SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003270_2.0
Identity
TranscriptIodothyronine deiodinase (DI)
SpeciesMus spretus (Western wild mouse)
Transcript IDSPT00003270
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003148_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003270_2.0 # Transcript # Iodothyronine deiodinase  (DI) # Western wild mouse (Mus spretus) # Full length # Forward
ATGGGACTCCTCAGCGTAGACTTGCTGATCACCCTGCAGATCCTGCCAGTCTTTTTCTCC
AACTGCCTCTTCCTGGCGCTCTATGACTCGGTCATTCTGCTCAAGCACGTGGCGCTGCTT
CTGAGCCGCTCCAAGTCCACTCGCGGAGAGTGGAGGCGCATGCTGACCTCAGAAGGGCTG
CGCTGTGTCTGGAACAGCTTCCTCCTAGATGCCTACAAACAGGTGAGCTGCAGCCACTGA
GCTTCTCCTGGGTCGCAAGGGCTAGGGGTGTGGAAGGTGTGGGGCTGCTGGCTCTGGGGA
GTCCTACTTGGGGTGTCCTCTCCAGTGACTATGTTCCACGGAGTCTCAGTGCCACTTGGG
ACACCTGTTGCACAGGTTAGATTTGGGAGTGACAGACACGGAGCCACCGGGACTCTTGGT
GACTTCAGTAGGAGTCTTTAATGAGGGCTGCTGTTACTTTGCACTGAATTGACAGTTGAA
GGGGTTTAAGCTGGTATAAAATAACTGTAGGTAAAATCAGAGTTCTGGGAGGGGGGCTTG
GAACTTGCTGTATTTGTTCTGCCCTTGATATGAGCTGGTTTCTGCTGCTTTGCTTTACAG
GGGGCTGTGTGATATGTAGGAGAAGGTTTGAATAGTGTTTTCTTTCTGCTGAAATGGTCA
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GACCTCACTCTAGCCCCTCCATTTCTTAGGGAGTTAAGAACAAATGAAAGCAAGCTGAGC
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GAAAGATCTAGGGATAGGTTGTCAGAAACCCAGACTTGGTGTGTGAGACCGAATCTACAA
ATAAATTCCCATACAAAGAAGTGATGGGTCTATAATGCATTCCTATGTCAGGCCTTGGAC
ATTAGAGAGGTGACCTCCCTTACCTGGGGACAGTGTATTCCCATCAGCTTTTGAAACACT
GGGATGAGTGATTGATGCATGGATGCGAAAACTTCCGGTATTCCAGCCTTTCTGCTGCCA
GGACATGTTTAGAGGAACATTTTCAAACCATATCAGTCAGGGTAAAGTGGGATGAATACT
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TCATGTGGACGAAATAAGTTTCTATAAAAAGAGGAAATGTGTTCCTAGCAGCACTGAAAG
AGCTTGTCAGAGAAGGGAGTGTGGAGGAGGAGCGAAGCCAGACGTTCAATCGAGTGCTGC
TCTTGGGGCAGGTGGAAGGGTGAGCATCATGATGGGAACTCCGAACAGCAGACGAGGAAG
GGAAGGAGTCCTTCCCCAGTAAACAGTGGAAAAAATAAATCCAGGTGCAGGGGGCGGGGA
GATGGGGAGGGATAAAGAATCGGGGCAGGGTGTTTCACTGGAAAGCAAATGTTGAGGAAG
AAAAGTATGGTTTTCTTCAGGGACTAACGTGTGATTCCTGGCATTATTGCAAAGAACCTA
AAGAAGGGCCTGTCATGCTCTGCGGAGGGAGCATAGAATGACAAGTCAAGCCTCCTCTTA
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TTTAGCTGCATATTAAAATATTATTGATTTGTCAATCCCCTCAAGCATATCTATGTCTTA
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AAGTCCAGAATATAAATATTATCTCCACATCAACTTTGTAGGCTACCAAAGCCCCCATAA
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AGCAAATGCCTCTATAATAAACTTTGTTAGATCTTTTTTCACTAATGTATAGTGTTCCAT
TGTGTTGTCATATGTTGTTATTTGTGTTCATGGGGATTGAGTGGTTTGCTTTGACTTTTG
GCATATGGTTTGTGTATTCCTCTTTTCTAGTTCTTTGTCTCTGCCCACTGATTTGATTAG
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AATAGCTACTATGTGCAAAAGAAACCTCAGGAAAACAAGAACAAGGATGGGCTGGGTGTG
AGATGTAGGGAGACATCAAGAGTACAATGTGAGCTAAATTCTGTCCTCTTCTCTCTCTGA
GTTCGTTAGGCATCATGGTGGAGGTGGTAGTCTTAGAATCTCACCCAGAGCCTCTCAAAA
AGGTCAAGTCATTTGCCAAATGCTGTGTCGGTCATGACACACTGCCTTTAGGTGTGACTG
TTTCCAGAGATGCCAGAGGCGGTCCTGTCTGACACTGCATCTTGGGATTTCACAATCTTG
ACTTGCATTATTGGGCAACTGCAACTCTCAAAGCAGATTTGTCCAGGATGGGGAGGTGTG
TCTAACATGGGTTTCAAACAGACACATCATTCAGTTCTCCCAACTGTCTTGCTTAGTGAG
TGTCAGCTATTGTATGTGGGGTGATGTTTAGAGACGCTGTATTTATCCACAGAGGAGGGG
ACATAGGCCAGAGCTGGAGTGATGGGAAGAAAGAAGAACAGAATGAAATATTGCTAATAG
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TTGCATGTCAATGGTCAGGAGGTCTGTGTGCATTCTGGACTGAAAGAGAAATCTAGAAAC
TGGTAATAGGGCTGGAACTAATAACTGTTTGTTATTTAAGCTTCCTTAGTATCGTTGCTT
TTGAACACAGTACCCTTATATGGGTACTCAAAGACTCAGAAATGCAACCAGTAAGCCAGT
TGACCTCTCTGGGAGCCTGGCTCCTAAATGAAGTGTAAAAGTAAGCAGACAGTATAGACA
CTGGCAAGCAGGCTCGTTTCTGCATAGCCAATCTTTCAGTGGCACAGAAAACCATGCTCA
TGGGAACATACAATTTTGGTTTTGAAAGGGTCTCTTTAACACTCTCCTCCTCTTTATTCA
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GGCCACAGCCAGAGCCTGCCTGTCACTTGGATAAAACATAGTGAAATGATAGGGCTTTGA
GCTTCATTTTCAAGGTACAAGTCAAAAAAAGAAGAATAACCAAAAAAAGGGAACTTAACC
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GATGGCTGAAGCTCTGCCTAATGATTGCTTGGCCATGTTTCTAAGGGCATCCGTGTAGCC
TGATCATTACGTTAAAGAATTGGAAACTTCCTGAGAGTTAATAAGGCCATTTCCAGAGCT
TTCAATGACGAGAAGTTTGTGTAAATATTCTGCTACATGCCCACCCCCCATTCCTATCAT
CTGTTTCCCTTCTTGTCATAAGAGTGCGTGATATGATACTCCAAAACTCCTCTTAGGCTG
TGGAAAGGAAAAACAAAAACAAGGTTAGCGGTATATACTATATTTCCAGTTCACTTGATG
AATTGTCCCGTATTTCCCTTGGGTCTGCATCCTCATCTTCCAACAGTAACCTTTTTCCCG
GGTACTTAACACTGTCCCTAAAATGGACCCATCAAAGAAATCAAACTCTTGTATATTTTA
TGCATTTGTGCTTTTTCTCTCATTTATAAGCATTTCTGCTGTGACCTTTGAACTTGGCCC
AGAGATGCCATCAGCAGTAAACTTGCAAAAGCCTTCCTCACTCCCTCAGTTGGCATTGTG
TTCCCGTCCACTGGGGGGAAAAATATATAAGAAAGGATGACCGTAATAGTGCAGATGAGA
GCGATGAAGGTCACTGGTGACGCTATCACATTTTACGTGTGTCCTTTCTGATCCTTGCAA
AATAAAAAGACCCTTTGGGAACATCGGAACTTCAGGACCAATTAGTGGAAATGATGCTTC
TTCTGTTTGGGCATTAAATACTAGGCAGGATTCTCTTTAGGCAGCTGATGCTGGCAGGGA
AAGAGGTACCGACCTAATTACTCTTCCGCAAGAGCAAAAAAATGCCTTTTGAAAGCCTCT
TTGGCAAATATGTCTCATTAAGGACAAAAACCAAACACAAACCCTCTAAGAAGCAGAAAT
TAAGATGATAGGTAACTTGTGGCCAGGAGACTTTCTGTGCCACTGTGGGAAATTAAAACA
AAGTTTGAGGAGTACCAGGGGGTGACTTGTTTTTGTTGAGTGTCTTTCCTGTAGCCCCAA
TGTTATTATGGGGCCAACTTTATTTTCTTCATTATTTTGGCTCGGTGTCAGGGAATACTT
TGCTCCTGTCTTCCACAGTGAAGACAGTGGGGTTTCTCCCATTCCATCTCAGCAGGGTTT
TCTAACCAAGCAAATCAAAAAAATTCTTCATTGGGAATTCTAATCTAATGGAAATTTCAT
TTTCGTAGCGACTGGCCAGAGAATGGTAAAGAACAGAAATGGGTTTTAAACGTTTTTTTC
TTTTTAAGATTGTCTATTTATTTTTAAATTTTAGCCAACTTATCACTTATCAGGTTTTAG
AAAAGATAGTGGATTTATGATTAGTTTTATGAAGCTTATAAAGTTTGGCTGCTGGTTTAC
TAACTCTTGGGCTTACACATCATAGGTGTGAGTCCCTCTCTGTCTCTGTCTGTCTGTCTG
TCTGTCTATCTGTCTGTCTGTGTATGTGTTTGTGTCTGTCTGTCTCTCTATCTGTGTGTG
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTATTTTGTTGTGCTGGGACTCCAACC
CATGGATTTATGGATACTAGCCAAGTGCCCAGCACATGTAATTTTACTAATAGCATTATT
TTTGCCTGTATTTTCTCTGTGACCTTCACGCACAAGGTAGTCATATATGACTTCTTAGTG
TTCACGGGGATTCCACAGATGCAGAGCAAAGAGAAGAAGATTGATCGCATTTCTCTTATT
TTCTGGTTAGCTGAAATGATTAAGAATAGGTAAATGACATTGGGTGTTGACAACAGCATG
TCTCTGGAGAAGGGCAAGTTTTCCTATTTCTGAATATGTATGCTTTAGTGAGTTTGCCCA
TCACCTGACTATGACTTCGTTCACTGCAGTTCAAGGTTGCTATTCAGTTTAAAAGTCTTA
TTTGACCCAAGATGATATCAACAGGCATTTATTCAGCAATTCACTCAGCAAAGCTCTTAA
AATGTATATTTCACAGACTAACAGGATGCTAACTCCTCCACCACCAGGAAATGAATTTGT
CAACTTCCTCAAGTTTTAAATTTAGAGTGACAGTGGGTGGGACTTGTCCTACATTTCCCA
AGGTAATCTAGAATCTAAAATTTCATTGTTTGGCCAAGAGTTGTGTGGCAGAACTGTCCA
TTGTCTCTAAGAAGTCACACACACTTAAACATTCTAAGGAAATGAACTGCAGGTAACAAG
AGATCACCTGTGACCAAAACATCAGGTTGGATTGTTCAGATGGATAGTTAAGAACAACAC
AAGGATCAAAGGGTCTGCGTGTGTGAGAACCAGGGAGACGCTAGCCTGTTCATCAAGACC
ACACAGTCGTTTAAAGGGATGGCTCCAAAGTAATGATGGCTCCAAATTGCAGGGGACTAT
TTCACTGGGATGCAGTGCAGAGACTAATTTCCCTCTGTGTAGGGGTGTGTGACCTCACAA
GAAGTCTCTATAACACACTCCTCAGAACACATCCAGACCTTCTTATATCTGGTTGTCGAG
GAACACTGCTCGGCGAATATTATTCAAAGCAGTCCTGGAGACACTGTGCTATGCAAAGGG
GAGTCAGATCCTGATCTGAGAGGTGTGTCAAGAGACCCCAAGACTTTAAAGCTCATCACG
TGCTTCAAATATATGTCTTTAAGCTTAAGGTGTACTTTAGTGCTTCAAAGATGAGTAGGA
TTAACAATGAGATCACCTGGTCATAGGCAAATTATGAGATTTCTCTATTTAATGTTGATT
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AATATACTATTTAAATAAAATCCAAGTTTATGATTTTAAAATTACTTTTGGACAATGAAT
AGTACCTATTTCACACCTGCCCTGCAAAAAGTTTTGAGAAAGAAGGAACTTTGATTCTTT
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ACATCCGTGCTCCCACTGCTCTCCTGTGATTCACTTTTAAGTGGCTTCAATTAACAGCAG
TTTTATATGTGACTATTTATATGAGAGAAGAAAGTCAATCCAGTTGGAAGAGTTTTGTAA
TATTAAGGATAGTGTATAAAAATCAATTGAACTGTTGTAAGCTGTCCCTAATGGTATTAG
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CTCTTTTCTGTTGCCTGCTTTTTATTATCAGTTTACAGATCCAAAGGCCACTAACTTTTC
AGAATTCTACGATCAACTATGTAAACCATGTGCTGCGGGGGAGCATGGAACAATTTAAGT
CAACATGCCTCGTATTTGAATACTTACTATTCTGTTAATCACTTATCCTATGGCAAAAAT
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GTGAAAAATTTCTTATTTGACTCTCAAAGGCAGATTTGAGGTTCCAGCCATAGTGTGTAT
GTATAATGTAAGCAGTGGTCACAGGAACCTGCAGAGGTCGCACCCTGTAGAAGGGAGCAT
AAATCTCTTCACAGAACAACTCGCTCATTTTTATTTTCTAATCTTGAGCATGGGATGTCT
CAAGAGGAGTAGCAGTGTGTCTCATATGATGGGGTAATGTCTGACAATGGCGGCTCGTAT
CTACACACCGTCAGATGTAGAGTTCCTATTCTCATCCCACTCTCCAGATCCACATAAGGA
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GAATCACACTTACAAAGGATGGATTAGAGAATGTCCAGCTCTGCCCAGACACAGAACCCA
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GGTAATGCTTGCTGCCAAGTCTGATGAGCTGAGTTTGAATTTCAAGGAGCCACATGGTGG
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TCTTTTAGAATTCAGAAGGAGACATTCTATTTCAAAACCAAGATAATTTGTCTTAAAGTG
AACCATTTACTTTTAACTTTTAAAACGAACTCAATTAATCATTCATTCTATAATGCTTGC
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ATGCCACCTTCTTGACTTTGCCAGTGCAGAGCGCCCACTGGTGGTCAACTTTGGTTCAGC
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CTCGGTGGCTGACTTCCTGTTGGTATACATTGATGAGGCTCACCCTTCGGATGGCTGGGC
AGTGCCTGGGGACTCCTCTCTGTCTTTTGAGGTTAAGAAGCACCGGAACCAAGAGGACCG
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CACCTGTCAGAAGACCTTGAACCTCTTAACATCTCAATACTTTCTCTAGTACACAAATGA
CATCTGGCTAAATAGCAGCCCTTTTACCTCCCTTCTGAGCGAATTGATCCAAACTGGAGT
GCAAGAAACCCTGTTGCAGCCTGTATTCATTCTTGCTTGCGAAAGAAGTGATTCTGTCCT
GCGTGTGCTCTGGGACCAGAGGACCATAAATTCTCAGAATACTTATTGTTAAGGGAGCTA
CTACCTATGATCTGATTAAGTGTATTGTCTCAGCTTTAGTCACCAGAAACAAACCCAAAT
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AATGTGGAGAGAAGTACTTTATGGGACTAATTGAGATATACCCATTTCAGTGGATAATAT
CCGTTCAGAGAAAACTCCAGGGGGTCTGGTGCTGATGTGTTGTTCCTGCCAAATTCCTAC
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AATCTCTAGCTATAGTTTTGAGGGCTTACACAAGCTTATTCTTGGTACCACAGGAATTTG
GTTAAATGGAATTTCCTTTGACATTTGAATTTGGACTTGGTTCTTTTTTGTTCAACTGGG
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TGTATTGTAATTATTTTTTAAACTCAAAGACATTAAGATCTCAACATATGGTTATAGTTA
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GGAAAATAGGAAGTGGGTATGCATAAAACAAGAGTCTTGTTTTTAAAAATGGGAGCAAGA
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TTTTTGGCAGCATCTAAGTTCTCCAGTGTTTTAAATTCTGTAAAAGACACACCCACAAGG
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AGATCGATTACTTCAGACTCTTCAGATGTCAAGGCCTTCACTTGAGGCTTATGAGCGATC
CCTCACTCATCTTCATCTTCAAAATGCTGTTGCGATTGATGTGGCTCCCTAAAGAAGTAA
AATGGAAAATTGGCTGCCCCACACCCACACCGTCGTCGGCGAATGACCCCTTTGGTTTCC
ATGTGTGATAGCGAAGCAGAAAGTCAGAGAGTGGGTGGGGGGATGAGTTTTGGCTAATGC
CATGCTAGTTGTCTGGGGAAAAGGGATAATGGGGAAAAAAAATCACCCAGTTGTGCTACA
TTTTTAAAGAAAGAGAAGGTTGTATGCGTGTACCATTTGCCTTTTGGAGAATAGGCCAAT
GGAGGAAGGAAGAAGAGGAAGCAACTATACAAAGATCTAGGCTGACTGTCAGGAACGCAG
ACGTGTTCAATAGAGCATGTCCAAAACACTGGAAGAAAAACCCTTGAAGGGTCCAGGAAG
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TGATAAGCCTGTAATTGTATAACCTATTTATCTCAATGCAAACTGCTATGAATTCCTACG
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AATGCTCAGCTACTGTGCTCACTCAGAGATACTATGAGGCTGTCAGTACCCACCTACCTA
ATATGCCTTTTATAATATATATTCCTCTGAAGAGTTATAGCTATAATTCTCCCAAGGAAA
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ACCTTTCTTAGAACATAAAGATTTCTCTCATAGGATATGTTTACATGGGGATATCAGTTT
ATGCTTTCAAACTCAATTGGCCTGTCTACTCTAAACTGAACTGGCCTGTCTACTATTAAA
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ATCTTAGACCTATTCAAAACTCTCTTTAGTTTGTTGATTAGAGGAAGTAACCTGGACAAT
GACTTCCTTGAATGAAGAGCCTGCCCAGCAAATGTAGACACACTTTGTACAAATTCAGTG
GACCTCTGTGGAGGCAAACTAGCCATTGGTGGTTCTAGCTCCTTATTGCCAAAGTGTCAA
TCATTTCACACACTTGTTAACTTCATTCATACTTTAAATCTCTGCTCCTGTGGCATTCAT
AGATTGTATCCCCTGATTTTTTGATAATATCAGCTTCTAAGTGGTCTATTAGGTTAGTTG
AATTCTTCTAATAATCAATAGACACTCGTTGATTCCCTTTGTGTGAATGTATTTGACTCT
TTGGGATTTTGAATAAAATTCATAAAATGTGGTGAGGTCACAGGTGGGGGCTGCCTCACA
CAAACTACTGGAGGGGAAGGTGGGGGGGGGGACAGTATTGATGCTATTCATAGAATTCTC
AGGTGGATACAAGCTGCCCTTGGCATGCCCTGTAGCTTCCATCCACAGCCAGAGGGATTT
GCTGATGTACCAGGCTTCTCATTATGTAAATCGTAAGAGGATCAACCTGGACATTAGTTC
CACCTGACCTCTGACTGATGGTTTGGAAAATAAGTTTAATTAGAATCCCTTGGCCACTGC
GGAGAGGAAAATTAGGCTGATTTCTGTCCCACTGAAGGATAAAGGAAGACTTAGGCCAGC
ACTTCCGCTTGTCAGAACATGTTCAATACCATCTCTTTTAGTGGAAATTGACTGGGAGTC
TTTAAATTCTAGGAGCTTTCTTTATGATATGGCTCCAAACCAGAACCCAAGTATATTTAG
ATATTCTCCAACTTCTACCATTGCCTTAAATGTAGAAGCCAAACCTGCTCTTTTTATGGA
CTTTCAGAATGGGCATAAAGAATCACTTGCTGTTAGGTTACAGTAGTGTCTTGGGACTGT
CCTGGGTCCCTTTAGGAAGGGAAGGATCTGCAGCTACGTGAGCTGGGAAAGCTGCTAACT
GGAAGGAATTAGTGCCCCCCCCCACACCCCCAGCCCCAAGGTCCGGGTTTATATATTTGA
AAAGATTTAAAACGAAACTTCTGATGCTCAGAGGAAGGCTGCCGAATGTCAACGAATGAC
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ACAAGGTCTCAGACTTAACAGACTCAGCTCTGTTCCAAGGTGAGTCTGAACCAGCAAAAA
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CTAGCAGATGTTTAATGAAGTCACTATTTTGGCTCAATCTGCCCTCCCCCATCTGTTTTG
AGAAAAAAAAATTTTGAACAGGTAAACATAAAAATGAAAGAGAGCCACAGAAGGGGATGG
GAAATAAAATTCTCTCAAGACTGCTCCAGAGCATGCCATGTGATTTTGATGTGTCAGGAG
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GGGTAGGGAATGTTGGCCAGTTTTGTTTAGTTTTTGGAACAGGTTTTTCGCCAGACTCAC
CAGCCCATGTAACCAGCACCGGAAAGAGGAAACCGAGATGTTCAGAGCTCACTGGTGTGC
GAATGATAACTACTGACGAAAGAGCTGTCTGCTCAGTCTGTGGTTGGATGTAGTCACACG
AGTC
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