SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003351_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein P (SelP)
SpeciesIctalurus punctatus (Channel catfish)
Transcript IDSPT00003351
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003229_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003351_2.0 # Transcript # Selenoprotein P (SelP) # Channel catfish (Ictalurus punctatus) # Full length # Reverse
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CATATACACCATCTACATAAGCACTCTCACTTCCCAGAAAGAGTAAAAATGCACATTTTT
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GTTATGGACGTGAAAGTTTCTTTTTGAACCCCTGTTCTCCTTCCAACCATGCTGGTAGCA
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TGTGTGTTACGCTCTCACGTCTACGGCACTGCTCACATTGCTTTTAGGTTGGAGCCATCG
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TTCAGCGAGACAAAATTTCATGAATGCTGCATCTCTTCTACCCACAGCTGACTGAGCGCC
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CCTCTCTTCTACCCCTTCCGACCACGGCTCTGAGACGGGTGAATTTTCTGGCAATTACCA
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CGACCGAATCCATTTTTATTACTCACTCCTGGGTACGTTCCTCCTCCTTATTATAAACCT
CCTGCCTCCTCAAACAACCCTTCCTCTAGCTGACCAAAGCCATAAATCTCGCTCTGCCAG
GTCTCAGGGGTGATTGATAAGCTCTCAGTGATGCTGATAGAGGCTCGTTTGCGAGAGCTG
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ACGTCTTCCTGCCATCCATGATGAAATGGTTTTCACAGTGACCCCAGTGCACCGGCCCTT
ATCTCCTCTTCCATGACACACATACATCCTAACATCACGTGACGCACCCATAACCTCTCC
GTGTGTTTGTTTTCCTCGCCTCTGAAGCCGCAGACCGTCCGTGGATGTCTCTCGGACGCC
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CCAACGTCAGCGTTCATGAACCACATGCCTGTCGTCACCTATCGAGACGGTTTTCGGTGG
GGAAACGTGGTTTGGAGAGACACGTTTACGCTCGTATAACACGTGGCTGTAACATGTTCA
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TCCCCTCTGATGATATCTGAGAAACGCCGTCAACCTCGACTTTTTTCTCGAGTTTTCTTT
CATTTAACGCAAAAGACGTTTCACATATCCTCAGTGAAAGTGTATCATAAATGCACAACT
ATCGGCTATGCTATAAGCGTATCTCGGTCTAAATCCAATCCTGTTCATGGCCGAATCATG
TGTCTTATTTTAAGTCCGTAGAGAGAAATTCACTAGGCACTAAGGGTTGAATCTGGACTC
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TGAGTGATTCGTAATTGCAGCTTCAAGCGAGAGTCCGGGATTCTCCAGGGAAACTGGGGG
AAATAACTCGAAACTCCAGGCTTTGCAGTGTTGAGGATGGTTGAATCCCAAATGGCTCGC
TGTTCCCTATATAACTGCACTTCACTGGGTAAGAGAAAATGCCTAGGGCACTATATGTGC
ATTAGGGAACCATTTGGGAGCCAGTGCCCTACTTCCTAGTTCAGTGCACCACACTATACG
GTATGAAATAATGGTTACTAAGGCCTAGGTAGTGCACTATGTGTCTGATAGGGAGCCATT
TAAGATTCCGCGTAGAATATTAAATGAAAAACTCTACAAAAACATAAGACTGTGTTCTAG
TCGGGTCAGCGAAAAATGGCATCTGGAAGAAGGTAGAGATGGGAATCGCTTACATAAAAT
ATAAACCGCTTCAGTGTTTTAATATTCCACACACTTCATTACATACACTTCAGTATCCTC
TACACGTCAGTATTCCTTACACTTCAGTATTCTGTAAACTTCAGTATTTATGTACACTGT
AGTACTCTGCACACTTCAGCATTCTGTGTATTTTATTATTCCTTATACGGAAATATTCTG
TACACTTCAGTATTCCGTAAACTAGAGCATTCCATATCCTTCAGCACTCTGTAAACGTTA
GTATTCCCTATACTTCAGTACTCCGTAAACTTCAGTATTCCATACACTTCAGTATTCTGA
ACATTTCTGTATTCCTTACACTTCAGTACTCTGTAAACTTCAGTATTCCATACACTTCAG
TATTCGGAACATTTCGGTATTCCGTAAACTTCAGTATTCCATACACTTCAGTATTCGGAA
CATTTCGGTATTCCTTACACTTCACTATTCCGTAAACTTCAGCATTCCATATACTTCAGT
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ACTTCAGTACTCTGTAAACTTCAGCATTCCCTATACTTCAGTACTCTGTAAACTTCAGCA
TTCCATATACTTCAGTATTCTGAACATTTCGGTATTCCTTACACTCCAGTACTCTGTAAA
CCTCAGTTTTCCAAACTCTTCCGTGTTCCTTAGAATTCAGTATTCCAATTCAGTATGGGA
TATTTTTTTATATCACCTGAATCTACTGACATAACATCCACTCAGATGAAAAAAAAAAAA
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TCATCCATGATCTGGACACTTTTTACAATAACGCAAATAAAATCGAGCCTAAGAGTGAGA
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AATGGCCCACACTTAAAGTGACAGCCGCATTGAGGAACGGCCTTCATGTGGCATCTCTGG
GGGAAAGTGACATTTAGCGGCACACCCAGAGAACTGTCAGCTATTTACCGCGCGCGACTC
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CGCATTTAGGCAGGCGGAAAAGAAACCTCCTCAGGCACCTTCTGTCAGCGGCGTGACAGG
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ATTTAATAACCATACACAGGACATGAATTGAAGAACTCTGCTGGCTTTTCAAGAGAAAAC
AGAGAGTCCATCAGAAACGCAAGTCTTCACTTGACATTTAGAGCCTGCATCGTTTCGGAC
CGAGTCCATGTAATATTCCAGTAGCTTCCTGGCAGCAATTCCGTATCATTACCTTCCTTC
TCCGGAAAAGAAGCTCGGCCCTGCTGTGACACATGCCACTCAGGTGCTAGAGCCGCAGTT
TTCAAGCACAGCTGCAGGGTTCTTCAACATAATAACTAGGTTATTTTCTACAACTATCCT
CCTCCATACAGCAGCACACACACCGGAAAAGATAAGCAGGATGCTCGGCTTGTCAGTCAC
CGGATACGTGATTGACACGAAGTTCATTATCGAGCTGTTTTGTTTTGTGTTTATTTTTTT
TTTTAAATCAGTTCTCAAAAATTGTAAAAAATAAAAAAATTCAAAATATGTAAAAAAAAA
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GCATACTAACGTAACTATCTTCTTGCAAACTTAATCGCATAATTACAACACTTACACATA
AGCACTACTTTATTTGTACACTTGTATACTAACAAAAGTACTTACACTTTAGTTCACTTG
CGTACTTGCACACTTACATACATATCAGACTTGCATACTAACATACCTGGATACTTGCAT
ATTAGCATTTTATTAGTATAATTACCATATTTAGTAAGCATACTTGCATACTAATGTGTA
TATTGATGTAGCACACATGCACACTATTATTGAATACTTCCACAGTTTCTAACATTCAAG
CACATGCATACTAACAAACATATTTACCAACACACTTACATACTAGCATAGCTGTATGCA
CATTCCACACTTGCATATTAGCACACTTCCATACTAACATACTTACAATACTAGTATATT
ACTAGGATTACACACTAGCGTTCATGTGCTAGTGATGCTGAATAATTTGACAGACAGAAG
ACATTGAGCGCCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGGGT
TGTGTGAAAGGCAGTGGCGTTGTGGGCGGGCTCAAACCCTTCATTAAGCTGTGATTGGAT
GCTGTTGATCCTAGGACTGGTGAGACAGATGAAGCGTCATGGCAGTGAGGAGATTAGATA
AGTAAAGTCCACTCGGGTTTATTTCAATTTAGTCTGATCGCTAGAGCGTTACAGAGGTCC
CTAATGATGAAGGGGGAGGGATGGGCATGGGCTAGGGTAGGGGAGAGGGGGGTGAGGGGG
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTCATCCTTCACACCTTCAGAATA
GATAATGGTGCAGAGAAAACAAGTCCACAATAGAACATTTACGAGAGGGCTACGAGGCTA
ATCTTACTAACAAAATAAGGGAAGCTTAGAACTACCAGTTTAGCATCGTAAACTGTATCC
AAGTCATCACACAGCTCAAAACGTGTCTGGTTGCACAAAAGAATCGAAAGGTTGTATTCT
AGCATACTTGCATACTACTATACATTCATAAATCCAAGCTAATATACTCAGTAATATACA
CCATTGTACTTAATTAGTGCATACTAGTATACTCACAAGCTAGCTTCCATACTTGCATAC
TTACACAACTGCTTAATAATGCACGTGTATACTAGTACACTTGCATGCTAAAATTTTAGC
ACACTTACATACTAACATCCGTACACACTTTCACGCTTGCACTCTAACACACATGCATAC
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