SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003267_2.0
Identity
TranscriptEukaryotic elongation factor (eEFSec)
SpeciesGekko japonicus (Gecko)
Transcript IDSPT00003267
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003145_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003267_2.0 # Transcript # Eukaryotic elongation factor (eEFSec) # Gecko (Gekko japonicus) # Full length # Forward
GTGACGAAGAAAGTCAAGTCCATGCAGATGTTCCATACTCCAGTGACATATGCCATGCAG
GGTGACAGGGTAGGCATCTGTGTCACCCAGTTTGATCCAAAGCTATTGGAACGTGGTCTC
ATATGTACACCTGAATCTCTTCAGACAATTCATGCTGCTATAATCTCTTTAAGCAAAATC
CCATATTTCCGAGGCACTCTTCAGACCAAAGCAAAGTTTCACATCACGGTTGGTCATGAA
ACTGTTATGGGAAGAGTAATGTTCTTCAGCCCGGCTCCAGATGACTTCAACAAAGAACCC
CTGGAGAACGATTTTGATTTTAAAAAAGAATATCTTTATCAAGAGGAGTATCTTTCCAAA
GACTCAAAACCGTCAGAGGAAAACAAGGAGAATGACCAAACTGGGGAAAGACAGCTCCCA
AAACAACAGTGGGCCTTACTGGAGTTTGAAAAACCAGTTACTTGTCCTAAGTTGTGTCTT
GTAATTGGTTCGAAGCTGGATACAGATATTCATGCAAACACATGCAGATTGGCATTTCAT
GGGATACTGCTGGAAGGGATGGAAGACAAAAATTATATAGAAACGTGTCTTCCAAAGCTG
AAAGTTTACAAGCTGAAACATAAGGATGGACAAGTAGAACGGGTAAGTTCATCCCGTAAG
GATGCTGAACTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCTTTAATAAGACAAAAGGAAGCTATGAGGG
GAACCTAAGAGAAGGGGGATTTAAGCAGTTCAACCAACGTTGGACCAGCTGTGATATAGG
AAGTACTTCCCTATACTGTAATCATGTGCTGTGGGCAGTGATTTTTGTATATGTGTATGG
ATGTTTAGTGAAAGTTTTCTTGTCCAGCACTCATGAGGAATGGGGTTGCTGGTTTCGTTG
CTCTGTCTTACCCAGAGCAATCTGGATCAGTCAAATCCTGCTCTATTGGGAGCATCTCAG
TGACAGTCTCCATGCCTAGCAGTACTGTTCCCCTGAGCCACAGAGCTGTCCTATGCAGCA
TGCATACAAGTGGGCCAGCTACCAAGGAGCCCTTGGGCAGAGCTGGCTCCCAAGAGCGCC
AGGCAGCCTGACCCAGCAAAGGTCAGAGATATAAAGCTGGTTGGCAGGAGAGGTGGTAGT
GGGGCATGCTTGCCTGAAGACAGAGGGGTATGGTGGCTGAAAGGGAGGAGCTTGTCACCT
TGGCAATGCCATTTAACTGAGCATTCTGGTTGATCAGGTGTTGAATGACAAAACTTTTAC
TGTATATAAGATTTTATTTGTATATATTATATACAGAAATATAGGATACAGCCACAGTTA
TGCCAAACAGATTGGTGTTTCCCACTTCACTGGCATCTGTATCAAGTGTGATAAATCTAG
ATTGCTTTCTTCTGTCTCCTTTCTTGCTCAGTTCAGGATCAGTATAAAACCATGATTTAT
TTTAACTGTTTGTGAAACCAGGATTTAGTTTGCAGATGATTGTTCAAATCCTGGATTGCC
TTGACAAATGCTGGCTTCATTGTCCTCACTCTTAACCCCACTTCCCCCGCAGAGCCTCAC
CTGGTTTCCCTGTCAGCATTGTGATAGACTTCATCACTGGGGAACAAGCCAGAATGAAGC
CAGAGTATCTACATTCATGCATCATGCAAACCATAGACCATCTGTAGTTAATAAATCAAC
TTCAAACCATGTAACTCTAGGCAATGCAACTCCAGGCAACCAAATTATGCATGATGATGA
CAGTTCAGTCCCTTAAATATGAAACTGCCCCTCCACAGAGATGGAAATGATCTGCTGGGT
GGATTGAGGGCTGCTGAGCCCTCTTGATACATAGAATCATAGAGTTGGAAGGGATCTTCA
GGGTCATCTAGTCTAACCCCCTGCACAATGCAGGAAATTCACAAATACCTCCCCCTCCAC
ACCCACAGTGACCACTGTTCCATGCCCAGAAGATGACAAAAAAACCCCTCCAGGATCCCT
GGTCAAACTGGCCTGAAGAAAAATTGCTTCCTGACCCCAAAGTGGCAATCAGCATTTCCC
TGGGCTTGTAAGAAAAAGCCACAAGAACTAAGCACTGAGGCGACCCTTCCTGCCCTCCCT
CTCATGAACTGCCTACGTTCACACAATCAGCATTGCTGTCAGATGGCCATCTAGCCTCTG
TTTGAAAACCTCCAAAGAAGAAGAACCCACCACCTCCCAAGGAAGCCTGTTCCACTGAGG
AGCTGCTCTGTCAGGAAGTTCTTCCTAATGTTTAGCTGAAAACTCTTCTGATTTAATTTC
AACCCGTTGGTTCTGGTCTGCCCTTCTGGGGCAATAGAAAACAACTCCATACCATCCTCT
ATATGACAGCCCTTCAAGTACTTGAAGATGGTTATCATATCACCTCTCAGTCGACTCCTC
TCCAGTCTAAACATACCCAGCTTTTTCAACCTTTCCTCATAGGACTTGGTCTCCAGACCC
CTCACCATCTTAGTTTCCCTCTTCTGGACACATTCCAGTTTGTCTGTATCTTTAAATTGT
GGTGCCCCAAACTGAACACGATACTCTAGGTGAGGTTTAACCAGAGCAGAGTAAAGTGGT
ACCATTGCTTCGCGTGATCTGGACACTGTACTTCTGTTGATACAGCCCAAAATCGCATTT
GCCTTTTTAGCTACTGTATGGTCTACGAAGACCCCCAGATTCTTTTCGCACATACTACTG
CCAAGACAAGTCTTCCCTTTCCTATAATTATGCATTTGATTTTTCTTACCTAAATGCAGA
ACTTTACATTTATCCCCATTGAAATTCATTTTATTTGTTTTAGCCTGTTTTCCAGCCTGT
CAAGATCATCCTGTATCCTGACTCTGTCTTCTACCATATTTCTTTCCCTCTCAATTTAGT
ATTATCTGCAGATTTAATAAGCATTTCCTCTATCCTTTCATCCAAATCCTTGATAAAGAT
GTTGAACAAAACAGGTCCCAGGACAGATCCTTGAGGCACTCCACTTGTCACCCCTCTCCA
AGAAGATGAGGAACCATTAACAAGCAGTCTTTGGGTGCAATCTGTCAACCAGTTACAAAT
CCACCTAACAGTCATAGGATCCAAACCCCTTTTTCCCAATTTGTCAATAAGAATATTATG
TGGAACCTTATCAAAAACCTTATTGAAATCAAGATAAACCATTCCCCTGATCCAGCAGGT
TAGTCTGGCATGACTTGTTCTTGAGAAACCCATGCTGGTTCTTAGTAGTCACAGCCATCC
TTTCTAAATGCTCGACTGTCTTTTTTTAAATTATTATTATTATTTATTAGATTTTTATCC
TGCCCTCCCGCCGAAGCCCGCTCAGGGTGGCTTACAACATTAAAACCAGTAAAACGATAC
ATCTAAAACAGTCTATAACAATAACAGTAAAATCACAATTTTACACACAGTACAACATAA
GCATGGCGGCGAACCATAAAGTGCTATCATGATTGGTCTGGGGTATTAAATGCTGCAAGT
AGTTGGGCGCACAGTTGAGATCAATCTGTCAACCTCCTCTAGGCCGAGAGGGCTGAAACA
ATCCAGAATGGGACCAGAAGACGTGCTAGGAGCCTTGAGTTTACATACTGTCTCAAATGT
GACCGGAAGGTCACGACGGAGCGACAAGACTTTATCTGCAAAATGTCTCGCAAATGCCTC
ACAGCCAATGTCCAATTCCTTAACATTTTGTCTGCTCTGTGGTAGAGTAGTTAGTGACCG
AATCGTTCTAAATAATTGTGCTGGGCGCGAGGTTGCAGATGCAATCTCAGCCGCGTAGAA
TTCCTTCTTTGCGACTTTGACTGCCATCTCATACGACTTCATAAACATTTGATAGGATGC
TCTTGACGCTTCATCACGGGCTCGCCACCACTGTCTCTCTAGTCATCTAAGCCCTCGCTT
CATCAGCCATAGCCCCGGGTTATACCAGGGCGACAGCCTAGATCGAGGACGCAAAGGACG
TCTAGGTGCGATCTCCTCGATGGCTGTAGAGAGTCGGTCGTTCCAACTCCCCACTAGCTC
ATCTAACGAGTCACCGGGGGGCAGTGTATCCCGGAGAGCCATCTGAAACCATCTGAAACC
ACTCAGGGTCCAGGGTTGGGGTGACACGTTTACTCGGGTTCTCAGGGCGTAGTGGTCCGA
CCATGGAACTGCCGAAGCAGTAATCCGGTCCACTGTAATCCCCGCCGTGAAGATCAAATC
GAGCGTGTGACCGGCTTGATGCGCAGGAACTGTTACACATTGGGAGAATCCCAGCACCGC
CATGGATGAGGCCAGGTCCAATGATCGGGTGGAGGTCGCGTCATCAGCATGGACATTGAA
GTCCCCCAAAACCAACAGCCTGGGGTGCTCCAGCGCCCAGCCCGACACGGCCTCCACCAG
AGATGGCAGGCTGCTTGCCGGTGCGTTGGGCGGAGGGTACACTAGCCAGACAGCCAAACT
CTCCCCAGCTTCCCACACAAAGCCAGTACACTCAATGCCCGAGATCCTCGCGTCCGGGAG
GGCCCTGAAGGAGTAAGCCTCCCGAACGAACAAAGCCACTCCCCCCCCGCCCCTTTGTCC
GGGATTGGTGGAGGACTGAGAAACCTGGGGGAGCCATCTGGGAAAGCGCTACTGTCTCCC
CATCTCGCACCCAGGTCTCGGTCATGCACGCCAGGTCCACGTCCTGATCCATGATGAAAT
TTTGGAGAACAGAGGTCTTATTATTTATGGACCTGGCATTACACAGCACCCATGTCGGAG
AGGGGTTCTTCTCCACTGCCCCACTACCTGTCACCCATCTGGGAAAGCGCTACTGTCTCC
CCATCTCGCACCCAGGTCTCGGTCATGCACGCCAGGTCCACGTCCTGATCCATGATGAAA
TTTTGGAGAACAGAGGTCTTATTATTTATGGACCTGGCATTACACAGCACCCATGTCGGA
GAGGGGTTCTTCTCCACTGCCCCCACTACCTGTCACTACCTGCCCCACTACCTGTCACAG
GCTGGAAGGGTTTGCTCTAAAACTTTCCCAGGTATAGATGTCAAGCTGACAGGTTGGTAG
TTACCTGGATCCTCCTTTTTCCTCTCCTTGAAGATGGGGACAACATTTGCCTGCCTCCGA
TCTTCTGGCACTTTACCTGTTCTCCAAGAATTCTCAAAAATAATGGACAGAGGCTCAGAA
ATTACATCTGCAAGTTCTTTTAGTGCCCTTGGATTTATTTATTTATTTATTTATTATTTA
TTTATTTAGTAGTATTTTTACCCCGCCCTCCTCGCGAGCGGCTGAGGGCGGCTTACAAGG
GCAACAATGCAGCTCATCTGGCCCCAGTTAAAGAAACTAGGTATTTATGTACTACCCCTA
TGCCGATCCCAGGCTGCAACTGTTCACCTAAGTTTCATTTATTGCTGCTTCAATAATATA
GTTTGTATACTACATTTGTTTGTTGAGGCAGTTTTATATGCTTGCTTTAACATGTTTCCA
GCAGTTTCCCATGTTCTGCATTTTCTAAACATTTCAGGTTCAAAATAGTATGAGCATAGA
TCACCATGTGTTATGGTTTCTGCAAACATTCAGTTTCTCTTTTTTTCAGTGCTTCTTGTC
ACTGAGGTATTACCAAGGTCTGTCAGAATTTCTTGTTGGGCCTATTACTGCTAATGTTCT
GCTAATGTTGCTTGTGAGGTGCAAAATTGATGAAAATGCTCTTCCTTGGTTTTCTTTTCC
CATTTAAATTCTGATACATAAGCGGCCACATGAACATTCTGGTTGGTGCGCGGTGTCAGC
ATTTGGCACTGAGCTGAGCTTCCTTGCAGAACCTGCTTTTACCACAATTAATGTTCCATC
TGCTTTGAAGTCAGAACATAGGTTTGCTTGGTTGTGCTTGGCTGCTAATGGCATGCTAAA
TGTGATAATAACACAAGCAATGAGGGCACTCGATGAATAAAAAGGCACAATGCTTTCCCA
GGTTAAAATCCACATTAAAATAGGAGCCCAAGAGATGTATTTATTTTTTGGCTGCTGTTC
TGTTTGCAATTGAGCAATTTTGTAAAGCTTAGGAATGTGGAGATAATGGCATTCTTATTT
GAAATACCATTCCTGTTTAAAACTATGGAAGATGAAAAGTTAGTGGCAGAAAAGTGAAGG
TTATGGTAATTGACAAAATGTGGATCAACCTGGCTTTGGTTAATTAGTCACAAAATTTAC
CATTGAAGGCAGCCATAAGGAAAGAATTAATATTTTATTTTTTAAATAACAATAAAATTA
CTTGCTTTGGCTGACTAGACACAGTTTGGCAGTGCTTGTGGGTAGAAATTGCCTATAACC
TTTTTTATGGATATTATTGGATTAAGCTGTACAATGAAGCAAAGTTTTCACTTGCACAGG
GATGCTTGTTAATAATTTTTCTCAAGTTCTGTAGGAGTCATTTAGTGAGTATCTGCCTTG
TTATTAATAAAAGTGCTTATAAGATTATTTACTTATAAGAAAATGAAGGAAACATAGAAG
TAGGTTTATGTGATCAGATTTGAAAATAGAATCTGGACCACACTGGGATCATACATATAA
TTGAAAGGGCATTTTTTGGCTATCTACTACAACCCCATGTTTATTGCATGGAATCCAAAC
TTACAGCATCCCTGATAGATGTCTGTCCCACCTGGTTCCATTGTTGAACTGCTCTTACCA
TTAGGAAGTTTCTCCTAATCTTCTACTGATATCTGCCCTTCTGTAACTGACTCCCATTAG
ATCTAGACTTGCCTTTGGGAGATGCAGAGAATAAGTCTTTGCCATTTGCTTTGTGTTTTT
CTATAGTTAAAGTTTTTGATCCATCAGTCCATGGGTGCAAGGACTGCAGATCTTTGTTTG
CTCTCCTCTCCCCACAGCCCTGGGAAAGTTGATTCCCAGAGTCATGGGACATACATAGAC
TAACAGCCACAAAGGTCAGGAAGCTGGCCTGAGCTATGCTGAAGGAAGAGAAAAGAAAGG
ACAGCTTTCTCCCCTTCCACAATAATCTGTAACTTCAGCCTGCCAAGTCTGGCTGATAGT
GTGCCACAAGCAGAGTGCAGGTGTACTACAGTGCCTAACAAATTATTGTAATTTGTTTTT
CTCAGAGGTGTTGGAAAGATTATCTTTTAATGACTTTACTGTCTGAATTGTTCCCTGAAT
TGTTCTGGTGCATCTAAGTTGGAGCATCTTATTAATTTCTGCTCTGTCTTGCGGCTCCCT
ATGATCTAGGTCATTTACAGTACAGTCCTTTGCAGAGTTACTCTAATCTAACCCATCTGA
AATCAGGATTACTCTGCAGATTCTTCCCCTAGTCAGTTACTGAACTACCCAATTTTTGGG
ATCCTCTGCAACCCTATAGCTCTGCTGAAAATTCATGTAAAAACCCATGGTTTCCTTAAA
CTAACTGTGGTTACTGTGATTGAACATAGACCACTCCCCTAACTATGATGTGTTAAGGTT
TATCAAACCAAGTTCTAAAACCTTGGTTTGGAGTTGGTTTATTAAGTACAATTGTTTTAA
CTGTTGTTTCACATGCTATGCAAATGCGGACAGCCAGGCTTGTCCCCCAGCACTGTGGTC
ACCACAGTGGAGGTAGGGGTACCTCTTGGGTCTATGTTTTGGAAAGAACAAGACCAACAT
TTTTTTAAGCAAACCAGGGCTTGAGTGCCGATGATATGGTTCTTCTTTCTAGAATCCCTG
TGAGGCTTAGAAGAGTTTGATTACCTTTAGCCTGTATTGTAATGAGAATCAACTTGAGAT
CAATTATCAATGAACTAAAATCATATCCTTTGGCAGTAGAGTAAAAAATAGTATTTGGAG
CATCAATGACCACAGGGTGGAACAGGTGGGAAGCGTTAGGTATTTAGGGGTGATATTACT
CTCGTCAAGGACTAGGAAAGCTCATCATGATTTTGTGGCTGATATTGGACAAAAAGCAGC
TCAGGCCATTCAAAAAAATTTAACCCAAAAGGAAGGCAATACATTCCTGTGGCACTTAAG
CTCTTTCAGGCTAAAACTATAACCCAGCTGTCATATGAAACAGTAATAGGCCCACCATCT
TCCTCCTTTATCTCGCTAGAGAGAGTTCAATCAAAAAAATTAAGAGTGATGTTTAGATTG
CCAGTTGTGTTTCTAACACAAACTTGCGCCTAGAATCTGGATTGATCAAAATAGAGGCTA
GAGTAAATCTTGCCTCTATTATACTATGGCTCAAGTTAAACTATCTTCCCCAAGGATTAA
CACTGATGATCCTCTGGGACTGTTTTCGATCTCCCTGGTTAACGGCGGTCCACCACAAAT
GTTAGACTTGTCCACTCAGACCCTCCTGGTAATGGGACTGGACCAGGTGAAAGCACTGGT
AAAACAAAGAGTGTTTGACATTGAGTGCCAGAATGTTATTAATAGTGCTCCAGGTTTTTT
TGGCACTGGAGAATACTAGATATGTTGTAGTACCAGCTGCTTATTTATCATCATTCGAGA
TACCATCCCATCGCAGGACTTTCTCTCTAGCTTGATGGGGAGCACTCCCCTCTGCAGTGG
TCGAGGGAGATATAGAAAGACCCCTACGCTTGAGAGGGTTTGCCCATGTGGAGCTGGTAT
GGTTGAATCTATTGAACATGTCTTGTTTCAGTGTTGTTTCTACCAGGAAATTCATGCAAA
GTTCATATTTCCATTCCTTAGAAAGCCACTGGACTGCCTTGTTTCTGAGATCACTGGGAA
GCTCCTTACAGACATGAATCCACAAATTACAGCTTCCTGAGCAAGGTTTTTTGTGGGTGC
TGGCAAAATTCCCAAAGTTATCTTACGCAGTGGTTCTTAAATTTAACATAATGTTTAATT
TGTGATATTTTTAATCAAATCTAAATTTTATTTTCTACTATATGGGTATTCTTCTATTTA
ACTTTATTACTCATGACTGTGTATATATGATTTATGCTGGTCTTTGACCGTATTGGGGAG
CTGCAGTGGCTCAAGTGGTTAAGACGCTGAACTGCAGGCTGGAAGGTCAGTAGTTCAGCA
GTTTGAGACCCGAGTGCCGCATGACGGAGTAAGCTCCCATCTCTGGCCCCAGCTCTTGCC
AACCTAGCAGTTCGAAAGCAAGAAATTGCAAGTAGATAAATAGGTACTGCTTCAGTGGGA
AGGTAACAGTGTTCCATGTGCTTTGGCGTTTAGTCATGCTGGCCACATGACCACGGAAAT
GTCTTCGGACAGCACTGGCTTTTCGGCTTTGAAACGGAGATGAGCACCGCAACACTAGAG
TCAAATTCGACTGGCTTTCTAGCAAGGGAAACCTTTACCTTTACCTTGACCGTATTAATA
AGTCTGAACCTGAGTGATTGTCTGCAAGCGAACTCCTGATTTCTCAAGCTAGGCATGGTT
AGAATAAACCTATAAATCCAAACTCTGAAAGAAAAATAATGCTATGTTATTACTACACAA
AATACTGATTGCGCACGTAGCTAGTTATAAGAATGATCTTATGCTTTTGTAAAATCTTCA
AATCAGTTGCTTAGAAGCCAGAGGACAAAATTTGAGCTTCATTTGGATTCAAGAATTTTG
ACCAAAGCTCAGTTGGGGGAAAAAGAAAACTATGTAATGTAACTTTATTTTTGCTGTTTC
ATGAGAAATGATAACCCCTGAAGAAAGAACATTTGAATATTTGTTCATTTTGCTGGATCC
CCCCCCCCCAAAAGCCCAACTGAACTAAAATCATGTCTTGTGAATCAAAGGGATCATGGG
AAAAGAAGCAATAGGATTACAGACAGAAGTCACTAGTATATATTAGAGAACTCACGTTCT
ATGGAGAAGATAAGGATAAATGGATTTCTTCCAGTCCATGGGCTCATTGTGCCCCATGTT
TTCTTCTGCCTACATTCCAGTTTAACTTGGAGGGTTTCTAAAATTATTTTCAGAAGTGAC
ACATTTGCCACAGTTCTCAGTTCACATCTTTCTCCCCCTCCCTCAGGTA
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