SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003334_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein O (SelO)
SpeciesGekko japonicus (Gecko)
Transcript IDSPT00003334
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003212_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00003334_2.0 # Transcript # Selenoprotein O (SelO) # Gecko (Gekko japonicus) # Full length # Forward
ATGGGGGTGGCGGCGACGGTCGGTAGCAACGGCCGTTGCCTCCGCCGTTGGTTGACGCGA
GCCGCCATGGAGGCCGGCGTAGGTTCTCCTGCCGGCGAGGCTCTTCGGTGGCTGGGGACG
TTTCGCTTCGACAACCGCGCCTTGCGGGCTCTGCCGCTTGACCCCTGCGAGGAAAATGTG
CCTCGGGCCGTGGCGAGTGCCTGCTTCTCCCGCGTGCGGCCTACCCCCGTGCAGAACCCG
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CCGCGGGAGGAGGCCGAGCTGGAGGCCGAGGCCGCGCTCTACTTCAGCGGCAACCGGACC
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GTGTAGCTCATTTACCAAGGGGATAGCTTCATGGTAGATTTCTTCATTTTAATAGGTGCA
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TGAGGCTTAGAATTGGAGACTCTTCCCCATTATACTCTGTTCTGTCGTCTTTATTCAGAG
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AAAATTATTTTTCACCCAGCTTATGTAGATCCTTGTGTCACTTATGGGGTATCGTTGTCA
CCCTAGCTGCCATGAAAATTCTGGCTAGAGCCGCACTTGAGGCCTTAACCCATTGTAGTA
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CTAATCCCCCTTTCCCCTGCCCACCAGGAAGTGTCTTTGATGTGCTGCTTTCTACTGACC
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GGTAGCCATGTTGGTTTGCAGTAGAACAGCTAGATACGAATCCAGTAGCACCTTCGTGAC
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TGTTCGATTAAGGAGCGTTTACTCTGTAAATAAACTAGTTACTTTTTATGACACCAGGAA
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TGTTTTTAAAAAGCACACACAGATTCAGGCTTTTGCTGTAATAATTGTGTTCTTGCTTCC
CTCCTAGGTACAGAAAGTCTTGAAGCTCTTAGAAAAGCCATATGAAGACACAGAATGTTA
CGGTGAGGAACCTGCAGAGGAAGAAGAGGTGGCTGTTGCTGCTGCCTGCAGTTCCATGAC
CAGTAGCAGGCTTCCATACAGTAGTAAACCACCCCTCTGGGCTTCTGAGCTCTGTGTCAC
ATGATCTTCATAAATGCCTTGTTAGTGTTTTCCACAAAGAGGTCTTGATCTTCCCATGTG
GAGAATGCAACAAGGCATAATAGAAGTGCTATTAAGTCACAGACAGATTGTTTGGATGCC
TTCACAGTCTCACCTTAACCATGTTCATGTTATGAAATGTGACAATCACCTGTTCCATGC
ACACTGTTAAGGCTTTGGAGACAGACCATCGTTGTGTCTTCTCTCTGTAGTGCTGTTGTA
TTTTCACACACGTGGATCTTTGAACATCCAAGTGAAATCTGTGTTTGTGAAGACAAAAAT
AGCAAACCAAATGCTGGATGTATTTTTGTCTGAAGGTGAACTAATGGTACTTA
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