SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003351_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein P (SelP)
SpeciesIctalurus punctatus (Channel catfish)
Transcript IDSPT00003351
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003229_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003351_2.0 # Transcript # Selenoprotein P (SelP) # Channel catfish (Ictalurus punctatus) # Full length # Forward
TTTCGGGCGCTGTCGGCTCTGTGCTTGGCCTCGCTCCCGAGCCTGCTCTGGACTTCACCA
CTGTTCGTGGAGAGGGACAACAACCAGTCAACCGTCTGTAAGCTCGCACCTCTCTGGGAC
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CCAGGGGGCGCTGTATCATGCCTGACCCTGCACTCTGACCCCAACTTCCTAACATGCTGG
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GCTAGCATCTAAGTGTGCAAGTAAGCAAGTGTTCTAGCAAGTGTTCCATGTATAGCAGTG
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TGTTTAGTTTATTTTCCCTCCTGATCTGTAACCTTGCTCTGTAACACACTCTACAAAACC
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TTTTTAAAAAAATGCGTAAGAGTGCTAGTATACAATATACTTGTATGTTGGAGTGCAAGT
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GTAAGTCTGCTAGTATGCACGCATGCTTGTGTGCTAAGGTGCAGTACGCTGGTATGCACG
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TGAGTATACTAGTATGCACTAATTAAGTACAATGGTGTATATTACTGAGTATATTAGCTT
GGATTTATGAATGTATAGTAGTATGCAAGTATGCTAGAATACAACCTTTCGATTCTTTTG
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GTAGTTCTAAGCTTCCCTTATTTTGTTAGTAAGATTAGCCTCGTAGCCCTCTCGTAAATG
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GTGTGTAGCGAATGTCCTTCTCAAAGGAGCGCTCTTATAGAAGAACAGCGCAGGATGAAT
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ATCGTTCTCAGCCTTCAGAATTCCATCGTTCCGAACCTGTCCAAAAAAAATTACCATTAA
ATAAATATTTAAGCAAATGGAAAAAAATTTTGACTTATCGCCCTACTAAGGATCCTAGTA
TCTGAGATTAAGTTAAGTGTTGCTGTTTATTTCACGTCCTGTTTCCTGCTTCCTGTTTTG
TACTTCCTGCTTTTTGAAAATCCATACATTCCTAGTGATCGCGTAGAACTCAAAATTGTC
GCTTCCCGTCTTTTATCCGGACGGAGATTCTCCGCTTCAAAAGACGAAAGCGTAAACGCA
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ACGACAGGCATGTGGTTCATGAACGCTGACGTTGGCACCTTTACACATGCTAGAGAAATT
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GTCTGCGGCTTCAGAGGCGAGGAAAACAAACACACGGAGAGGTTATGGGTGCGTCACGTG
ATGTTAGGATGTATGTGTGTCATGGAAGAGGAGATAAGGGCCGGTGCACTGGGGTCACTG
TGAAAACCATTTCATCATGGATGGCAGGAAGACGTGCTGAGGTTTGGGTTGTGATGGTGT
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TACACACTTACTATACACAAGCTTAACAGGCTGAATGATGAAGCACTCGTTTTGCACACT
AGCTTAATGTTTTCGATCATCTGATTGATTAGGGCCTCATGAATTTACACATCCTCGGCA
GCAAATACGTCTTATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGATATGTTGTACGTTTATCCACTG
GCTCGAGTTTTCCTACAAAATGCCTTCACACAGAGATTAAAACCAAACTGTGGCTCTCAG
GGAGCCCTGTGATTTGAACTTAGCATCAAACCCTAACCACTGAGCGAAACCGCCAGACTC
TTGAAGCTTTGAAGAGGTCCAAATCCTTTGCTAATTAAAGATCTAGGAGATTTAGTGTTG
ATCTGTTTAGGTGCCTAAACAAGCTCATTCATGCGCGACTCTCAATTTATTCATTGATAA
TTTATCTCACTTGGGACCTCCCTGAATGCTGTTTGGGATTTACCTTATTTATTTGTGAAA
GGGAGAGCCCCATCTGTGGGAGAAGGCAACCATTTCAGCTCTCGCAAACGAGCCTCTATC
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GGTCAGCTAGAGGAAGGGTTGTTTGAGGAGGCAGGAGGTTTATAATAAGGAGGAGGAACG
TACCCAGGAGTGAGTAATAAAAATGGATTCGGTCGTGATCCATGTGAAGTTAAAAATAAA
TAAATCAATCAAATGGATTTGATTTTATAAAACGTGAACGATGTTACCGTTAATCTACAA
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ATTAAAGAATGTCACGTCATACTTTTTATCCGTTAATGTTGCGGAATGTACACAAAACCC
GCACCCCCCCCCCGCCCCCCCTTCTTTAATTATTAAGGTTTTTTTTCTTTAACACAGAGA
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ACTGTTAGGAAGCACCGACACTGGAGACTCCTTCCATAAACGTTGAATAAACGCCTTACT
CGCGGGAAAACCACTCCAGCAGATATGCAACGGCCGTTCATTAAATTCGATTCGATTTCG
ATTAATCACTTTCTGACCGATCAGGTTCAAACATTCAGCGGCACTGCTGTATGAAGCTAT
TTCAAAATCATTTATAATTGTAAAGTGTGGGGTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTATAAAGT
ATTTTTGTTAAAAAATAAAGTACTTTTCATACATATCAGTTATTTGATTTAACACTGCTG
GTATTATTCAATAATCAGTAATATTCAGTGGTTATTTTTGGGATTTCAATAAAGTTATTT
TAATGTTGAGATTAATGATGGAACTGAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAATCATTTATA
ATTTTAAATTGTGGGGTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCAAGTCTTTTTGGATTTTTAA
TAGTAAATGAATAGCACCAACACCGAAATAATATGCTTGCTCAATTGTAAAACTATACAG
ATGTAACTAAAACAAATTGTATATGGAGATATATAGAATTAAACCAACTTCCTAATGCCT
TTTTAACAAAAATGTATTATTCATTTTCAAATAATATTCACAAGATTGTAAGAACCCGTA
CGTAATAAATAGCGGTAGCCTATTTTGAAAATATTTCATAAATATTACAACAGAAAATCC
CCATAAAGCTTTACAGTACAGTTAGCAGTGCGCAACTTGCTACACAGAACAAGCGATGTG
GGAATATACAGCTATAGATTATTGTAATAGAATAACATTTGTAAGACTCCCACAGGCAGC
ACTGAGGATCGAAGCCAATGTTTTTCCCAAGCTGTGATTAAAAAGGTCACTTTTCCTGAA
CAACAAATGTATGATTGCTTAGAGATTGTCTCACATGTTGTGTGCACAGTTTTGTTTGGA
GGTCCTATTTTGCCCAGTGGCGCCATTTCTCTACTCCTGGACTAAAAAATTTCGTGGACC
CAGAAGACTCGCAGCTTTAAATATGCATGAGTGTTGCAGCGAAGTTTCAGATACAGGGAT
TGCATCAGTATGAGCTCATTCTGCCTGGCCTTTGGCTGTCCCTTGGCCTGCACATCACGA
GGGATGTCGGTCTGTACAGTTTCTTAAATTTGCATTGTGCAGTCCCCCAAGGTTCCTGCT
ATCGCTTTGCTTTTTTTTCTTTGTTTGTTTTCTTCAAAATTTGTCGATTGTCGGTTTAGC
GTTCATGTTTAGTTTGGGTTCGAATGAAACGTACGCAGATTTCCCAAGGATACTCGGGTG
TAGCGACGGCGTGTTCGGTCGCCCGAGATTCGTCTGTTGTATCGGATAGCCGACCTAGCT
AGTCAACGGGTCTTCGTGCAGAGTGTTTGAGTCATTATGCTGGTAAACTGTTGGTCCAGA
AGGTATTCATGACGTTATGTCTATCCCAGGAACACAGGAATGAACCTAGTCCATCACAGG
ACACCGTGCAACACGCATTCACACCTAGATTTACAGTTTAGCATCACCAGTTCATCCACT
AGCATGTTTCTGGGAGGTGGAAGGAAACTGGAGAACCTGCAGGAATCCCACATAGTCACC
GGGAGAACACACAAAATTCCTCACAGAACCTGGGATCAGGATCGAACCAAGGACCACAGG
TCTCTGAGATGGTGAAACCTACTGCGCCATCACATCACCATATACGTGCTTGTACATATT
TGCTCTTTCCATGCTTTATTGTCCATCATGACCTCAATAGCTAACGTCAGAACTTCCAGA
TTTCTGGTATTGTAAATAGACTAGGAATGATTTCATTTTTATTGTGCTCAATGCAAAAGG
AAGGTTATGTTTGCCCGCTCTCCATGGAGTAGCTTCTGACCTCTTTATGCTGGTGTCCTC
CTGCTTTGCATTATTCACAATGAAACAGCCACGGCAGACCATCTCTCCATGGTCCCCTCA
CGCCTCCACTGGAGACTTCTCAACAGAGCACACATTCTTCTGGCTCACACACAAAGGGCC
TCGTGCACATGCGTATTTCCCAGGTCCCTGGCAGTATTAAATATTAATGTTGGTATAATT
TCTGAAGCTCCTAAGGAGCTGAGGAATGCGGGCCCTGCAGTCATCGGTGAGATGTGTTTT
TCCCAGTGGCAAGACGATCGTCAAAATCTATTTGGCACCGAGTAGAGAAACAGCTCGGTG
TTTAAAAGCTTATGACTTTATTCAGGCTGGAGAGACCGCGTGTTCATGCGTTCCAATTGA
AAGCGAGTTATTCGGGTAAACAGCATTTTTGGCCAGCTGCTAAAAAAGGAGGGAGGGGGT
ATAGAGGTATCCTTCAAGGTATCTAATTTTGGCCAGGGTGTCCTGGTTTGTATCCTTCTA
ATTGAAGGCAAACCCATCATTTATTCTCCAGATAAGCATGAGTTGAGAGTCTTACTCCAA
GCAAACAGTATGTACTAGGGGTTGCACGACTACTAATGTGTACCTAGTCGAGCAGTAGTT
TAAAAACTAGTAGTCGTCTTTTTCATAGTCAAAGCAAAACCTGTTGCTTTTGTTGGTCTT
GTTTCAGACCGTTTTATTTGTGCATAATAAAAAAAAAAAAAAAAAACACGGCAAACTGCA
GTTCTATTAACAACCATACACGGACTACAAATTAGTAAGACAGCATGCTAAAAGTTATAA
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CAGTTTGAATTGTGTTGATTAGTATGGGTATGGTGTGTGTTTGCGTGTCTCCATAAAATG
GTGCAACCGCTGCTCAGAGTTTCCCCGCACATTTATTCTCCATTTTGCCCACTGTCATTC
ATGTGCTGAGCACTGAGAACCACTTTAACATCAAAGCCTTGTGCACATGGCCACCTCGCT
TGTACGAACATCCTTTTGATTTTCTGATTCACTCTCTTTTGCACTCTGTCTTTTCCCAAG
CATCCTTGCCCCCATCTTTTTCGGTCACCTGGCACCCACAGAGGGCCGAGTTCTCCACCC
GAGGCCGTCGTGCCACCGAATTACATTGCTGTTCCGCGTTATTAGATGTGACACTCCAGT
GAGATAATGGAGCCTTTCTTCATCCCCATTTGAAACCCTAATCGCATTTCTTTGATTAAT
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CTTCTTTACGATGCGCTTTTGAAACAGATGAAGGGGAGAATAAGAATGATATACATATCT
GTTCTCCTCATCTCCTCCCGCCTGTGCGTGCTGGGATGAGCCATCTGAATGCAAAGGCTG
GAGGTAGAGGAGGGTCATGAAGTGATGAAGCTTCTGTCTGATGAGGTTGGATTGCGGACA
CTTTTTAGCCACATCGCGGGGAACCTGGAGACTATCCCAGGGAGCATGGGGCACAAGGCG
GCGTACACACTGGACGAAGTGCCAATCCATCGTAGGGCTCAATCGCATACACACTCACAC
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GACTGGGGGAGGAAACCGGAGTACCCGGAGGAAACCCCCGCAGCACGGGGATAATATGCA
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