SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003342_2.0
Identity
TranscriptGlutathione peroxidase (GPx)
SpeciesIctalurus punctatus (Channel catfish)
Transcript IDSPT00003342
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003220_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003342_2.0 # Transcript # Glutathione peroxidase (GPx) # Channel catfish (Ictalurus punctatus) # Full length # Reverse
GAGTTGCACGCCAAATGCATCAAGTTTGTCCTTTCCACAGGGCGGTTTTCAAAACAAACT
GTCATGAATCCATGGGATGACGCCACTAGCTCCCAGCAGGCTGCAGGAGAGGATTGGGAA
TGGAAATGGAAATGGCTGTCCAAGAGGACATCTAGCTCAAGGTGAAATTAAATGCAGGGT
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ATAAAACTTTAATTTTAGAATAGACCATAACAATTCTTGCCTAAGTGTTTATGAAAGATA
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TTTACTGCTAAAATTAAGTTAATGTAAAGTTTTCATGTGAAAAGTTATGTTTTATTAATA
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TTACACTCCCACTCACACCACTCCTTTATAGAGACTGTTCACATACAGCTGCAGTGTGAA
GTATACGCTCAGTTACATTTTGTCTCTGTCATTACCAAGCCTTGATACCGGGTTTGATCT
GGTTTTGACTAGAGCTGCATCAGCTAATCGATAATAATCAATTATGAAAATCGTTGTCAA
CGAATCTCATTATCGATTAGTTGGTCTGTGCACGGTACATTTACCCACTACGTTACTTTT
GTTCCGAAAACACACTTCGGAGAGTAAATACTAAAGTTGTGTCCCAAATGAGGTACTATA
CACTTACATTATGCACTATATACTCTACTACCTAGTGCAGTGTTTCCGTGACCCCTAGTG
GTCAGTGGTGCAACTGCAGGAGGTCAGCGGAAAGTTTTAAAAATGTTTAAATAATATTAT
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GCTTATTCGCATGCATTCACAAATATCACGTTAGCTGAGCTGACGATCAAAATTTATTTA
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GGCACGTTCTACCAATCAACCAGGGATTGCTAGGTGCTTAGGATTGCTAGTAGAATTCAG
TGCTTTTTGTGCATCCATAAAAAGTAATGAATAAATACTTATATTTATATTATGTTATTA
GTTTACATTATATATATATGTATATGTGTATATATATATATATATATATATATATATATA
TATATATATATATATATATATATATATAAAACAAGAGCCTGGACTAGTATCTGTGTAGCC
TGTTTGGTGAGGTAGGGTCTGATTTTCTTGATATTGTACAGGATGAACCTACAGGACATT
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TGGGCTCTTTTCTGTTGTGGACAAACAGTTGTGCAAAGTTTTAATCTGAAGTTTATATTT
GTAACACTCAGTTTGTGGATTTTATTTTAAATATAAGAAAAAATGGTACGGAAAGTTGTA
CTGAAAGTTTCGATTAATTGATTAATCGAAAAATATATATAATAATAATCGGCCAACTAA
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CTTGTCCCTTTGTCTTGCCTAGTTTGGACTGTTTGCCTGATTGCCTGACCTCTGCCTGTC
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TTTGTTTCTCCATTTGCTTAACATTAGCAAATCAACTATGCCCTTTTGCCTGTAAACATC
ATTCAGTTTCTGTATGTCTACTTGCTCAAATGCAAGACAAACTCTGTGCATTTAATTAAT
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ATCTAGTATTCTTCTTATTTTTTGTCGCCTACCTGTATTTTTCCAGAGACACTTCATTGC
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GTGCAGACTTGGGAAGGAAAGAAAGACAAGAGATCATAATTATAAAGGAATAATGATAAT
TTATTAGTCACATATACATTACAGCAGTGTGAAATTCTTTTTTTTTCACATATCCCAGCA
TGTGAGAAGGTTGGGGTCAGAGGGCAGGGTCAGCCATGATACAGCACCCCTGGAGCAGAG
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ATAACTGATAACTGTCCTTTTCACTCACAGTATCACAGAAAGACCCAGTACTGAGAAAGA
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AAGGTTACACCATAATGTGGGTACATCCTGCAATGACAACAGTTTTGGCATGACCGTGAA
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TGGTGAAGGCCTCACTCCTTGCAGTGGAACACCTGGGCCAGGGCATGGGGTGGCTCTATG
GTAATCTGGTTTATGCATGATGCCAGGTAGTGTTGGGCGATAGTCAGATTGTCCTATCGT
TAGCCTGTGAGATCGCTGATACACGATATTACCTCGCACAGGGTGGGGCAATAGTTATTA
TTTGCTAATTTATTTACTAATAATAAACTCTTTAAATAAACTTTTATGTAGCACCTTTAA
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TCATTGCAAGGACTTCAGTATTGGAGTGATGTGTTCATTTCTCCTGACTCTAGTCAGGAT
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AGGTTGCACGTGTGGGTCAAATGACAAACTCGAATCAAACATAACTCCTAAATTTTATCA
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TGGGTCATCCATGTTTTTATCTCAGAAATACAATTTGAGAGAAAAGGAACATCCACATTT
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TCCAAGAGGAAATATATAAATACTAAAAAGTAAGGGGCCTAAAATTGATCCCTGAGGGAC
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ATCAGAGAGATAAGATTTATAACTTATCTCTCTGATCGCCGGCAGTTTGTTTTTAAACCA
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GAGAACCAGAATCTGTGGCTATTAACAGATCACTGTTGACCTTGACCGAAGCTGTCTCTT
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TGATATGGGGCAATAGTCCCGGACCTAGATTTCCCCAACTTGCCGTGTGACTTCAAAGGA
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GGGGCTGAGCCAAGATTCTTTTCCATCAAAAAAAACTTTTTAAAATGTACTTCTAAATAG
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TGTCAGCCAATAAGACACGAGTACTTCCATGTATTTTCCTGTAAACACTGTCTGATTGGT
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GTAATGTAACAGAACTACCCATTAGTGCCAATTTTAATATTGAATCCAATCCATGGTCTT
GACACAGCTGATACCTGAAGCAGTAGTGAAGAAAACTGTCTATAATAATAGTGTTTTGTG
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GGACAGATAACACATAATAACAGATAATCATACAGAACTATCAGTTTCAGAACTATGAGT
GGCTTCTTGAGGAAGAACTTCCATGATGCAGTCTTCAAATTGGTCTAAAATAAGGAACAT
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CCTCCTCTCAAATGGAGCACTGCAGTAGTGATAATATTTTGAAGTGTCCTTGATAACAAT
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TACCCATTCAACCCCCCCATCCCCCCCACACAAAAAAAAACGAAAAGCATAAGTAATTTC
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GTGAAAAATACTTTAATTTAAATGTAGAGTAAAATGAATAAATAGCATTACAAAACAGCT
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GCCTTCCAAGAGGAGGACTATACCATGGGGAGTGCTTCTCTGAATCGTTTCATTTCATCG
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GAGTCGCACTTAAATCACAAGACTTGCGACTTGACTTGACTGGACTCGTGAACAACTGAC
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ATGTAATCTTCAGATCGTTAGATGTTTGCCAAGAAGAATGGGCAAAACTCTGAGTATCAG
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ATGTTTTTATCAGTATTGCACCGCCTGAATTTTGGCCGTATACCTAGGGTCGTTGTCCTG
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CCACAGTGCTTCACTGTAGGAATGGTGTTCTCAGGATGAATGAACAGTGTTGCTGTTCTG
CTAAACATTTGTGCCTCATAAGACCAAAGAGTCCTTTTCTATATCGACCAAGTCTCCAAC
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CCAGCTATTTCACAATTACCTTATAATGGCCTCTTGGTTGCTTTTTCTAACTAATCTCCT
CTTTAGCTGCTCACTGAATTTTTGCTGATTTTTTTCAATAATGGATTTCACTGTGCTTTG
TGAAATGGTCAAAATTTGATATTGTTTTATAACCAAACCCTGATTTATACTTTACCGCAA
CTTTGTCCCTGACTTATTTTGATAGCTCTTTGGATTTCATGATGGTGCGTGTTTAGGTGT
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ATTGTTACACTGGGACTAATTTAGAGGTTTCACAGCTGGGTCATTCCATCGCAAGTGGTC
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GTGATTGCCCCTATATATTGGCATTGCAAAACCACCAGTTTTTCATTGTATGAAATATAT
ATATATATATTTTTTATTTTAAACTTGGTTTAACCATGACAGTCATCTTTGTGTCATGGC
ACACAACAAATTTTGGTTATACAGCTCTTTACGGAAACCTCAATATCTTGGCTCAGGATG
GTCCTAGCTCCTTGGGACAAAAGCTGATCTCTAGAACACATTACAAAGTACATGTACATA
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GGTTTCCTGTGTTCAGGTCATGTGCACATACCTAGTTTTTATGTGCTTGGGTTTTGAGAC
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AATCAAAGGGGAAGCTAACACAAAAGTATATTAGAGACTTGTGCAGCAGCAAAACAAGTG
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AAGGTCGCAAACCACTGTTAGACCTTATGCCCCTAGATTGCTGGCTATTATGAGATAGAA
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TTTGACTTGCAGTAAAAAGAAAAGGTTTACAAACTTACAATTTCAGTCCCTTTAATGTTT
ATAAATGTGTTAAAGGAGCACTCCTGATGCATGACAACATTGTGAATGACTGTTTTAAAG
GTATGTTTGACATGATGGTCCGAAATATTATTATATAGGCCTATCACTATAATATTTTTA
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ACAAACGTAACACAAAAGTATTGCATAGAGGCCTTGGAAACTTTCCATGTAATTTACTCT
TTAACATGAATGATTTGATATTTCCTATTTTCTATTAAAGCAGTTTAACTGAATTCATTA
ACCCATTGGCAGCCTCAACATCTGCTTAGCTGCAGTGTGGAAGATGAATTACTATAGCAC
TTAGAATTAAACTCATACATTTGGGTTAACAGGAAGTCAGTATTCTGTTGTTGTTTTTTT
TAAATATAGCAAAGCAAAATAGTTTTTTAAATTTAATTTGTAAATAAGATGTCACCAAAT
ATATGGTTTGAATTCTGTGCTTCAATGCTATCTATGATTCTTACAGAAACCAGACAAAAC
AATCATTCAAAATTCTCATATAAAGTGGTATTAAGACTTTATTCAGAACTTATAAGAGTT
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TATGGTAAAGAAGGAATGGGGTCCCTTTCCAGTTAACCATCTGTGCACTGGTGATCTTCC
CATGAGGAGTTGCACGCCAAATGCATCAAGTTTGTCCTTTCCACAGGGCGGTTTTCAAAA
CAAACTGTCATGAATCCATGGGATGACGCCACTAACTCCCAGCAGGCTGCAGGAGAGGAT
TGGGAATGGAAATGGAAATGGCTGTCTAAGAGGATATCTAGCTCAAGGTGAAATTAAATG
CAGGGTTTACAGATATTTCAGTACATCTACTTCTATTGCCTGAAAAACAGAGACAGATGT
AAATTTATAAAACTTTTAGATAGACCATAACGATTCTTGCCTAAGTGTTTATGAAAGATA
ACACTATTAACATACTGCACTGAAAAAGTGGCTTCTCGAGAAAGAACTTCTGTGATGCTG
CCTTCAGATTGGTCTAAAATAAGGAACATTAGAAGACAGCTGTCCTCATGTCACCTTCTT
GATAATGCAAACACTGTGTATCTAATAAGCCTCCTCTCAAATGGAGCACTGCGATAGTGA
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GCTTCATTAAGACAATTAAATCTCACAGCTACAGTAATTACAGTAATACAGTAGTTAAGC
ATAACTATAATAGTTATCATAACTAATGTTACCTCTCCAGTAGAGCTATTTGATTTTATT
GGCTAGCCAGGTTCACTAACAAACTAACATTAGTTAGTAACATTACTAACTAACATTAGT
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GGAAATTTGTAGCCAAGGTCACTAGCCTCTGTTAGCCCTCATGCTCACAACTGGACTGGG
AGTGAAATAGATTTCTGATTTTACCTGAATGCATATAGCTTCTGTCTCAAAGTTTTGCAA
ATATGATGCAAAAAGTGAGAATATATTTTCTACTTACAATTGGATCTTTCACTGGCGAGT
ATCTCTTCACAACCTGGCCTTTTCGGTCAATGAGGAACTGCACAAATCACACATCAGACA
TCATTGTCAATTTTTTCTGCGCTAAAAGAGCATTTAAGATAAGATAAGAAGATGTACCTT
TAATGATCCCCCATAATTGAAATTCAAATTGACAAAGCAGCACAAGTAGGATGAGTAACA
TGAAAGAAAGAAAGAACAAAAGAAAGAATGAAAGAAAGAAAAAAAGAAAGAAAATAAATA
ATTTCCATAAATACCTATACAACAGAAATAATAGAAGCAATAAAACAGATCTGTGTGTAT
GTGCATATGCTAAAGTTCTAATTGTATATGAACATGTGCAATATCATCTGTATTTATATA
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TGAATGCTCCTGAGCCTCCTCAGCTCAGCATAGAGAGGATGAGACAGATTGTCCATGATA
GCTTTCAGCTTCCCTCTCATACTCTTCTCAGTCACTTACTCCACCCTGTCCAGTTCCATC
CCTACCACAGAGATGGCCTTCCTCACCAACTTGTTCAGTTTCTTGGCACCGCAAGTCCAA
ATGCACCTACCCAGCACACCACAGCAAAAAGATAACACTGGCTACCACAGACTGGTAAAA
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CTCTGTCCTTTCTTATAGAGGGCCTCAGTGTTGTCTGGCCAGTCCAGTTTGTTACTGAGT
TGCACCCCTAGGAACTTGTAGGTGTCCACAATCTCCACTCCCTCCCCCCTTATGGTGACA
GGGGTGGGGGGCCGCTTGCACCAGTCCATCACCAGCTCCTTGGGTTTCCCAATGTTGAGC
TGGAGGTGGTTGTTGTCGTACCATCTTATAAAGCTCTCGATCAATTTATTATCTGTGATA
CACCCAACAATGGAGGAGTCATCTGAAAACTTCTGTAGGTAGCACGTTCCAGAACTGAAC
AGAAGTCAGCGGTGTAGAAGTTGAACAAAAATAGAGACAGTAGAGTTCCCTGGGGTGCTC
CAGTGTTGCTAGTCACCACGTCTGACAAACAGCCTTGCAGCCTGACATACTGCGGCCTAC
CAGTGAGGTAGTCTGTAATCCAGGCCACAAGATCCTGGTCCACCTGCATCACAGAAAGCT
TCTCATCCAGCCAGAGTGGCTGAACCATGTTAAAAGCACTAGAGAAATCAAAGAACATGA
TCCTCACAGTGCTTTGTGGCCTCTCCAGGTGTGTGTAAGCTCTTTAAAGCAGGTAGATGA
TGGCATCCTCCATACCAATATCACCCTGGTATGCAAACTGCAGGGATACAGGCAGTTATG
TACCATGGGCCTGAGATGCTGCAGAGCCAACCTCTCAAGGGTCTTTATTACATGTGATGT
TAAGTTGAGAGCACTGGGACGTCCTTTCTTGGGCACAGGGACTATGCAGGATGTCTTCCA
GATCTTAGGTACCTTCTTCAGGATCTGGAAGAGGTTAAAAAGATGACGAAACACTCCTGC
CAACTGCTCTGTACACACATTAAGCACCCTTGGGTTGATGTTGTCAGGTCCTCTGGCCTT
GTTAATTAGTTAGTTGACGTTTCACCTGGCTGGTCATGATTGTGATGACTGGGGTGGTTG
AAGATATGGCGAGGGTGGGGATATGGGGAGGAGATGATGGTGGTGGTAATGCTGTCTTCC
TGGGTGTAGGATGTGTATTAGGGATGTAACGATATCAACAATCTAGTAGTCGGTACCGAT
ACCACCAAAAGTACACGATACTTGATACCAAAGTTGATACCATGATGTGGTATAAAAAAT
TTTTTTAAAAATTAAATTAAAAAACTCTCCTGGAGGACATCCATTTCTGGCTGATACTGG
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