SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003362_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein R (SelR)
SpeciesIctalurus punctatus (Channel catfish)
Transcript IDSPT00003362
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003240_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00003362_2.0 # Transcript # Selenoprotein R  (SelR) # Channel catfish (Ictalurus punctatus) # Full length # Forward
ATGTCTGGGTTCAATCTTCTGCATTTGGTGACCAAAAGCCAACCTGTTAAACTCAAGGCC
TGCGGGCTTCCCTCAGGTCCACTGGAAGCTGTGTGTGTTGTGCAATGTGTGTAGCGTGCT
CTGCCTCTGCGAGGTCTAACACACGCTTTCCTCTGTGTGTGCACTCGTGAGTCTTTGTGT
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TTCTTTCTTCTTCTTCTTCCTTCTTCGTGATGTATATTGGGATTGCAATATCTTAGGGAC
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TCACCTTTGTACATTTTAGTGCTTTCAGGGGAGAATATACAGACCACAAGGAGGAGGGGA
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TGTGTGTGGAACACTGTCGATCTCTGATCCTGTGTGATTGGTGGATTTTGGCTCCTCCAC
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ATATATTTTTTTTTTGCAGGTCAGACAAGAAATTTGATTCTGGCTCAGGTAGGTTTCTAC
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ATACTCCTCTGAAGGGAGAGGTTGACCTTTTTTGCCCTCTTTATGGTTGATTGCAAGGCC
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CGTTCAACCTACAAGCATGCATGAATTCCCCACAGAAAACAACCTGTAATAGGAACCATG
TGGGCCCACAGTGAAAAATAGGATTTTTCCTTGCACCGAGTGATTTCTGTCTTCACTGCA
GAGACCAGAGCCAAACCTCCTGCGTTGTATGCAGCCCGTGTTGCAGGCCAGCCTCATATA
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TCCACCGATAAAGCTCCATTAGATCAGTGCAGAAACGATCCACCGGGATTCTCCTGCTCT
GACTCATAGGATTTCTATATTCCCCCCGAGAGCTTCCTGTGTCTGAGTGGAATTTTGTGG
CTTTGTAGTTGTGGCCAAGCACTGCCTCCCTAGCTAGGGAGGAGGAAAGGGGGGAGAGGG
TGGCTGAAGCGTGCTGGGTCTGGGATTGGGGAGCGGCAGAGCAGGGAGGGGGGGACGAGG
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TATCGACTCTGTCATGATCACATCAATAATACTACTTTTGCTAATGATGCGACTGTGCAA
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GTTTATTTTCAACACAGACCTCTTCTCCTGCTTCCCTATACCATTTTTTGTTTTATAAAT
AAGTTTTTTAATCTGTTTCGAATCAAGTCAGACTTAAGGATAGAATGACTAGAGAGGGAG
AGGGAGAGAGGGAAGGCTTGCCGTGTCAAATATTTTTCATTGTTACATGCACTTCGCCTG
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TTGCACCACATAGATATGAAGCAAAGTTATCTCGGTCCATGAAGCAAGGTTATCAACTGC
GATTACTGTTTATATTAATGTAGACTGTTTTTGCTGGGGAAGACTACATACGAATATGAA
TGTGTTTGCTGAAGCAGTACGAGAGCGAGAGCTCCACAGCTTCCTCTCCTCCAGACTCTC
CAGCTACCCAGGAAGCCATGAGGAGGACCACCCATGAGCCTGCATGGCCACTCTTTCCAT
TCGCTCCCCTTTTAGAGAGCTGAAATCTTCCACATAAAAGCCATGCGGTACCGCGATAGC
CTGCCACACCAAGGATTAGGCAGACATTTTCTATGACTTTTATTTGACTTCCTCAGCTTT
TGGTTAGACTGTAACCACCTGTAACAACGTGTGGTACATAGAAGTTCTCTGTCTCTGGTG
GAGAGTGTACCATATTCGTGTGCCATTTTCCTTAGACGTTAATATTACATTTGTCATGTT
AAACGGGAAAACCTAGGACACTATGTTCGTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAGCGAATCCTGAGACTCTGAGCATGCTGATATGTGCTTTACCTTTAATAAAGGCCACT
GCTTCATTCTGTCCTTTAATTACAAGGCAAGCAAGGATCTCACTAAGCAATGAAAAGAAA
GTTGGAGAGGGGCTATGCCAAACATCTAGTCTGGAATGAGTTACAAAAATAAACGCTTAG
CGGCGGTTTGGCAGGGTCCGATAAAAAGACACTCCAAGTGCTAAGACAGCGAGGGGAAAG
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CATTTTTTTTTTCTATTTTTTTTTTTTAATAGGATGGCCATCCTTTTTTGATCTGATCAA
AGAAGAATCAATAACACTGACAGATGATTTCTCTTATGGCATGCACAGAGTGGAGACTAG
CTGCAGTCAGGTATGTTACTTATGAGCAAACCAACAAAAACATTTGATTTACCACAGGAA
AATAATGACTGGGTAATAGATCAGTTGAATGTAATGCTAACATGATTAAATTCTGTACAA
GTGAAATGAACTTTGTGCATATTTTCAGTGTGGTGCTCACCTTGGACACCTCTTTGATGA
CGGCCCCCAGCCCACTGGGAAGCGCTTCTGCATAAACTCCGCCTCACTCAACTTTCAGCC
AAAAAACGTTGCTCCTGAAGGGGCAGAACCAAGTGGTGCCACAGGCCAATCGTCATCTTC
TAGTAAGAGTGAGCTT
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