SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003389_2.0
Identity
TranscripttRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesXiphophorus couchianus (Monterrey platyfish)
Transcript IDSPT00003389
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003267_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003389_2.0 # Transcript # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Monterrey platyfish (Xiphophorus couchianus) # Full length # Forward
ATGTTTAACAGGCAAAACAGCCTGTGGATGGGTGACGTAAGTCCTAATCTTTGGCTTTAT
TTACCAACGTTAGTTTAGCCGCGCATATAGCTAGCTTGGTTAGCTTTGACGAACCATGAA
GACTGATATGCCTCCGCCGAAGTGCTTAGTATGTATGGCTCAAAACTCCTCTCTAGAACT
AAATGGTAACCTAAATTATCTAAAAGTTCGGTTTAATAAAAGTGTGAATATATTTAACTT
GTGGATAAGCGCTTTGTCATGCCGCTGGAAGCGTTAGCTGAATATAAGCTAACAGTTAAA
CAAGACTGACATGTAAAGCGTTAAAGATCTCATAACTCTGGAGGGGCCGAAAATAGTTTA
TTAGTAGAGTGAAGTATCGTCTTTTATCCAAGTGGAACTATTCAAGTCAAAAATAGCTGC
AGCAAATTTAAATGTCTTTTTTTTTTTTAAGAACAGTCTGTACGATAAAATTAACAAAAT
TACATGAGTGACTAACTATGACTAACTTTAGGACTATGAATACTTTGTTCACTGATGCTT
CTTTGCTGTTTTTACACAAAGTAGGGACAGGAGCTACTTACTGTTTAGTGTCTTCATGAC
AGTAATGCCTTACTTTATTAACTGTGCTTTATTCATTTATTTTTCCCTTCCTTGGTTAAA
AACATGCCAATGCATTGTTATCTATACTAGGGATTGGACGTTTTGCAAAACTTTGTGAAA
CGTTTTCTGCATTCATGCTTAAATCATGCAAGTGATTACAGATTGTTGACATGTACAATA
ATAAAGCCTGTTGAAAGCCGCAACGTTTTATTTAGTAATATTTGGTAAAGATTGTTTCTA
AATGTCACGCAACCTTATCCCGAGTCATACATTTTTATTTGACAGTAATATAGTTACCTC
TTTTATTTATTTCTAGTTGGACCCATATATGGATGAGAACTTTGTCAAGCAGGCCTTTAG
TGGTATGGGAGAGTCACCGTTGGGAGTCAAGATCATCACTCACAGGATAACAGGGTAGGT
GATACAGTACACTACTGATCAGACATGATTTTGTTGTTAAAGCCTTTAAATTAGCAAGCA
GTTTTTTTACCTTGTTGTTGAATATCAAGTTAACTTGTTCTTAACTTATTCTCAGTTACA
CATTTGCTCCTTCCCCATAGCGGCTTCATCCGCCTGTAAAAACAAACGTTTCCTTTCTTT
TATCCACTTGCCTTCCTTTTGCTTCACTTTTTTCATTTCGTTTTCTGTCTTTCCACAGTG
GCTCTGCGGGTTACTGTTTTGTGGAGCTGGCAGATGAAGCGAGCGTCGACCGCTGCGTAC
AAAGACTCAACGGAAAACTGGTCCCAGGATCAAACCCGGTAAGCTGTTTGATTTAGCAGC
AAAATATTCACATTTTCCTCAGTAGCTCTCGTACCAGAAATAAATGTTTCTCTATTGTTA
TCAATATATTGACAGTTTCTTGCCATCTTCCTTTTCTCAGCGTTAGATTTGGGCCTTTTC
AGTGCTTAACTCTTTTATTGTGGATAGTGGAGCTCTGCCCGCCTCGGATGTACTTTGTTT
TATGAATGCACATCTGTATAGTAGTAGAACATTTGAATATTTCTGATCAGTTTAACCCGC
TAGTACCTGTGTCATTTTAATAGTCTATGTGGCTTTATGTGACAAATGCTGGACAATAAG
GCCTGTTGCTGTAAAGCAACAAATGTTCCCATCCTGAAGATGCCGGTTTCATGTGGTGTG
TGACGTGACATTATGAGCTATGAGCTCCTTGGCACTGCTTGGTTTGAAGTACTGTTGGCC
CAGTGGGCCGGCCAAGCTATGGGCTGCCCTGTTCATAGAGTCTCTGGTAGGAACTAACTG
AGGAAGGGGCTAAAGGCTGGTCTGGGTGGTGGAGGTATGTAAATCTAAATAACAATAATA
ATGCCACTTTTTGTTTCCAGCATTATCAGTGCTATACTACACGTCTTTGGTGTTTGAGGT
TGCCTTAATGTCTGTGTTCTTTTTTTTTTTTTTTCACACTTGCAGCCCAGGAAGTTTAAG
CTAAATTATGCCACATATGGGAAACGTCCAGAAGCAGGGTAAGATCTGACTTGTGTATCA
TACCTTTACCTTCCTTTAGAGGTTGCTTTCACACCTTCTGTCTGTGTAATACTTCTACAT
TTCTTCAGATGTAACACAGTTGCATCTGTAACAACTGTAACAGTTGTTACAGTAGCTTCT
CCCAGGGCTTTAGGACGAGCCTCATTCCCAAAATAGCTCCAACGTCCAAACTTAGTGTTT
GCACACATTGCGCAAGTTGGCTGGACACAAGTAATGTAGCACTAATGACATCATAAACAT
AGATTACAAGATCTGTTTTAGTCTATGTTAGTTGTGGTGCGTTTACTGATCAGAAAAAGA
TTATGGTTTTAAATTGTCTGTTCTACTGTCGTGGATGATCAAGATTAAATTCAGCTACTT
GGTTTCCTTCTTGCTTTCTGGGTGTGTCTTTGTCTAGGTAATTCAGACCATTCACCTCAT
TAATTTAGCTGCTATTCTAAAACTAAGAACATTCTCGTAGTTCACTCATAAACATATAAC
CTGAGCTCAGCTTATTTGTCAAACATGAAGCTACATTTTGCTACTTGACAGTATTGTTTA
GAATAAATCACTAAGTCCTTTGTGCTTCCTCACACCAGTATGTGTGCACAAATAGACATT
TTAATTATTTATTTATTTTTTTCCTTTTTGCTCTTTCAGGCCGGAGTTCTCAGTGTTTGT
GGGAGACTTGGCCTCTGAAGTGGACGACTTTCAGCTGCATCAGGTCTTTAAGAAGTACCC
TTCCTGCAAAGGAGCCAAAGTAGTCACCGACCAGTACGGCTATTCAAAGTACGTCAATCA
CTCTGTGCGTTTTTAATTTGTTAATTAATTTTTTTTGTGCTTTATTATTAAACTTGGTTA
CTCGGATAGCAGTGCTTTGGACGTTGACCACCAGTGCATCTTCATCTGTTTTCGAAAAAG
GCTGAAGAAATGTTTTCTTGCCGTCTTATGCTAAAACTATTGTTTTCCCCATATAGGCTA
AGCAAGAGCAACTCACAATTCAAGTGATGCTACCTCATGTTAAAAGTAAAACAGCAAGTT
TCAGTTCTACCATAATAATACCCATTATATTCTGTTTCTCATAAGTGGCTAATACATGGC
AAGTATGTGGCACAAACCGGTGGGCAGAGGAGGCGTAACTTTGGTCTGGTTTTTCAGAGG
CTACGGCTTCGTCAAGTTTGCTGACGAGAGCGAACAGAAGGCGGCGATAGAGGAGTGCCA
GGGAACCATGCTGGGGGGGAAAACCCTGAGGCTCAGCATCGCTGTGGCAAAAAGGTACGA
CGCAACAAGCAAGCACAAAACAGAAAGCAAGCTTAGAAGAGGAATGTGAAATTAATTTAT
CTGCTATAGAGGCGTTTTCAGTTTTTCCATACATCCCTCCAGCCTTAAACCCTCATGTCA
AGCTCCATTTTTTGTTTGTTTCCTACTTGTTGTCCTTTTCATTCTGTCCTTTGGCCTCCT
AATCTTTCTTTCCAGTTTCTTGTTTTTACAGATTACAAATTTAAAGCATGTCCTGGGTAG
AAATATTTCCTCAAGATTTCTAACTTGAATCTTAAATATTTTAAGATGCAGGCCTGGGAG
CTCTGCAAAGCTGAGCTCAGGAAATGTCTAAGTGAAACACGTGTAGTAACCCTATGATAT
CAATTTGGTCTTTGTGTATAGATTTATTTTTTATTCTTTCCTGCAGACTGTTAGAATCAG
AAGGGAGTCAGATCAACTGCAATTATTTCTGTGCAAAACAATCAGTGCTTTTTTAGATGT
TGAGGTCCAGGTTCTTCATTTTGTGTCAATATTTGGTTAGCTAATGCTAGCTGCTTATTA
GAAGTCTGTATTGTAAATATTGTTGTTTTTGATGTACTAGTTTTAGTTACAGTGTTGCCT
TACAAAATGAAGAGTTATTGAGAAAAAAAAGGATATTTTAAAAACAAAAATATCAATATT
CATTTTAGAAATTTATGTCGTACTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTAAATACATCGAATTAAA
ACATTTAATTGTAATTTTGTAGATGTATTTTAGGGTTATGAAAGTAGTTAAAACTCTGGG
GTGTCAATTATGACCAGATTATAATTTTAGGATTTAATATTTTGCCTTGAATTCATTAAT
TAATAGTTTAACCAGAAAATAGTTTGTTCACAGATAAAATTGTAATTTAATAAGTGAAAT
AAGTGCTACATACTGACAAACTGACCCCCGAGTACTGACATACTCAGGGGTGAACTGACC
TGGAGCTATTCAAATGTAAAACTTAAACTGCTATAATTAATAAAGCTTAAGGTCAAGGCT
TTCTGCATTTTTAAGTTTTACAGAATAATTCAGTTCAGACAGTTTTAGATTGACAATATT
TCAAATCTACTTTTTTGTTGTTGTTTTTCAGCCAAAAGACGACCTACCCAGGAGGCCAGA
CTCAGAGTTACAGTAGCTACAACCCGACACAGTCCAGTTACTACGGCAGCCACGCAGCAG
GAAGTCAGGGCGGTTACTATCCTCAGTGGGGGGGCTATGACCAGTACAGTGGCTACAACA
GCAGTGGTTATGGCTACAACAGTGGATACAACAGCGGCTACAATAGCAGCTACAACAGCG
GCTACAACTATAACTATGGGGCTTATGGTTACCCCCCATCAGGTCACATGATGCCCCCGC
CTCCCATGGGGATGCCTCCCATGTCCACCGACATGACAGGAGCTGTACAGGTAAAAGAAA
TACAAACTGATCAACTGGTGCAACTTAGTTGACTGCAAACTATTTTACGGATAAACCTGT
TAAAACATAGGCTGTAATTTGATGAACTTACAACAATATAGTTATATAAACGTATTGGAG
CTAACTGTCAACAATGCCTGTAGGTAGCAATAGCATTCGCTCAGTTATGCTAACGGAAGA
AACAAAAGCACAATCTGTTTTCCTGGTTGCAAATTTGATATATTCAGATTAGTATTGATG
TATTTTTAGAATTCTGATGAAACATTTAGTTGTTCTTTTGTGGTCCGGTGACAATAGTTT
TATTTTAATCCTGGGTCTGTGTCCAGCAGGGCCAGGAGCAAGCTGAAGATGCTGATGATG
ACAGCACAGAAGGTAAAAACCCTTGATTGCTTTCGAATAATCATTATTTCTACTGGAAAC
GATTCAACTCATAAACAATACCTGTCTATTAAACCTTTATGGAAGAGAAGCAGCGCGGAT
AATTCTTTTCTGATGATCTTGGTGGGATTTATTCCAGAGCCCATCCCTGAATGTGACGTG
GAGCTGTGGAACAAGGACTTTATGCAGCACAGTGAGGAGCTTTATGACGCTTTGATGAAC
TGTCGGTGGGAACCTTTGGACTCTGTTGACTCCCCTATC
Chart Advanced