SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003358_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein R (SelR)
SpeciesIctalurus punctatus (Channel catfish)
Transcript IDSPT00003358
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003236_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00003358_2.0 # Transcript # Selenoprotein R  (SelR) # Channel catfish (Ictalurus punctatus) # Full length # Forward
ATGGCTTTTTGTTCATTTAAAGGAGGAGAGATCTTTAAAGATCACTACGAACCGGGTAAG
TTCTCGTCGTGGATCTGCAACATTCATGCTGAAACAAGAAACAGGTTTTTACCTGCATGA
CAAGTTTAAAGACGCGCCTCTGTAACTTCCAGTCGCATGAGTGTGGTAAACTATTCCTTT
CTTTCGAGACAAGATATGCGTTTTAATTCAACTTCTAAGATGAGCACTTATTACACAATG
CGCTTAAGTTACAAAACAGCGGTTGTGTAATTTACCCTCTAGTTTTCATCAGCCTACTGA
TTACAATATCGTGGAAAAGTTCATTTCCCCCCTGTAATTTAATTCAAAAAGTGGAACTTT
CATATATTGTAGATTCATTACACCTAAAGTGAAATATGTCAAGCCTTTTTTTGTTTGAAT
CTTGATGATTATGGCTTACAGCTTATGGAAATCCAAAATCCAGTATCTAAAAATATTAGA
ATAAAGAATTTATAATACAGAAATGTCGACCTTCTGAAAAGTATGTTAATTTATGCACTC
GATACTTGGTCAGGGATTTAATCCTTTTGCATGAATTACTGCATAAGTGCGGCGTGGCAT
GGAGGCAATCAGCCTGTGGCACTGCTGAGGTGTTCTGGAAGCCCAGGTTGCTTTGATATC
GGCCTTCAGCTCGTCTGTATTTTGGGTCTTGGGTCTCTATGGGGTTCAGGTCAGGCGAGT
TGGTTGGCCAATTACAGTAATATCACGGTCAGCAAACCAATTACTAGTAGTTTTGTCACT
GTGGCCAGGTGCCAAGTCCTGCTGGAAAAGGAAATCAGCATCTCCAAAAAGCTTGTCAGC
AGATGGAAACATGAAGTGCTCTAAAATCTCCTGCTAGTCACTGCATTGACTCTTGACTTG
AGAAAACACAGTGGACCAACACCAGCAGATGACATGGCACCCTATATCATCACTGACTGT
AGAAACTTCACACTGGACTTCAAGCAACTTGGATTCTGTGCCTCTCCATTCTTCCTCCAG
ACTCTGGGACCTTGATTTCAAATGTAATGCAACATTTACTTTCATCTGAAAAGAGGACTT
TGGACCACTGAGCAACAGTGTTTTTAGTAAAAAGGTCCATCCATCCATCGTCTATACCGT
TTATCCTTTTCAGGGTCACAGGGAACCTGGAGCCTATCCCAGGGAGCATCGGGCACACCC
TGGACAGGGTGCCAATTAGTTAAAAGGTGTTTTGTGTTAATTATCTGATTATAGCTCTTC
TCATGTTGACATTGCTGTATTATAAATTCTTTATTCTAAAATTTTTGAGATACTGGATTT
TTTCTAGTATCTCATTTCCATGAGCTGTTATTAACATTAAAACAAAAAAAGGCTTGAAAT
ATTTAACTTTATGTATAATGAATCTACAATATATGAAAGTTCCACTTTTTTAAATTAAAT
TACAGAAAAAAAAAAACTTTTCCATGATATTAAATTTTTATGAGATGCATCTGTAGTAAT
TGCGCATGCCAATTCACTTCAGTAGGCTGATGAAAACTAGAAGGCAAGTTACACAACCGC
TGTTTTGTAACTTAAGTGCATTGTGTAATAAGTGCTCATCTTAGAAGTTGAATTAAAACG
TGCCCCCACCCCCTATCTAACAGTTCTGAACTGACTCTAATCTCTTTCCACTTTTCTTAT
TGTCTTTATATAGATTAATCATTTACTCACTTAAGAAGACACATACTGTGTGAGAGGTCA
CCTTCATTGCCACTACACCTACAGAAAACAATGATTTAAGATAATATAAACATTTATTTT
TCTTTATTCCTGGAGGGATATTTGAATGTTCCAACATATCAGTATGTAAAGTGTAGCACA
GTAAATCTTTAAAAAAAAAATAATATAAAAAGTGAAAAGTAAGCACAAAGTAGACTTTAT
ACTACTGCACTTGTTTACTAAAGAAAATTTAGCATTCAGAAGTATGGCATTATGACGTAT
TCTATACCAGCCACTTTAATAGGAACACCTGTACACCTGCTCATTCAAGCAATTATCTAA
ACAGTCAAGCATGTGGCAACAGCACAATGCATAAAACATGTAGATAGAGGTCAAGAGCTT
CAGGGAATGTTTGCATCAAACATCAGATCTCACTGGCATGTTTGTTGATGCCTAAGGGGT
TGGTTTCAGTATTTCAGAAGTTACTGATTTCCTGGGATGTTCACACACAATAGTCTCTAG
AGTTTACACATAGTGGTGTTGAAAAAGAATTTCAGCGAACAGTAGGCAGTTGATTATAAG
AGATTTTCAGAAGCGAATGGACAGACTGGTTTCAGCTGACAGGAGGGCTACGGTAACTCA
GATAACCACTGTTTACAACTGTGGTGAGTGGAAAAACCATCTCAGAACACACAACACGTC
AGACTTTGAGGCAGATGGACTACAACAGCAGAAGGCCACTGCAGGTTCTGCTCCTGTCAG
GCAAGGACAGGAATCTGAGGCTACAATGCACACCAGGCTCGCCAAAACTGGACAGTTCAA
AACTGGACAGTTCCAATCTTCAGCTCTCAGACTTAGCCAGAATGGTTGAGGCTGTTCCCA
TGATCAGTTCTGGGCTTGCTAGGGGAAGAACATGATTTTTTGTTTGTTGTTGTTGTTGGT
TTTTACACACAGTGTTCACTCAAACTGTGAATTATTTGTTTAGTGATGACTACAATTGAA
ATCTTAGTCAAATAAGCGACAATAACAGCACCTCTTTATGGTTCTTTTTAATATTTAACT
TGTATTATTTACAACTTAATTTATTTGCTTTATTGGCGTTTAAGTTCAGATTCAGGTCAA
GCGTTTCAACCGAACGTTTTTTTTTTTTTATTGAGATGTAGTCACCCGAGTGTAAATGTC
TTCTTCACGCTGTAGACGGTATTACATTTCATTTGCAGACCACATCTTGCGGTTGTAAAC
ATGAGATTAAAGTAACATGACACGGTCATGAAATAATCTTACTCAGCACCCAGCCTTGTG
AGATTATCATGGTCCACACATAGTCCACGCGCACAGCTGTTATAGTCAATGGGTCAAAAA
AGTGCGTATGCCACTTTCCCTTAGCCTTGTTGGGAATTAGTTATCAGTTGGCTAATTATA
TTTGAAAACCGAAAAAAAAATTTTTTTGCCGCATTAGAGAATGATGACCACAAGCGCACT
TTAATCACCGAAGGGGAAAACAAGCCCTGAAAAAAAATAGAATTCGAGTAAATGGAACTC
ATTTATGTAAAGGACTAATGAGTCACATTTCTCTCTTGAAAAAACCACAGGGCATAGCTC
TGGAAGTACATGGTGCTTTTGGGCTTCATCAATCCTCTGTCTGAAATGAATCCCAGACCA
CTGTGTTCAGGTGCACCACAAACCGGATTTCTGACCACACCTGGGTTTGAAAATAGCTTT
TAATCTTGACCAAATATATTGAAAATTTGTTGCACATGGTTTCAGAGCAGAATAACAAGT
GGGAAATTAGCAACAATATTGAGTTACAGTGGTGCTTGAAATTTCTATATCTCTGCGTAA
ATTTCTATATTGCTGCATAAATATGACTTAAACGTCATCGGATTTTCACACAGGTCCTAA
GAGTAGACAAAGAGAACCCAATTAAACAAATGAGACATAAATATTATACTTGGCCACTTA
TTTGTTAAGGAAAATGATCAAATATTACATATCTGTGAGTGGCGAAAGTATGCGAGTCTA
TAGGATTAGCAGTTAATTTGAAGGTGAAATTAGTCAGGTGGTTTCATTCAGTGGCATGAC
AATCATGTATGAGCACCTTGTTTTATTTAAAGAACAGGGATCTATCAAAGTCTGATCTTC
ACAAAACATGTTTGTGGAAGTGTATCATGGCATGAACAAAGGAGATTTCTGAGGATTTCT
AATCAGGCTGGAAAAAGTTACAAAATTGTCTCTAAAGAGTTTGGACTCCAATACACAGTC
AGAGAGATTGTGTCCAGTTGGAGGAAAGACCATTGTTACCCTCCCCAGGAGTGGTTTACC
AATAAAGATCAGTCCAAGACCAAGATAGTGTAATAGTCCACAAGGTCACAAAGGAACCCA
GGGTAACTTCTAAGCAGCTAAAGGCCTCTTTGACATTGGCTGATGTTAATGTTCATGAGT
TCACAATCAGAAGAACACTGAACAACAATGGTGTGCATGGCAGGGTTGCAAGGAGAAAGT
CACTGCTCTCCAAAAAGAACATTACTGCCCTTCTGAAGTTTGCTAACAATCACATGGACA
AGCCAGAAGGCTATTGGAAAAATGTTTTGTGGACTGATTAGACGAAAACGTAATTTTTGG
TTTAAATATGACACGTTATGTTTGGAGAAAGGAAAACACTGCATTCCAGCATAAGAACCT
TATGTCATCTGTGAAACATAGTACTGGTAGTGTCATGGTTTGGCAAGGACACTTTGCCAT
CATTGATGGAACAATGAATTCTGAAGTATACCAGTGAATTCTAAAGGAAAATATCAGGAA
TCTCAAGAGAAAGTGGGTCATGCAGCAACACAACAACCCTAAGCACACTAGTCAATCTAT
CTAAGAATGATTAAAGAAGAATAAAGTTAATGTTTTGGAATGGCCAGTCAAAATCCTGAC
CTTAATCCAATAGAAATGTCGTGGAAACACCTGAAGCAAACAGTTTATGTGAGGAAACCC
ACCAACAACCCAGAATTGAAGCTGCTCTGTACTGAGGGCTGGCCGATGTGCAGGACTGAT
CAACAGTTACTGGAAACGTTTAGTTGCAGTTATTGCTGCACAAGGGGGTCACACCAGGTA
CTGAAAGCAAAGCTTCACATATTTTCGCCACTCACAGATATGTAAAATTGGATCATTTTC
CTCAATAAATAAATGACCAAGTATAATATTTTTGTCTCATTTGTTTAATTGGGTTCTCTT
TGTCTACTTGTTTGAAAATCTGATAATGTTTTAGGTTATATTTAGGCAGAATATACTAAA
GGCTTCACAAACTTTCAAGCACAACTGTATGTTGCAAATATTATAACATTGACCAAATCT
TTTCAGTCTTAGCTCAGTAACCTGTGTACCATAATAAATATCCATTAATGTGTTTGAATG
TGCATTTTCAAAAAGAATGACATTAAAATGGCTATTACAAGGTATTAAATTAGTATTTAA
ATAATTTGTTTAAGGATATTCAATAAAACGATTTGCAGAGAGGATCACTCACCCTTCAAT
GCAGATTTTTTTCTGTATGTTTGCTCTTACAAAGTGGACAAAATTTAGACATTTTCACTT
AGGGGTGTATTCACTTTTGTTGCCAGTGGTTTAGACATTGATGGCTGTGTGTTGAGTTAT
TTTGAGGGGACAGCAAATTTACACTGTTACACAAGCTGTACACTCACTACTTTACACTGT
AGCAAAGTGTCATTTCTTCAGTGTTGTCACATGAAAAGATATAATCAAATATTTACAAAA
ATGTGAGGGGTGTATTCACTTTTGTTGCCAGTGGTTTAGACATTGATGGCTGTGTGTTGA
GTTATTTTGAGGGGACAGCAAATTTACACTGTTACACAAGCTGTACACTCACTACTTTAC
ACTGTAGCAAAGTGTCATTTCTTCAGTGTTGTCACATGAAAAGATATAATCAAATATTTA
CAAAAATGTGAGGGGTGTACTCACTTTTGTGAGATACTGTATATATATCCTAGTTCTGCC
TCCACATGCCTAGTGTGACAAGTGTGTCACAAGCTATTTACTCTCTTGTGTAGGTATCTA
TGTTTGTGTAAAGTGTGGCTATGAGCTGTTCTCCAGCACATCAAAGTATAAGCACTCCTC
TCCCTGGCCTGCCTTCACTACAACTATCCACAAGGATAGTGTCTCCAAACAGGAGGAGAG
ACCTGGTGCACTGAAGGTAAAACTGTTTACTCACACTCAGTCTAATGAACTCACTCGGTG
CCATCTATAGTGATCTGGTATTATTATACTTGGTCTTCCAAAAGTAGAATTATGTTGGTT
ATGTATTACATTTGAACTGTATTCATTTGAGTTTTTAAAGGACCAACACAATAATAAGCA
TCATGTCAAAATCATGGCACATATGCTAGGTTTACTGAGGTTTATAGAAGTAAATTTCAT
AGCTGAAAACGGTTCTAGAAGTTTTCAACCTTCAATCATTTTATTTATATAATCATCGTT
TTAAATGCATATATGTTCTTATGTTCTATTAAATTGTTTGTGCAGTTGCTAACATAGTTT
AACAATATCATTAAAGGTAAATGTAATTATTTTAAGGCAGTGCTATTTGATCGCTATAAA
CTTCCATTGTTTGGTAGTGACATTAACCATACAGCTCTATTTAAAAAATAATACTTTTTT
TCCCTCCATAAAGCTGTCTAACTACTTATGTATTTGAATTGTGCAATATGTTGTAGATTC
GCTGTGGGAAGTGCAATAATGGCCTGGGTCATGAGTTTCTGAACGATGGACCCAAGCATG
GACTGTCCCGATTCTGAATATTCAGCAGCTCACTCAAGTTTGTCCCTAAAGGTATTCACT
TGTATGCTTATGTTCTGATAATAAGCGTGGACTCGATACAGTCCCTCTAGGGCAAAACAA
GTTGCAAGTTTTGCCCGCAGCAACCACAAAAAAACTGGGAAATACTGTACGGCCTGTTTA
TAGCACAGATTCATGTTTAACTCTGTCTGTGCAGCATGTAATCTATTCTAGTGATCAAAA
TGAAACAGTTATAACTGTGTGAATGTCAATTTAGGTGTTATTATACACATATTGCTGAGA
CTCAGATAAATTGTCCCTTTGATAATTCTGCCTTTTTGGGAAACAAGCTTGTCCTAACTG
TTACGAGCCGGACTCAATTGCAGATGAATGTCTTTCATGAACTTAATGAACTTAACAAAC
AGGGATCGCGGTCTAAACTGGAAAAGCTATAATCGAGGTACTAAACATGAGACTAGATTC
AAAGCATTGAACAAAACAACCGCACGTGTCCATTGTAAACAATGTCCGGATAGTTCCTAC
GTAATCCGCGAGCATGTGCTTGCTCTGGTTCGCGCCCTCCGGCTCTCCATGCACGTCGTG
CACCGCAGTGCCATCTGCAGGGGAGATCATGACACTAACACAGTTTGGGGTGGAATCTGC
TGAAAGGCAGTCTATAATTTCCTTCACTAGCTTCTTCTTTTTGGCTCAACAAGCGTTTAA
ATGTGAGGTGACTGCGTTTCTGTGGTTTCTGCACTGTAGTATTTTTGCTCAATTGTCAAT
GTTTTCACATCCGTTCATGTTCCTTGGCATCTGTGTATACTAATTAGTCTATTATAAATA
GTTGCTATGGCTGGCCAGAGCTCAACCTGTTCATGAACAAGGCAGCCCTTTTAGATGAAC
ACCAAGAGTCTACCTGCATATATAAGATTTTTTCCTCTTTATTTCCCCTTTTTTTAATGT
AGGCAATGTTGTAAGTCTTGCAGTGTTGTGTAATTTAAAATTGTTCCATGAAAACAACTT
GCTGCTGTTGTGGCGTTTTTGACCCTCAGCTGTGTATATGAGGCTGCAGTATGACAGCTG
AACTGCTGCTTGTTGAACTGCTGTATGTAGTCAAGTGTAATAGGGGAGGTGATCATTTAC
AATTATTTAAATAGATTTTGTAAAACACAATGCCAAATAATATTTTGTTTAGGCCATTAA
AAGATAGGGATAAGCTTTCATGGAGCAATTTTGGCCACCAGAAAGGCAGACACTCAACAA
AATATTCCAAACCTTGTCTGGTTTAGAAAAAAGGAATAATTAAAATGATCTGACTCATGG
AAAAGAGCCAGAACTCCAGTCACTAATGAATCATGGACTGTGTAAAGGGTATGTATCAGG
ACTTGGATCCTATGGGACCCAGCAAAAAAGTATTTTTGCTCTCATGCGGGCAGGAGTAGA
CAGTAAGATATGAAGTTTGTTTAGGATGTAATGGACTTGGCAGGTTGCTTATGCAGGTAA
CTACGAGAGAAATTAAATAGCCCGGACATGTCCCAGGTGCCCTGCCTACTGATTTGTCCA
CCAAATGTGTATATAAAAAAAAAACCCACACACAGTCATATGCTGGTTTTTGTGTCCTAT
TTACAGATAAGGGTGGACAGTAGAGTGAGCTGATGGATGGAGGAGTGAAGATGACATAAA
AATGCACAGAGGGACTCTGTTCTGTGGAAGGTGTGGACATTTCATGAAGTGTTGTGCTAT
AAAGCCCAAAGTGGAAGTCAGAACACTGATATTTATGGCCACA
Chart Advanced