SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003370_2.0
Identity
TranscriptEukaryotic elongation factor (eEFSec)
SpeciesMiichthys miiuy (Mi-iuy croaker)
Transcript IDSPT00003370
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003248_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003370_2.0 # Transcript # Eukaryotic elongation factor (eEFSec) # Mi-iuy croaker (Miichthys miiuy) # Full length # Forward
AAAACCTTAAATTTCAACGTCGGGGTGCTCGGACATGTCGACAGCGGGAAGACATCGCTC
GCCAGGGCGCTGAGCAGCACCGCCTCCACGGCTGCCTTCGATAAGAACCCGCAGTCCCGT
GAGAGGGGCATCACGCTGGATCTCGGCTTCTCCTCCTTCACGGTGGATCTCCCCGATCAC
CTGCGGGACGACAGCGGAGGCCAGAAGCAGTATGAGAGCCTGCAATTCACCCTGGTGGAC
TGCCCGGGACACGCCTCTCTTATTCGGACAATCATTGGGGGTGAGCTCGCCTAGAAGTTT
TGGTGCTAGATGTCACACTGATGACAGCACGTGGAAAGGTGTTAAACGCATCAGTCAGGA
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TGTTCCCTTTGCCAGCCTGCACAATACCAGGACCCTGAAACAAAAGTGCATGTAATGTCT
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AAATGACAAATGATTATATGTCCCGTCCTTTGTTCTTGATAAATATCTGTCTAAATGCTG
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TGCTCGACTTGACTGACACAAATTTCACCTTTCCAGCAGAGGGCGCATTTCCTCTGTATG
AGCTTGGTCGATCACTCTTTTAGTCCTTTCTTTTTGTCACACAAATGGAACAATCGAGAT
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GTATTAAACCAGACTAGAAGCACTTGAATAGCGAATGCTGCTGTGCCATGCGACCGGCGT
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CTTGTTCGACTGTTATTTTTGGGCATCACCCATTCCTGTTTGTACTGCTGTTGTCGACTT
CATAGTGTCTACTCTGAGTTTTTATTTATTTGTATAGATGCACAACAGAATGTGTTAATC
TGCTCTGCTTGCTGCTCTTCTCCCCTCTCCAGGTGCCCAAATTATTGATCTGATGATGCT
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GAGACAGAGTGCCATTGAGAAAATGACCAAGAGACTTCACAAAACACTGGAGAACACTAG
GTCTGTATTTAATCCAAGTAAAAGAATGAATCAGGATATGTGTAAGTTCATGTGGCTGTG
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ATGGAGTGCCAGAGTTAATAGAGGTAAAATCAGGAAACAAGCTGGTCTCCTTTCATTGTT
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TGACATTGTTCAAGTGGTGGAAAAAAAACAGTAAAGCATGTCCTCGGCTGTGTGTAGTTT
CTGTCCAGTTCAGAGTGACAATGGGATACTTTCTTTGTTCAGTCAACAAAGTAAATACTT
TATAGTATGTACTGTATCACAGCTTTCCAGCAAACTGAAAAGGAAGTGGATGTTAATGTT
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TGATTTAAGTACAAGAAGTATTAGTTTAAGGAATTCAAACTAATTTTGGTCGTGTTGTCT
TGTCTATAGCCCGATAATGGATTTTGAGGCCTACACGTCTCGATATATATAAAAAAAAAA
GTTATTTTAAGTTGTTAGATAATCCTTTTTTACATAAACACAAAACATAAACCATTTTTC
AAAATAAGAGTCTCAAGGCTATTGTAAATTTGTTTTTTGTTTGTTTTAACTCATACAGAT
GATGATGATGATGATCAACATTCAGTAAATACTGAGCACCTTTCTTCAGTTAAAAATCCT
TGTCGGTGCTCTCTGATGGACAAAATATGTCATGAATATACAATTTTTTGTCAGTCAGGC
TGTACTGTTGTCAAGTTCTGTCAAATTCAACCAACTTTAAATCAGTAGATTCGATACCTT
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AGTGTTTGTAGAGCCACTACAAGACAGCATCAGCTATAGATATAGATCAAATTATTTGCT
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CAGTTATCTTTTGTGTCATCTTGCCCTTCTGGTTGTTTGTCCTCAGCTTTTGAAGAAACA
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CTCTATCCGTGGTCAGGGAACAGTCATGACTGGAACCATCCTGCAGGGGTCGTTGGCCAT
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GAATCTTTGATATTTACAAGCAAGTAACATGCTGGAGCGCTGGAAATGCTTTTGTAGAAA
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AGTTTTGTCTGCAGTTTTCATGTTCACCTCTTGGTGGCAGCAAATGGTTAAATTAACGGT
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TGGAGATGTATAGTTTAAACCAAACAAAGCACAGCATGGGCTATAATTAAGTTTTTATCG
AAGCTTGATTATTTAAATTCAAATATGAAACCAAAAAAAAAACAATATTGTGAAAAATCG
TTGTTTTGTCTGAAGAAAGAAGTAGCTTAAACAAGTTGTGCATATTTAATGAGCTGTTAT
GTATGTGCATATTTTATTGACCTAAGTCCTCTATTATATTAAATATGTAAGGTATAACAT
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CATGCTCCATGTCTAGTTTTAAGGTTTTAAATGTACATTTAAAAAAACATGAAACAAAGT
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AATTTACTGTTTAACTTTCTCTTTTGCTTTCCAGATCTGATCTATTGATATGAAATTGAA
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TAAAGTCTGTGCAGATGTTTCGGAAGCCAGTGTCTGGGGCCATGCAGGGGGATCGTGTGG
GTGTGTGTGTGACACAGTTTGACCCTAAACTCTTAGAGCGGGGTGTGGTGTGCACCCCAG
GGTCCCTGCGCACACTCTATGCGGCTGTCATCTCTGTGAGGAAGATAGGCTACTTCAAGG
GCTCCCTTGCCACCCGTGCCAAGTTCCACATCACCGTGGGTCACGAGACGGTCATGGCGA
GGGTGACCTTCTTTGGCCTGCCACCTGTGGGTGATTCAGACACTAAACCACCTCCATCAG
AGCCCTGCTCACTGGAAACACCCTTCACCTTTGACAGAGAGTACTTCTACCAGGATGAAT
ATGTCACCGGTCAGGGAGAAGCGAGTTCAGCACCTGACCCAGAGCAATGGGCTTTGTTGG
AGTTTGAGCGGCCAGTCACATGTCCCTCCCTCTGTCTGGTGATTGGTTCAAAACTGGACA
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AAGACAAAGGCTACGCTGAGACGGCACTGCCTCGTCTGCGCATCTACAAGACCAAACACA
GGGAGGGACAGGTCGAAAGGGTGAGTGGACACTCTTTTCTAATTGTTGCCCTCTCTGCTT
ACTTCAGTGTTGCCCTCTCTGTCACCTTGTACTATTTTCTTCTAGCTCTGGTTCTTCTTT
GGATGTTTCTCATTGCTGGTGGCACTGGAGCGTGCCTCTCAGACAGAGCCCCTATTGTAT
ATTCGTAAACAGACACGTACACACAAACAAGTATGCATATGCAGCCCTGGTGAATAGTGT
TTGAGGCTTGGGCGGGTACGCATGCCTTAGCATGTGCTGTGACACAGAGGTGTGTGTGGG
TGGCCTGCCTGACGCCACTAGTCGTGTCTAGCTGTCAGAGACTGGCACTGTTTGGACACA
CCTGAGTGGCACAGGAATACACACAATGACTGTGTGAGTTCACTTCTCTGTGGCTGAGCA
TCTTTCTCCCTCTCACCCTTGGACATGCCGCTTTGATTTGTGTTCTTGGTGTGATTGCTG
TTACGTTGTGTCCTAAATCCTAAGCTCCACTTTGTCCTGATCCATATCTCATCTTATCTA
ATTCTGTTGTTTTCTTAATCACTTCAACATCTGATTTGACAATTTTTTCAAAAAGTCAAC
ACCATAGTTTTTATTTTCACGGGTGACTGCACTGAAGATGTTATGTCTCTATTCATTCTG
CAACATACAGTTAAGTGTCTTTGTGTGCACCCTCGTGCAGGTTCAGATTCAGGTCAGGGG
TCAAGAGTGTGAACTAGTTTCCTGTTGTTAGCACCTCAGGCTGTTGACAGCTCCAATCAC
TGACTCAGGAGAAGAACAGCATGTGCGAGAGGTCCGACCGCGGTCATGCGATGTTACATT
TGTTGTTCATCCGTCTGTCTAGAAAGGGGCAGCTATGTTTCAAGACTTAAGAATTCCCTT
TTCACAAAAGAACACATTACTGGCATTGTTGAGATATGACGGCCTCATCCAGTCACAATT
CATACAGTCAGACGTGTACAGCAACTGTATTATTATTTTTTTTTTTATCAGTGAATCAGT
CATGCTTGAGGGACGTCAGGGTCAAATGTTCAAGGAATGAATGAGGGTTAGGCAGAAGAG
AGAGGAAGAGCTGGCGGTGGGGGGTGAGTTGGAGACAGAGCGGTGCCCTCCTGTTATCAG
ATTAGTGGCAGGTTAAGATCGACTTAGTGATGGATGATAAGAAAGAAATACAAACAAATA
TAGCATAAAATGTGCAGGAGGATGAAAGAGAGAGAAAGAGACAGCCAGGCGGCGAGTCTT
AAAGAATGTGTCTGACGGCGCGCGGTGTGGATGAAGAGGGCGGAGGAGAGTGAATCAGCT
CTTCTTCCTCACCCTGTCAGGATGATGATGGCAAACCAAATGATGCTAGACACCAGAGGA
AGGAAACAGGAGATCAAACTAAAACACATCCTGTCATTTCCAGAGTCAAAATTAGATTGC
TTGCTCGCACACGTACTTCTAATCAGGTTCGTCACAATTTAAACTTTCATGTATGTCACC
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CCTGTTCAAGAAGGAGACCAACCTCCAGCTCTTTGTGGGGTTAAAGGTCAAGCTGTCGAC
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AGTACACACACACACACACGCACGCAGCACTTTCTCTATCTTTCCTCGGATTTTGGAGCT
CTGCGGATGTGGTAAGAGTGGTAGGCCCGAACATCCTGAGCCACATTCCCAGGATTCCTC
TGGGGATTGCCTGTGTTCCGGGGGAAGTCTGCTCTGTGTTTATTTTACCTTCTGTTGCTC
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CTCACCTACATCCTCTTCATTGCCTCACACTTCAATGTAGTCTCAGACATACTGACACAC
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ATTAGGTGTATTTATCCTTTATTGCTGAAAGTTTGCCTTATGGTAGCTAAGCAGCCTTTT
CAAGCTTTTATTTCCATGATGGCCCGCATGTACATGTGCATGTTGCATGTTGCAGCTCTC
TGAAAGTGTTTTATTCCTATACCATATAAAACTAAAAACACTTCATAATGCAGTAAGTGT
ATGGGTGTTTTTCATGTTCTTATTTGTCAGTATTAAGAGTTTATCTGAGCTTTCTGCTGA
TGTGTCTGCACACAGACGTCACCGGCCTATTGCTCATACCTGGAAGTAATGATTCTTTTC
AGCATCTGTGAATCTGTTGACTGTTTTGTTTGCCCATAAAATTTAAGAAAAAATTTTAAA
AATGTCCCAGAATTTTCATCTTCCAAACAAAAGCAGCACATTTGAGACGTTCCTCTATAC
TCTCATCTGGTGTAAGCACAGAAAACAAAGTGGTTTAAACTTGGTGTTATGTTGCTTACT
GGTGCTGTTGGAACATGGCTACTGATCCTATTTTATTTGTCCACCAACAGCGCATGTTTG
GTGCTTACCCTCTCTGATGAGTCATGTCTTTAATGTTTCATGCACTTATCTTGATTCTTA
GACTTCAGTGATAGTCCCATTTCAAGTCTCATATTGTAGATCTAGCACATGGTTTTTAAA
CTATATTTTCTACAGACAAATACAAACGTGTAAAAGTGCAATTCCTTTGTGTCGCTTGAA
TGTTAACGCAAATCATTTAAGTTTGGGCGTGTGAGTATGTTTTGTGGTGGTAAACGGACA
TTTTCAGCTGATCTTAGATAACACGAAGAGATTTCTGGCTGCGCTGCAACCATAACAACC
CTCACGCTGGCATAACGATAACAAGAAGAATGCTGGCGCCATTTCGTACGTGAGGTCAGA
CAGTCTGCGTGTAAAGCAGTGAACCCAGAACATTTCTTACCATCCGTATGAAAAACAGCG
AGCAAGCAGCCAGTTTTTTTTATCCTCGGTAACACACACATATATAAAGAGAAGGGGATA
CATATGATGGCATAGAAGAATTTGTAGTGCACGCATGAGGAGCTTCAAACAGCAGCTCAG
CGTTCACAGGAAACAACTCAGTACGGCCGAGAACAAGGCCAGAGCGAAGGAAGAGTTATG
TATGAGCAGACAGAGGAGACCCAATACTGGAGTGTCAGGATGACCGAGACAAACGCAGAG
ACTCGAGCAGCAACCGAGACTTGGTTCTCTGCACATTTTCATCAGTTACATCAGGAGGAC
GGAGGCATCAGTTGATCTCGAGGTCAGCACGCATAAGCACTGATAAAGCACCTACTGCAC
ACATAACAGGGAAGAAAAGATCTCTATCAAGCATCAGATATACCTACACTGTGATGATTA
AGTTGACCTAAGTACTGTACATAGGAAGGCTGATCTAGATTTATTGCACAAGGAGATCTA
TTTATCTAATGTTTCTTGATTTGTTTTTTTATAGATAGATAATCAACCTTTTGACTTGAT
CTACCTGTTTATCTTTTCCCCAGAGGGTCTTTGCCCAGAAACCAAGCAGATGTTATCCTC
CACCTCTAAGAAGAAAGGGAAGGGTGGAAGCAAAGGTGGACCAGCTAATGAAGAGGAGCC
CAAAACAGATTCTCAACCTATTATCATTCACTTGCATTTCAAGCGGTATGTCTTTGATCC
CCATAAAAAGATGGTTCAGTCT
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