTTCGCCAATGTCACAGTGAGTACCATGCGTAAGT
TGTTGGGGTTTTTTTTTTCCCCTCAAATTTCTCTGTTTAATCATGATTTTGCGTGTCCGT
TGTCCAGTGTAAGCTGATCGTGTGTCAGATGAGTAACACCCGCTGCGAGCCGCTGACCTG
GCTGCTGCTGCCGATGACGGTGGTGGTGGGCGGAGCCGTCACGAGGGTCTTCACCAACGA
GACGCTGCTGCTTTACTTATGGACGGCCGCGGTCATCCTCACGCACATACACTACGGCGT
ATCGGTGGTAAGAGCTCCCGCTCACATACTGATAACCGCATTTGTAGTGGTGGGATGAGA
GTCGAATCAAAGCAGATTAGATAAAAATGCTACGTTATTTCGTTATTCATTGTTGAGATG
AAGAAGTCTGGCATCGGGTTTGGAGCGACCGATCAACGTTTTTGCTCTGAATTAAATTGT
AATGGATTGATTTATTCATCTGATTCGTGGTCCATGTGGACATAAGAAAGATGAACAAAG
ACATTCTTAACTTGAAAATGGCTGAAATCCAAGATTTCCATCTTAGGTTGGCTGAAATCT
GTTGAAACCTTCGTCCATTTGACCAAGCAAGGTAGAAACCCGGCTTAAATGTGCATTTAT
GCCAGGTTTAATTGAATAGAATATTCAAATTTGAAATAAAATGAATGAAAAATGTTATGT
CTCCCCAGTGTTCATGGTATCAATACATTCTAACCGATTTGAGTTAAATTCATACTAATT
TACTTAAAAAGTAAGTAATAAGCGCCTGAACATAATTTAGAATGCAATATTTTTAACTTT
TAAAGTTTTGTAAATGGTTTTTTTTTGCAGATTTTGGACATAAAAGCAGATATTCGTGTT
TATTCATGTGGAAAGCTTGATAATCAGCCTGTTTCTCACTGGTTCACTGCAAAAAACACA
AAATCTTACCAAGCATTTTTAGTTTAGTAGCTTTTCAGCAAGACATAGGAGCTTGTGTTA
AGTCAATGACTCCATAATATTGTTGGAAAAATTACTAGTTGGAAGTGAAATAATCTGCCA
GTGGAATAAGATATTTTTTGCATGTCAAAGTTTCCCCCAGAAAACCTGCTAAGCCCAGTG
CCTGGGTCCCAGGGCAGTCATTCATCGTCTTTTTGAGTTAAAAAGTGTTTAAAGTTGACA
GGAAATTTGAAAATATCACCTGATAAATATGTGTTATTAAAAGATTGGAGGATTAATACC
AACCCTAAAGTTTTTTTTAAAAAAAAGAAACAATTTAAAAAATTGTTTAAATAAACAATG
CTTAGCCTGATGGGGGCACAAGTAAAGCCTGGTGGCCTGCCAGGCTTATAATACACTGGG
AGAAACCCTGCATATGATGAGTTAAAATGTGCTGTTCTACTGGCAGGTTATTTCAATTAT
AACTAGTACTTCTTTCATCAATGTAGTGCTGAAAAGTGACTTGTAAGTTAGTGTCGTCTT
ATTTCTAATGAAGTGACATATTTCCACTAGAAACGAGCAAGAATCCTTGGTGAGATTTAG
CAGTGTTGCAGCTTTGCAACATGTTTGAATTTGGAGTTTAACGTTTGTCGTTGTCATCGG
CAGGTGAAGCAGCTCAGCGACCATTTTAGCATCTTTGCCTTCTCGCTGAAGAAGCCCAGC
CGGGACTGACAGGAGGAGGAACGAATCGGCCTGACGGCGGCAGAGGTC
Chart Advanced