SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003342_2.0
Identity
TranscriptGlutathione peroxidase (GPx)
SpeciesIctalurus punctatus (Channel catfish)
Transcript IDSPT00003342
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003220_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003342_2.0 # Transcript # Glutathione peroxidase (GPx) # Channel catfish (Ictalurus punctatus) # Full length # Forward
TATTTTTTCTGTAGAGGCAAGGTGGTTATCATCACCAACGTTGCCACCCAATGAGCCAAA
GCCCCAGTGAACTACTCTCAGTTTGCACAGATGCACGCCAAGTACGCTGAGAGAGGTTTA
TCCATCCTGGCTTTCCCATGCAATCAGTTTGGCAACCAGGTATGATGCCTTTATACATGC
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ATAGGTATTTATGGAAATTATTTATTTTCTTTCTTTTTTTCTTTCTTTCATTCTTTCTTT
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GTGATTTAAGTGCGACTCCAATCCAAGTCACAGACTTGAGTTTCCATCTCTGCTTAGAAT
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GATATTGCAATTTATTCAGCCTTTTTTTTATTGTATTGGCATATTTATAAAATGTAAATT
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GCTCTTTGTCACTACATAACTGAACATCAGGAAAAGAAGACACCCTGTAATTTTGTATCT
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CTTTGTAACTGCACAATCATCTTACTGTTAATAATCTTTTTGAGCCCCTTCAGTCTGGTT
TTCGTAAGTTTCATAGTAAAGAGACAGCTTCGGTCAAGGTCAACAGTGATCTGTTAATAG
CCACAGATTCTGGTTCTCTTTCCATCCTTATCCTTCTTGATCTTAGCTGTCTTTGGTGTT
TCTGAGGCTGTTATAACTTGGTTTAAAAACAAACTGCCGGCGATCAGAGAGATAAGTTAT
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GGCTCTGTTCCTACTGATGTCCCTCAGGGATCAATTTTAGGCCCCTTACTTTTTAGTATT
TATATATTTCCTCTTGGATTGCTCTTAAGATCACTATGCAGACAATACTCAGATCTATAT
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GGCGCTCCTCATCTGCTTCGTATTGCTGGTTCACTAATGTTAAACGTAGAGCGCTCTGTT
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CTTCACTCTATGCTATCTTCTCCTGTGACTGAAAGGCTTATCAACACTTTTGTTTTTTCT
TGTATTGATTACAGGAATGCACTTCTTGCTGGGGTTCCTAAAGCCACACTAAATAAATTG
CAAAATTCTGTTGCTAGGATCCTGACTAGAGTCAGGAGAAATGAACACATCACTCCAATA
CTGAAGTCCTTGCAATGACTTCGTGTTGATTTTAAAATGCTTATGCTCACATATGAGGCA
CTGCATGGTCTGGACCCTCACTATCTGTCTGCGCTTTTAACTTTATATTCTCCTAAGCGT
CATTTGCGTTCCTCTCATGCTGGTTTACTGGCTGTCCCACAGACACGGTTGCGATTTGTA
GGGGACAGGGCTTTCTCGTCCTATGCTCCTAGACTCTGGAATGCACTCCCTGCTCATATT
AGAGATGCACAGAATTTAATCATTTTTAAATCTAACCTAAAAACTCATCTTTTTTTAGGT
TAGATATTTCTTGATGGGTTTAACCATTTTGTATTCAAATCTGTTTTTTTTTTTTTTTGT
ACATTTTGTGTTTTCTTTTGTGTATTTTTTATTTTCTTTGTATTTTCTTAGTGTGTAAAA
GTGCCTTGAGAAGCTGCTTTAAAGGTGCTACATAAAAGTTTATTTAAAGAGTTTATTATT
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CAGCGATCTCACAGGCTAACGATAGGACAATCTGACTATCGCCCAACACTACCTGGCATC
ATGCATAAACCAGATTACCATAGAGCCACCCCATGCCCTGGCCCAGGTGTTCCACTGCAA
GGAGTGAGGCCTTCACCAGTTCCCCCACAAACGGTTCAGCATATGCAGATCGAAGCAATT
GCTCAATCTGCAGTAAAATAGCTAACACATTTTAATTTGTGAGGCAATATTATTAAAGAA
TTGAATTCTTTAGCATGGTACAGCTTCAGTAACAGGGTTTGTGGTCTCTGGTCTGACTGA
TGATCAGGTTTTCAGACCTTCACGGTCATGCCAAAACTGTTGTCATTGCAGGATGTACCC
ACATTATGGTGTAACCTTTTGCACTCACTTAATTGTATGATTTAGAAAAAGACTATGTGT
GTGTACTGTCAGTCCGGTTCTTTCTCAGTACTGGGTCTTTCTGTGATACTGTGAGTGAAA
AGGACAGTTATCAGTTATTACTCTGCTCTTATCAGCTGTCTGTGTTTGTGTCAGGCTGTA
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TGTTGGGCCCTTAACCCTCTCTGCTCCAGGGGTGCTGTATCATGGCTGACCCTGCCCTCT
GACCCCAACCTTCTCACATGCTGGGATATGTGAAAAAAAAAGAATTTCACACTGCTGTAA
TGTATATGTGACTAATAAATTATCATTATTCCTTTATAATTATGATCTCTTGTCTTTCTT
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CTGTCACAGATATCGATGGCAATGAAGTGTCTCTGGAAAAATACAGGTAGGCGACAAAAA
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GACATACAGAAACTGAATGATGTTTACAGGCAAAAGGGCATAGTTGATTTGCTAATGTTA
AGCAAATGGAGAAACAAACAGAAGCAACTGCAGGTATGGATAAAACAACAAGTCCAAAGG
CAGAAATCAATAAACAAAGACAGGCAGAGGTCAGGCAATCAGGCAAACAGTCCAAACTAG
GCAAGACAAAGGGACAAGATTGTAAACGTGAACAAAGTCAAAACTAGGGCTGCAACTAAC
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