SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003340_2.0
Identity
TranscriptSelenophosphate synthetase (SPS)
SpeciesManis javanica (Pangolin)
Transcript IDSPT00003340
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003218_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00003340_2.0 # Transcript # Selenophosphate synthetase (SPS) # Pangolin (Manis javanica) # Full length # Forward
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ATGCCAAGGCTTGGTATGTGAATCATTTCTTCTTTTAGACTTCCTTGAGTAGAGCATCTT
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GCTGTCGTGGTGCTGAAATAGTTGTACCAGAGCAGTTTTAGTTTGTAGAACACGAAAGGT
GCAGTATGATTCGGGTAGGATTTACTTTGGCCCGTTTGGACTTCTGAATTGAGCGGGTGG
CATTCCCCCCTCAATTTTTTTGTACTTGATCCTGATTTTTTTTCTCTGCTTTGGCTATTG
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GGTAATTTTAACAGAAATGTAGCCTGCAGTAGCTAGGCTTGACTTTCTCATCTGATTTCA
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ATTTTAAGGTTTCCTCTTTTAAAATGCTTTTGGGAACCTATTTAACAGGTCACATAGATG
CCACTGTGTTTATGTACTTGCTTGATTAGAAACAAGAAACACGTATTTTGGCTTTATTCC
TTCTCTTTCTGTATTTTTTGTTATTTTCATTTTTGACTAAAATGTAGAAATAATCATAGC
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TAGCTCAGAATGTAACTAGAAAAGATGTTTGTGGTGCTAGTCATGTGAACAGGTAATCCA
AAGGAAACGTTCCGTTCGCGGCATCGAGTCTGTATTGCTGTGCCATATTGAAGTTGAGTC
TTCATGACTAACAAATTTTATTCTCATTTTCTATCCTAAACTAGTTATGTTTCACATTTA
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AAGTATCTACAACAAAATTTGCCCTACTCAGACCACTTGTGGTGTAAAATAAAATGGCTT
TTCCTTTTGATTTCGGGTGGTGATGACTTCCATCTTTGCAGGCATTGGAATGGATACTTG
TGTCATTCCTTTGAGGCATGGCGGTCTTTCCTTGGTTCAAACCACGGATTACATTTATCC
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TGCTATTTGTTTGGTTTGGGGTTGTGTGCAGGGGTGTGCATGGGGAGTGGGGGGATGTTA
AATCCAGACTGCTCTCATTCTGCCCCTGCCCTGACCCTTGCAGTTAACAGGCTGTGACTT
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GCTACCTTTGGACCTGAGGGTGTATTAACTGACATGTTTGTAGTTTTCTTCTTTCTTTCC
TTACACCTTTCTTTCTTTGACATTCGTCATTTCCATCTTCTGTGTTACAGGCTAGAGATA
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TCTTCACCACAGTTAGGCTGCTTTACCATTTGTTCTGATTCCAGTCCCTTCCCCTGCTCA
GTGTGTGTTATGTACTGCTGTGTAGAATTCGTATCTGAACTGCTATACCAAAGTTCTTAG
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TTTTTTCCAGCATCTCTTAAAAGCCACCTGAGCAAGCCCAGAACAGAAGGGGCAGTAAAT
TGCTGCCGCCCTAACCAGAGGTTGGCAGTTCCAAGTCACAGCCACCTGTTGCCTTGTTAT
TGTTGCTAATGTGTCACAGAAGCTACTGAGCTTGCTGCCAAGTCTGCCAGGATGAGAAAA
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TTTTTTTCTTGTATTTTTTAGTTTCTCAAACAAGATGATTTTCCTGTTTATCTTCTATAG
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GCCGCTCCCACATTCCTTGTTCCTCCTTTAAATAAATTGCAGACTTCCCCCAATATTTAG
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AGAAAGAGTAAACAGCCTAGTGGTTCTGTGATTAAGGAAAGGTGACCAGCCTGCACATCA
CAAAGACAGAGTCCACGTGCCTGGGAAGTCCCCTCCTCTGGGGTCATGCTGCAGGCTTGC
TCTGTGCTTCTCCATATGGAAAGTCCCCGATTGCCCTTTCTCACTCCTCCCCTCTTTTCC
AGGGCAGGATAGCATGTGCCAATGTCCTCAGTGACCTCTATGCAATGGGGGTCACAGAAT
GTGACAATATGCTGATGCTCCTTGGAATCAGCAATAAAATGACCGACAGGGTAAGTAGGA
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CATCCCCAGCTGTGAAGTGAGGAGCCCAGGCTGTGTGGCTTCTGTATTCCACCCAGCTCT
CCACTTTTTGGCAGTTCATCATTGAATTAAAGTACAGTCTGGCCTATTCCTATTTTCATT
GCTACTACCTGCTTCCCTGAATTTCTTCTGGGAAGACTGAAGCCAAGACATTAGTATTTG
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AGGCGCCCTCTGGTTGCTGGTTGGATCGCTGCTGTGGACGGCGCTGAGCCCCGGGGTCAC
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CTTTGCCCTGCCTATAGAAATCAGAGTTCCCAGTAGGCCCTTTTCTGCCCTACAGTGTGC
GCTTGCACAGCTGTCAGAAGGGCATGTGATGTGGACTAAGCCAGTCTTGAAATTCTTAAG
GACCATGTAAAAAACTGGCTCAGAATAAGGGCAAGACCTGTGTACCCAGTCATTTACTTC
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TCTCTCTCTTCCTGTTATTTAAGTAGACTTATTGTGATGTTTATTTGCATACCACACAAT
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GTTGCTTTGTATGTCCCCTGCCCCTGCCCTGGCTTCTTTCACCTCACATTGTATTAGTAT
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TGTTTTGTGTCTGGCTTCTTTCCCTTATTGTAATGTTTTCAGGGTCCATTCATGTTGTTA
TGTGTAAGTGGTACTTTCTATGGCTGAATAATATTCCCTCATGGTTATTCAATATAGATG
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AAAAAAGCCACCTTGTCTTACTCTCTGAAGGAAGTAGAAACTCAGTTTGTGTATCTTACT
TGTGCATAGGTATTGAGTAGCACTGTGCTCACATGGTTCAGAATTTGAAAGGTTTGAGGG
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ATCAGACTTGGCTATTTTTAACCACTTACTATTAACATTTAGATTTTTTTTCAATTATTT
TGTCATTACAAAGGGTACTCCATTGAGTAACCTTTTATGTAGATCATTTTGTATTTGTGT
GACTCCTGGTAAGAAATTTTTCAAAACAGCATTGCTGGTTAAATGTATATGCCCTGCCAT
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GCTGAATGTGAGTGCCAGTTTCCCCACATCTAACTAACATGGTCCAGTAACAGACTTCTT
GGTCTTTGTTATTCTGTTTGGTGGTTTTAAGCCTTAATCCTGTGAGTGAAAGTTGAGTAT
GTTTTTTGTCCATTTTTTAATTGATGGGAGCTCCCTTTAGAATCACTGAGAGCTTTCATG
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TTTCAAACTTTCCTCTTAAGTGGTATGGGAGATTCTGAAGCCCATCTCTGTCACCCATTT
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TGATTATACTTCATAAAATGGTGCCTGTAACTTAGGAAAAAAAACAGTAATTTTATCACA
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GTGAGCATTGACCTGCATCCCGGCAGGCAGGAGCAGGCATGGCAGGCATGCATTTGAGGG
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TGTATTAGGGTGATTGAATAAGTATAATATACAAATGTTTATTCATAAACTACATTTCAC
ATGTTATCTTATTTAAGTCTTCAAAAAATTCTGTAAAGGTGATTTTCAGTCTCATTTAAC
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TCTTTAATGGAAGATCTGTACAATTTCAAAGCTGACTTCTGATCCATAGACAAACAATCC
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GCATCCACTTTACTTGTCAGGTCATACTCGTAGCTCTTCAGTCTTTGCGAGCTGGGGCGT
GTGCTTCTACAGAAGCTACAGCTGCTCATGAAGTCAGCCTGCTGCTCTCCTGCAGGGGAA
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TGTCTCCAAAAAATGAGCTCCTTTAGTTCTACTACCAGGGGACTTCAGGGTCAGTGAAGT
CCTTACAGAAATCCTAGGCATATTCTTGTATTAAATCAAAGTTTCATGTGTTGAATGCTT
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ATAAGGCCAGGGTTATTGACAGTTTAAATTATTTTAGTCACAAGGTCTTGGTTATTTTTA
TTTGGTTTTTTTAAACTAATTAGTGACTTGGAACATTTTGGTAAACAGTTGCCCTGTGAA
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TACTTAATTTAAAATTTGTCTTCATTACTGCCATTACAAGGCAGTAGCCACAGAGTTGCT
TCAGTACGACTGTCTAGGTCAGAGTAATTTAGCACAGGAGCTGAAAGCAGAGACGAGGGG
TTTGGGATTCTTCTCTCCTCCCCACCCCCAATTTGACATCACCTTTGCTTTTTTTTTTTT
TTTTTGCCAGTTTTTAAAAAGTGTTTAGAGTTGAAAAAAGCAAGTTCCAAAGACTGTGTA
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ATGCTGGATTCTTCCAAAATCAGGCTGAGGAAAAATGGAGAACACCTTTTCTTCCTGGCT
TGTATCTCCTTTGTGGTCACACATGAATGGCGTCAGTGTGCACGCAGTTGGAGTTGTTTC
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CTCAGAACTATTCAGGATGTGATTTACCCCCAGCCCAGGAGAAACTGCACCCAGCGTTTA
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TGTGGGCAATATACAGTCGCAGTTTTACTGATTTCCTACCCCTCCCCGCCCCCAACACAC
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GGCCATGGGCCAAACCTGGCCAGTGACTGCAGACCTGCTTCTATAGGTACCTGGTTTGGG
GCCCATAGGTCATGAGTGGGAACCCACTCTTCTCATGGGTCTTTGAAGTCCTAACCTCTA
ATGTGCCAGCAGAAGCATTTCTGGGAAAGCATCTGTGTGGTTGCTCTATGAAGATGACTA
ACAAGCAAACCAGCATTTAAAATGTAAGCTCCAAGAGGACAGGAATTTTTGTCTGTTGTA
TTTACAGGGCTTAGAAAAGTGGACACACAACAGGTGCTCATTAAACACAGATTGAGTGAA
CTTTGCCTTCCACACTCTAGTATTCTTTTTGGTAGTTCATGGACATTTTCTTATTAACAG
TCTTGTGAATGGCACCCCGTTTTACCTCTTTGGCCAAAAGGCAAAACATAAAAGAAATAC
ATGCAATTTCCATTCTGAAACCCAAGTCTGTCTAACTATAAACCTGCTTGTTCTCAGACA
TTGTACATTCCATTTATATAAGCTAGTGATGGAAATTTATATAATTTTTATTGTGGAAAG
ACCAATTTTCTTTCTCATCATTAATTGCATTTTGAATTTAAGGACTTGGGGTTGTGTGGC
TTCCTATTGCAAAACTTTGAAGATACTTGAAGATGAAGTTAGGATAAACATGAAGTTCAA
AAATCTTGTCCTAAAAAAAATCGCTCTTCATTTAGTTTCTCAGGGTTCCCTGAGCCAGCC
ATCAGAAATGGAGTTAAATGTATTTCTTTGTCCCTTTCCTTCTTTTCTTCAACTTCGCCC
AAATAACTTTGAACCAAATATATGTAATACTTAGCCATGAAATCTTCAGTTATTTTTTAA
AAAAGATCTTTGACAAAGGAGCAAAGACAATTCCATGGAGAAAGGATTATCTTTTCAACA
AATGGTGCTGGAACAACTAGACATCCACATACAAAAAAATGAGTCTTGACACAGACCTTA
CACGCTTCCCAGAAATCAAAACGGATTGTAGTCCTAAACGTAAAATGCAAAACTGTTAAA
CTTCTAGAATATAGCGTAGAAGAAAATTTAGGTAATCTTGGTTTTGGTGGTAACTACCAA
AGCACTATCCGTAAAAGAAAAGAATTGACAAGTTGGACTTTGTTAATATAAAAAACTTCT
GCTCTGTGAAAGACACTAGAGGATGGAAAGATAACCCACAGGCTGGGAGAAAATGTTTAC
AGAATACACATCTGATAAAGGACTGGTATCCAGAATATACAAAGAACTCTTAAAATGCAA
CATTAAGAAAAAAAACAGGTTTAAAAATGGGCAAAAGATCTAAACAGACACCTTACCAAA
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AGGGAGTTGCAAATTAAAATAATGAGATACCATTACACACCTATTAGAATGGCTAAAATC
CAAAACCCTGACACCACCAAATGCTGACAGGGATGTGGAGCAGCAGGAACTCTCTTTCAC
TGCTGGTGGGAAGTCAGAATGGTGCAGCCACTTTGGAAGATGCTTTGGCAGTTTCTGGCA
GTATATTATATTAACTATGCCAATATACTAACATGATCCATCATTTGTGCTCCTTGGCAT
TTATCCAAGTGAGCTGAAAGTTTCCATCCACCCAAAAACCTGCACAAACATGTCTGAAGC
AGCTTCATAATTGCCAAAACTTGGAACAACCAAGAAGTCCTTTGGTAGGTGAATGGGTAA
ACTGTGGTACATCCAGATGATGGAATATTATTCAGTGCTAAAAAGAAATGAGCTCTTAAG
CCATGAAAAGACAGGGAGGAACTTCAAGTACATATTAATATTACTGAGTGAAAACCAGTC
TGACAAGAGCAAATACTGTATTATTCCAACTACATTCATTCTAGAATGGACAAAACTATA
GACAGTAAAAAGATCAGTGGTGGCCAGGAGTTTGTGGGGGGATGTAGAATGAATAGGTGG
AACATAGGAATTTTAGGACTGTGAAAATACACAGTATGATACTGTAATGATGGAGATGTG
TCATACATTTGTCAACACTCATAACCTACTACATCAAAAGTGAACCCCAATGTAAAGTAT
GACCTTTAGTTAAGAATAATGTATTAGTTTATCACTTACAACAATGTGCTATAGTAGTGT
TTGATGTTAATGATGGGAGGTGAGGGGAGTATATGGGAACTTCCTCAGTTTTTTCTGTAA
ACCTAAAACTACTCCAAAAAATAAAGTGTATTAAATTAACTTTCAGAATTTCACTTTGGG
TTTTGATATTTTAGAATTGTATTTTCATTATTCCCACATGCTATGTCCCTGACAAATTAG
GAATTTTGATATCAAAGCATATTTAAGATTCTGAGTTGAGGAAAGGTGTTTTTTTCTCAG
ATAGTCTCCATTTTATACTAGATAATAAACTCCTCTGTCCTCTCAGCTGCAGGACTCATG
CACACGTTCAACGCCCATGCTGCCACTGACATCACAGGCTTTGGGATTTTGGGTCATGCA
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ACCTGCCCTGAGACATCAGGTATGAAGATGCTGGGCCTAGATCTGAGAATTAAACTAGTG
AGGCTGAAGGGAAATCCCATGAGAAGGAAGAAGCCAGGTACATGGGCATGACCCCTCCTT
GTGTGAGGTCCGTGCTGATAACCTTGGCCTTCATAGCAACGAATGTTCCCAGCCCCCTCC
GCTGCTGTTGGTTACCTGTCCCTTGCCCTCCTGTATGTGATCAAGCTGCGTTATTTTAGT
CTAGTGTTTTTGTGCTCGGTGATAGGGAGGGAGTATGGGAAAAATAAGTCATTACTCTAT
TTTCATTGGAAACTTGAAATAATACCTATAGGTAGATTGAACAGGCTGTATTTCCTGTAA
AAAAGAAAACCTCTAAAATTGCTGTTTAAGAATGACAAATATATATAGTATGTCTCCAAA
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TTCCTATCCCTTTTTTTTTTCAGTCTCTCATATTTTTGTTTTCTCTACTTTTTAATCTCA
GTAGTTTCCCTACCCTGGCCAAAAGAGTTGAATCATCTGGGGATTTAAAAAATATCCCTG
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ATCTGGCTTGAGCAGTGCCTGCCACCTGGTGGGTATGAGAGAAATCTTGAATGAATATGT
GAATATTACCAACAAATTCAGTTTGTTTCCTTTATTCAAAAATGAGAAGTTTTTATGTTT
TGTAAATGTTTGTGTTTTTTCCTGATTGTGTTATTTCTGCTTACATTTACATACAAAATT
TTCTGTCCTAGCTACTGAAATAGCTTATTTTAACTTATTTTATACCTCTATTTTGATGAT
GAGGACCACTCATAGAACCTAGATACTGTAAGGCATATATTCTTTCATTATTTCAATTTA
AAAACTAAAAATACAGAAATGTGGAATCCATGTAGAGAATCAAATAAAAAAGGGTAGTTC
TCTCTTTTTTTTCATTATTAAAGTATCATTGATACACGATGTTATGAAGGTTATCATGAA
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TCACTGTCCATCAGCATAGTAAGATGCTATAGAGTCACTACTTGTCTTCTCTGTGCTGTA
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