SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003337_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein O (SelO)
SpeciesIctalurus punctatus (Channel catfish)
Transcript IDSPT00003337
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003215_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003337_2.0 # Transcript # Selenoprotein O (SelO) # Channel catfish (Ictalurus punctatus) # Full length # Forward
ATGGCTAGCAATGTACTCCGTCTAATACGACCTTACATTTTCAACTCTAACCCCGGTTTG
TTGAGGTCTTACTCCATGGAGGGTATGGGCACGGCGATCGCGACGAGTCGTTCCAAGCTC
GAGCGGCTGGACTTCGATAATGTCGTGCTGAGAAAGCTCCCTGTGGAGGAGTCGGAGGCT
CCTGGAGTGAGGACAGTCCGCGGCGCGTGTTTCTCCAGAGTCATGCCGCAGCCGCTGGAG
AAGCCTCGCTTTGTGGCGGTTTCCGGACCCGCCATGGCGCTGCTCGGCCTCAGCGCGGAG
GAGGTAATCAGTGACCCTCTGGGCGCTGTGTACCTGAGCGGCTCCAGGGTGATGCCAGGC
TCTGAGCCCGCTGCCCACTGCTACTGCGGCCATCAGTTCGGCCACTTCGCGGGGCAGCTG
GGCGACGGAGCGGCGTGTTATTTGGGTGAAGTGAAAGCTCCAGCTGATCAGAGTCCTGAA
CTGCTAAAGGAGAACCCCAGCAGGCGCTGGGAGATCCAGCTGAAGGGTTCTGGACTCACG
CCTTATTCCAGGTAGACTTCCCAAGGACGTCATTTATTATTGACAAACATGGGAGTATTT
TTATGGATGGATAAATTCACAAGACTGATGATTGAGGCTAAAATTATCATCATCATCAAT
CATTGGTTCATCTTCAGTAACTTTATCCTGGTCAGGTTCATGGTGGATCTGGAGCCTGTC
CCGGGTGGGAGGATACATTTTTAATGATGGTATCTTACATTTATACAGATCAGCCATAAC
ATTAAAACCACTGACAAGTAAGTGAATTATACCTGTAGAGGGGTGGGATATATTAGCCAG
CATATGAGCAGTCAGTTCTTGAAGTTGATGTGCTGGAAGCAGGAAAAATGGGCAAGTGTA
AAGATCTGAGCGACTTTGACAAGGGCCAAATTGTGATGGCTAGACGACTGGGTCAGAGCA
TCTCCAAAACAGCAGGACTTGTGAGGCATTCCCAGTATGCAGTGGTTAGTACCTACCAAA
AGAGGTCCAGTGGAATTACATCCGGTGAACCGGCAACAGTTGGAATTACATCATGTGGAC
GCCCAGGTGTGTGTGCGCGTCACTTACCTGGGGAAAAGATGGCACTAGGATTCACCTATT
GGAAGATGGCAAGCCAGTAAAAGCAGTGTGATGATCTGGGCAATGTTCTGCTGGGAAACC
TTGGGTCCTGGCATTCATGTGGATGTTACTTTGACACGTACCACCTACTTAAACATTGTT
GCAGGCCAAGTACACCCCTTCATGGAACTGCATTCCCTAATGCCAGTGGCCTCTTTCAGC
AGGATAGTGTGCCCTGCCACACTGCAAAAATTATTTAGGAATGTTTTGAGGAACATGACA
AAGAGTTCAAGATGCTGACTTGGCCTCTAAATTCCCCAGATATCAATCCGATCGAGCATC
TGTGAGATGTTCAGGACAAACAAATCCATGGAGGCCCCAGCTCACAAGTTACAGGACTTA
AAGGATCTGCTGCTAATGTCTGGGTAGCAGATACCATAGCACACCTACAGAGGTCTTGTG
GAGTCCATCAGGTCAGAAATGTTATAGCAACATTAGGGGGACTTGCACAATATTAGGCAG
GTGGTTGTAATGTTTAGGCTGATCGGTGTACTTGGCTGGTCTACTAAAAAAAATAAAAAT
TTTGTATTGCACAGGAAGTGTGCAGTACACTGTGCTCTCTACATGATCATTTCACTATTG
TACATTTTACTACTCAACCTAAAATACATGCTGATCTGTATTATAACTGTGATCTCAGCC
CAGTGTTTCTCATAAAAAGTGTCATACCACTCCTCTCTCTCTTCAGGCAAGCGGATGGAC
GTAAAGTCTTGCGCTCCAGCATCCGTGAGTTCTTGTGCAGCGAAGCTGTCTTTGCCCTTG
GGATTCCTACCACACGGGCTGGCTCTGTAGTGACCTCAGACTCGCGGGTCATGAGAGATG
TGTTTTACAATGGCAATCCACGCATGGAGAGATGCTCGGTGGTGTTGCGCATCGCTCCCA
CTTTTATCAGGTCAGTGCTGTCTTATTCACATCACTGCCAGTGACATGCTATATCAAGCA
AAAAGGATACGTTTTTACAGCTATACCTGTATAGCGATTGTTTAGTCATTTGTGTGGTAG
ATGGTGTCTGATTAATGAAAGAGAGCTGGTTGTCTTGTTGTTCTTATGCAGGTTTGGTTC
ATTTGAGATTTTCAAACAGGAGGATGAGCTCACAGGTCGGCAGGGCCCCAGCTATAGATA
TACTGAGATACGAACTCAAATGCTGGATTATGTCATTGATACTTTCTACCCAGAGATCCA
GCAGAGCCACTCAGACCCAGTGGAGCGGAACACTGCCTTCTTTAGGGAGGTATGCTTTAC
CTAATCAGTCCCTCCAGGATTTAGCCATTTTGCGATTGCAGAAATTAATGCAAAACCATG
ATAACTCACATTATTCGCAGGAGCTTGCAATTTTTTCAAGATTTCCGCAGACTTGGGCCA
TGACGTCATGTGACGTCATCACAACACTTATTCGGCCAAAGTCCCCTTCGATTCATGTGC
ATTGAACATGAGTACAGCTAAAAGGTCTCATTTACAAACAAACATCACTGCGAAACAGCA
TGCAAAACAACTTCGTGCAATTGCAGTTTCATCAATTCAAGTAGTTTTTCACAAAAAAAG
CATCACAAATTTGGAATAAAGAAGCAGCTAAATCAGAAAAGTTTGGCCGTAACAATCACA
AAAAACTCCTCGAAATTCTGTATGGACTGCTTTATCGGACTGCTTTATCAGACTGCTTGA
TTTTGCTGCGGCTTTTTTCAAAATTTGTGATGCAATTTGCGATTTTTGTTTTGTGTGTGT
GTGTGTTTTTCTGAGGAAAACTATTGGATTGGTGATATTGAAATTGCACGAAATTGTAGG
GATGCTCCGATCAGGATTTTTGCCGCCGATATGATTACCTATTTCTTGTCACCATGGTCA
GCCAATCCCGATCTTTCAAGCTTTATATAAGTTATATGTAAGCTTTCTGTTGACCGTCAC
TGTTAACCTTTTTTTCCCCCAGATAAAGTAATACCACAGATGTAATACCACAAATGAGCA
CAACAAATATTAATTTTACAATGAACATTTTAATAGGCCTTTAAAAATACACAGCAAATG
ACACATCTTTCCTTGTTTCTTGAGACCTCGTAATAATTCCACACTGGTGATGACATGACT
GCAGCGCTAAAGTTTAACATCGTCGTGTTTTTTTACGTCCTCACGTGTTTTATGTCGGCC
AAATTTAGAGACTACCGATCGAGTCATAGAATGTGATTATTGGCCGATACCGATTGGCGG
CTGATTGATCGGAGCATCCCTACAAAATTGTTTTGCACGGTCTTTCACAGTGATGCGAAA
AATTGCAAACTCCTGTAAACATTGTGGCGTTTCCCACACAAAACATTATTAGAAGTATTA
TTAAGTATATAAGTATTCACGGTTGCCAGTTTTTTTTCTGTCTTAGGTGACGCTAAGAAC
AGCCAGACTTGTGGCCCATTGGCAGTGTGTGGGATTCTGTCATGGAGTCCTCAATACTGA
TAATATGAGTATTCTGGGGCTTACACTGGACTATGGACCGTTCGGCTTCATGGACCGGTA
TGGTCTTACACACAGTCAGTGCTATCAGTGCTACATTGATGTCTTTGAAATCATCATTGT
GTATTAACTTTCCATTGAATAAGATTCTACTTTAACTAAATGCCACTATGTTAAAAGATC
TTGCTCAGGGTTTCTCTTGGCCGTTTATGAAACTGAAAATTATCTGTGACCTGGTAACCT
GGGTATTTCACACAGGGTTTGGGCCATGATTGGTCTTCTCTAGTTCCTTCTGATATCGGC
ATGAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAGTGGGGGGTAAAAAAAACCCTTGACCTTAATTTGAC
TTGGTGTACCTCTGATTTTTCTATGCACATGCATTCTGTTGATCGTTGACGTTAATGTCA
CTTGCTGTTTTTCCTTCTGAAGCTTTGACCCAGAGTTCATCTGCAACGCCTCTGATAATT
CTGGCCGTTACTCATATCGAGCTCAGCCAGAAATCTGTCACTGGAACCTGGCTCGGCTAG
CAGAAGCTCTGAACCCAGATCTGCCCTCGGACCGGGCGCAGGCGGTGTTGGAGGAGTACT
CGCCCCTCTTCAACACATTCTACTTGAGCAATATGAGAAGGAAATTGGGCTTGCTGAGGA
AAGAGGAACCAGAAGATGAGCTGCTCATCACAAACCTAATGCAGACAATGCACAACACGG
GTAGGGACTGAGGAGACCTAGGCAGGAATGAATTTCTTTTGTTACGAATTCCTCAAGGTG
ACTGCTCTTGGTCTTTATAATCCTTTCAGATTAGTGGAAAAACATCCAGTCACCTTAACT
TACTACAACTAGACATTTCAAAAAGACCTGAATGACTTTAATCTATGTGTTTTTAAGAGC
GAAATATTCTGTCCTGTTTCCTGCTCTGAATAACTGTGGTCTGTTTTGTGTGAATTTTCA
GGCGCTGACTTCACCAACACGTTCCGCTGTTTGAGTCAGATCTCATGTCCTGCAGAAGGA
GACACAGTGGAGGATGCTGAACTTGTCAAACAGGCCACAGAGCTTCTGTTGCAGCAGTGT
GCCTCTCTAGAGGAGTTAAAGGCTGCCAGCAAACCTAATATGGACCCACGGTAAGGCAGT
TTTCACTTTAAATATTTTTTCATATTCTCTGCATATGGGTGAATACTTGTGGGGGTTTTT
TCACTTAGCAAACCTTTTATTGAATTGAGAGATTTCCTGCAGCAAGCTTTGTTTCACTTG
TAAATTTTCATATTTAGGTCAGCTACCATATATGCAGAAGAAACCTACCTATGCAGAAAA
ATAACGTAATCATGGTTATTAAAGGTGCCATTAAAGGGTTCAATTACTAGTAAGTGCACT
TCCTGAAAGGTATCATTTGCTGTGTCCATGGATGATATCGCTAACTCTGCTGTAGTAACT
ATTTCAAACTAGGAAGTGGAATTGTATGTGGTGAACACAAACGAGTGGAGTAATACACAC
AGCGAAACGTCCGCACTTATATAGCGTTTTTATCCAAAGCGCTTTACAACTGTGTCTCAT
TCACCCATTCACACACGCACTCAGACACCAATGGTAGCAGAGCTGCCATGCAAGGCGCTA
GCTTGCCATCCGGGAGCAACTTTGGGTTCAGTGTCTGGTATGTGGAGTCATGTGGGCCGG
GAATCGAACCGCCAACCCTACGATTAGTGGACAACCCGCTCTACCACCTGAGCCACAGCT
GCCCATATACTAAACCTAAGCACTCTTGGAATGCCACTAGGCCAGTCAAATTAGTGGACC
GAAACGAACTGTTGTATAAAAAGGTGGAACTTGTACAGAAACATTTTTTTCAGTTCAGGA
AATTCTCAGGTTTTTAGAACTATATAGTGGAAAATGTCGACATTTCACAATGTGAAATTG
TTATTACCATCTAAATCAAACAAGACTCCATTGAGTGGCAGTGGTGGCTACTGCTGTTAC
TGATCAAAAGGTTTGGGGTTTCAAGCTGTGGTGCTGCCAAGCTGCCACTTTTGGGTCTTT
GAGCAAGGCCCTTAACCCACTCTGCTCCAGGGGCACCGTGTCATGATTGACTGCTGCACT
CTGACCCCAACTTCCTGGCATGCTGGGGTACGTGAAGAAAATAAATTCACTATGCTGTGT
CCAATAAACACTCATTATCATTATCATTAGAGTTGTATCCAATTTGGTAGATAATTTGTT
CAGAAATGGATTCGAAAGACTTTGCTAGTCTAAAGTTTTTACTGTAGTTAATATCTTTGG
CAGAAATTAGGTCACTTTGATGCTAAAACTGGCAAACATGGAGTACTTGAAAGTTAGTCT
GGCCACCCAAAGGATAGTCTGCCCACCCAAAGGTCATTTCCATAGCTATGTTTCAATCCA
AGTTGAGCATTTAAACTATGAAAATATGTTTTTGAATATCGCACAAAACATTTGCGAATA
AAACACCTTTACCATCCAATGTGTTCAAAAGAACAAAATCGTCACTGCCGGGGAAACTTT
CGCAACTCGCTCTCCACTATTACTTTTCTGAGCAAATTATCCAATTACACGATTTGTTGA
GGCAAAGTCACATGAATTTATTTATTTATTTTGCTGCACGTTGAGGAATTTATTCTGTAT
GTGTTTTCATCGTAGTTTATACGCTTGTCTTTTTATCGAATTAAAGAAATTATCCGCCTC
AATTGAGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGGCATGCTGGGGTACGTGAAGAAAATAAA
TTCACTATGCTGTGTCCAATAAACACTCATTATCATTATCATTAGAGTTGTATCCAATTT
GGTAGATAATTTGTTCAGAAATGGATTCGAAAGACTTTGCTAGTCTAAAGTTTTTACTGT
AGTTAATATCTTTGGCAGAAATTAGGTCACTTTGATGCTAAAACTGGCAAACATGGAGTA
CTTGAAAGTTAGTCTGGCCACCCAAAGGATAGTCTGCCCACCCAAAGGTCATTTCCATAG
CTATGTTTCAATCCAAGTTGAGCATTTAAACTATGAAAATATGTTTTTGAATATCGCACA
AAACATTTGCGAATAAAGCACTGTTTCCATTCCATGTGTTCAAAAGAACAGAATCATCAC
ATCCGGTAGAATTGGCGCATCTCGCTCTTCCCACATTTCAACTTTTCTGTACCAATTATC
CAATCACATGATTTGTTGAGGAAAATTCACATGACTTTTTTTGATGTGCGGCGAGAAATT
TATCCGGTAAATATTTTTCCATCGTGGTTTATGCACACGTCTTCTTATCGAATTTAAAAA
AATCATCCAGCTCAATTGAGCGGATAAGGTTTTTTTTTTAAAATCCGCATTTTAGAGATT
TTATTAACATCTGGTGTTTCCATCCAGCGTTTTTTATTTTTATTTTTATGTGATATCCCA
AAATTCGCATAAAAATACGTGGATGGAAACATAGCTCATGATACATAGGTGAGAGAATAA
CACACAAATTCAGTGGTACTGTTCCTACATTGTTCATATCCATGAAAGAAGTATAACGAC
CCAGCACGGAAATCTAATCTTTACCCCTGATTTACAAACTGCTGTCACCTTGTGGCAATA
TTGATAAAAATGTCTTTCCATTACTGAACTAACACATAACAGATGCCCCCCTTTTGCAAG
ATGTCTTTAAAACACATTAAAAATACAGACTTCTGAATATATCCCCCCTTTTTTATTAAT
AATTACATCTTATATCTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTCAGCAGCACGTCAACA
TCAGTATGCGTGATGATGCGTGTGTAGTGAAGAAGAATATGAACAGATTTCTTAAAAGAA
AAACTCCAGATGCTTCTGGACCATCAACTTCATCCTGAAGTAGCTAACGCTGTCTAGCAT
TAGTGTTTGTGTAGGGTGCTACAATTTTTTATTATTTTTTTTATTTAACATTTTCAAAGG
GTGCCGTGACTGAAAAAAGGTTGGGAAACGCTGCTCTAGACTAAAGCAGGTGGTTATGTT
TAAATGTCATTATTGGACTAAGTAAATAGAGCTAGATTACATGAATATGGTGTTTATTCC
CAGGTATAGAAATGTATATTAGGTACAAGTATAGTATAAGTATAACCTCTGTATGTTTTT
CCCCATTTTGTTTACTTTCACTTATATCCATATTTGAGGATTTAAAGCAGGAAATTGATT
AATTTTAGAAAAGTTATGTGCTTTCAATCAGCCATTGTTTCCCCACAGTGAGTTCTCAAT
GCTGCTCTCCTTGGCCCAGAGTAACCCTGCGCTGTTCGGCATGTTGTCAGACCGGAGGAC
GTTGGCCCGACAGCTGGAGAAGCTCTCTAGGTTAAAGGAGCTGCTGGAAAGCACAGAGAC
GGACCTGAAGAACAAGCAGACGGAGGAATGGACCTGCTGGATTAAACAGTACAGGTGCAG
ATAGCGATGAGGTGTTCAGTGCTGTCCATGCAGTAATACAGAGCCACGTTTGTGCTAGGC
AGCAACAGGTTGCTTGGAAACCCAAGTGATAAAACACTCAGGGGTTTCATCAGTTAGAGC
AGATGGTAGAAAGCTAGAATAAACATGATGGAAGTGGTGTGTTCCCTTGAGTACGTTTGT
CAAAAAACCCTCTTAGAGCGCTTAGATTTTTAAAAAGGATTATTATATTTACCAGCTATA
AGGATTTTTGCATAAACAGTCCAGCATTTATGAATTGCCACAGCATTTACATGTTGTCTT
TGCTTGCCTCCAGGCAGCGTCTTGCTCGTGAGTGTGAGGGAGAGTGCGATGTGAAGGTGG
TGCAGGAGGAGAGGGTGCGTGTGATGGACAGCACCAATCCTCGTGTAGTGCTTCGAAATT
ACATCGCCCAGAATGCAATAGAAGCAGCAGAGAATGGGGACTTCTCTGAGGTTAAGCTGT
TACCGTATTCAGTTTTACCTGATCAATACTAAAAAGTGTATTCTTATGAAATGAAACTAA
AAAATCCACTGATTTTTGTCATCAGGTTCAGAGAGTTCTGAAAGTGCTGGAGAAGCCGTT
TTGCGCGCAGGAGGGCTGGATGGTAAGACGAGGATCAGAGGAGGCACAAGAGAGGGATGA
AGAAGAGGGACAGAGAGAGGCTGAGGAGGATGTTACAGGTGCAGAGAACAGAGTGATTGT
GTCTTATGACAGCAAGCCCCCAGCCTGGGCTGCTCAAATCTGTGTCACATGATCATCCTA
AAGCCTTCAGGACAAGTAGCCCAGAGATTCATGTCTCTGAGTATCTGTCTGTGAAGGTTG
TTTGAGGTACTAAACTCCTATTAACCAGTTTAAGAATATACAGAAAAACTAATGGCTGGA
ATTAAAAATTCTATCCTGTATATTTGACTGGTTATAAATGATGACTTGGACCGCCAGTCT
GAGAGACAGGTCTTAGTCTGAAGACAGAGGTTTTAGTACC
Chart Advanced