SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003404_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase (TR)
SpeciesParus major (Great Tit)
Transcript IDSPT00003404
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003282_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00003404_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase (TR) # Great Tit (Parus major) # Full length # Forward
CAAGGAACCACATGGGGACTTGGTGGAACTTGTGTGAATGTTGGCTGCATTCCTAAAAAG
CTTATGCATCAAGCAGCCCTTTTAGGGAGTGCCCTTAAAGATGCCCAACACTATGGCTGG
AATATATCCCAACCTGTTCATCATACCTGGTAAAGACTGTTGCCCATCTCCACTCCTATA
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AATAACATAGTTGCCATTCATGGCAGTGACTTTCTGCTATAAAAAATGCACTGTGTTAAG
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AAGTTGTAACAGTGTAATGTGGGAGTCTAGTGTTTATATGTTGCATTCCTGAGATTTAGT
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TCCCAAGGTTCGGTTTAACACCTTTTGTTTTTAGTCTGAGCTGTGTTGTAGTTATTCTTT
CTTTTCTCCCTCTCCAAATGTACATATCTCAGCTACAAATTACATGCCTGGAGGTTATAG
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AAAAATCCCTTAGATATACAAACACGGAGAAGAAACTCACTACTGAGATGAAGGGTTTTG
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GCTTTTTGCAGCACTTCTCAGGAGCTGCATGCTAATGAGCTCACAGATGAATCAAATGCC
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GAACACATCTCCAAACTGTGAGATTTTAACAAGTCTTCATAAGACATAAACAGCAAAGGA
GTGCAAGTGCAGCCTGTCCAGCAGCTGAGTGTTAATGGCTGCCTGGCTGGAGCTGCTTTT
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GATGTAGTCAAGAGAGAGAGGAGCTGCTGCAGTGTAGGGAGCAACTGGGGACAGAGATGA
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TTAATCTGGCTACTGCTGTAAAAGGCAATAAAAATCTTATTTTCTATAAATACAGTAGCA
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GTAACTGTGGCTGTTCTGTGGGAAACCAACCTCTGAGCTGAAAGACAGGGAACAGAAGAA
AGCCCCCATAAATCATGAGGACTTGGTTAGAAACCTGTTACAGCACTTGGATACTCATAA
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GGTTTGATCAGGCAAGTACTGAATATATTACATCTTCTTACCTAGCAAATAAATTAAAAG
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TAAATATAAAGTATATATATAAAAGAATATATATATATATTCTTATACAAGGTATGGAAA
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ACAGCACAAGATCTGAGCAAGCAGGGAATAGTGTGTGTTGCACTTGGTCAAGCACAGTAG
GGCTTGCTCTAAGAACTTGATCCTCTGTAGGCAAGAAGAGCACAATGCCCATAACAAACT
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CCCCCACTAAATGTTTAGTGACTTAAACAATGGTAGTTGTTTAATTCTTTTCTTGCATTC
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GTATTGGTTCAGATGGGCTGTAAGCCCACCAGAGTATTCTTGTTTTTGTGCTTATAAAGC
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GCAGGCAGATGATATCTGGCAAACAAAGTAAATAGGCTTAAACATACTACCCAAGAAATC
TGGTTTGATGCAGACGAATAATGAGTTTTACTAGCAGCTTTAGCAATCCCCTTGACTACT
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TTATTTATAACATAAATTTAAATTCTTGTGGTTGTAGAATAGATCCATTACAGGATCAGA
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GGGACTACATTCTGTTATATTCCAGCTCAGTGCAAGAGCTTGTTCTTGACCTTTATTTGA
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GGAATTAGTTTGTCAGAGAATGTGAGGTAGTGTGCAATGAACTGTGACAGAAAGAGACCA
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GTATCAGGTGTTGCACATCATATGCTATCAATTACTGACATTGTCCTTGGTGCCACACTG
GACATTAGGCAGATTTGTTTTGTTGTGCAGCAAAATAGAACCCTCACTGTTTGGTATCAA
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GGTTTGGATTAATAAGGGAAACAGAGATTTTGTTAGGATATTTTCTGTGAAAAGTCCCAT
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TTGTGGTTTGCTGAGGCTTTGGGTCTTTGTTCTGAGCTTCCCATGTCTCTCTCTCTTACT
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ATTCCCATTATATCAGCCAGTGCTTTTAGGTTTTTTTCCCATTATCTAGTTTTAAGGACA
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AAAAATAACTTGTTCATGTGCTAGGCTTGCCTCTAAATCTGCATGTGAAGAAGGTTGGAT
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ATTGCAGAGCCAGCCTTTGAAACCAAACCTTTGGTTAAAGCAAGCTTTGTGTGGGAGAAT
TAATTTAAGAGTGAACTGTAGCTTTCTTCTCAGGAAATGTCTCCAGTCTCTTCACTTTTT
ACAAGATGTTGAGAACAAGAAAAGTAGGATTTTAGAAGTCTGTCCCATGCTGTAAGTTTT
TAACTTGATTACAGGTCACTTGGGAGTTGCTTTTGTTGTTAAGTCCAGGTGTGCGCTGAA
TGGCCATGGCCAGATTTTTGTTCATTGCACCATGAGCTTTCTTCTGAGGCGACTCCTCTG
TGTGAAAAGTATTAGTCAGTGCTACAGGAGAGTACAGTTCTCTTGGCAGAGAACCAATTA
CTGACCTAGCACTGACTAAGGGCCAGATTTTTTTTTTTTAATTGTGGCAGGCATGCTGGA
GGTTTATCAGTAATGGATGTAGTGTTTAAAAGCATCCTTGTAGAAATAATGCACACTGCT
ATCAATGTGATAAAGGTTCTGAACTTCTTTTAACCTTACTTAATCTTACTCTAGCCAATA
TTTTCCTGTAATCTGAACAGTAGTTACACTGAAGTGTTTTTTATTAGTCATTATCAGCTG
ATTATGTTTAAGTGAACATCTTGTGGGATTTAGGATACATTTGAAGGAGGAAAGGGTAGT
GAGGTTCAAACTAATTTGGGGAATTTGTCAGGCACTCAGAACGAAGAGAGTATTGAGACT
GGGAACACAGACAAGACTGATTAAAGTGATACTGAGGTCAGACTGGATAAAGTTATAAGG
TGATATGTCAGTGTATAAGGAAGAAATGGAAGCAGACTATTGGGCTTGAGCTTTATCCCA
AAAAAACTCTACTGTCACCCAGCAGTATCCTCACAGTGGCCATCTACAATAAAATGCTTG
GTTGGCTCCAGTTTGGAATTTTCAAATGTTGTGAGGCAAACAGGCATTCCAACTTCTGTG
GTTGAGAAACTTGGGAAGACCCATTATAAAATTCTGCTGTCAGCTGCACCTTTATCACCC
TGGGAAATCTTACTGGATGTAAGAATATGCTATCACTCATTTACCACTGCTGCTTACCTG
ATGATGCCTATTCCTCTGGCTTCTTCTGAGTTCAGCTGCTTCATTCTCCACTGGTGAAGG
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TGCCTGGCAGCCCCCTTAGGAAGCCATGTTGTTAGATTTTACAAAAACAGATCAAAAAGC
TGTTTTTTTCTTTTAAAGTTAAAAGCAAGTGGGGGCCAGCACTGAAAGCAGGGCTCTGTG
TGGTTTTCACAGCTGTGTGCTAAGCGTATGGGTCTGTGAAAGATGAGATTATGGTGTGCT
GTTAGAAGTGCAGGAGGCAGATCACCTTTTTAAGGGTCAGATTTGAGTTACACCTTTCTT
CTAGATGTCTGGCATAATATTTTGCTGTTTTGAATGAAAGCTAAATCTAATCTTGTGTCC
TGTACAATCACACACTCCTGTTCTTTGGCAGTTTCAGGACATCTTCAAACTAAAAGCATA
TGTGCAGATTTTAGGCAAATGTAGGTATGTGTGCCTGGTAGGATTTGGGATCTTAGAAAT
AAGCTGTGAAGCCATGCTTTCTTGAAGTTGAAAATGTGAAAAAATCAGGAGTTATGGGTA
TAAAATGAAAGTCCTTTTGAGAAATGGTGAGAACTGATTTTATAATAGTAAGTGCATGCT
GGGAAACATCAGAATTCCCTGAATTTGGCACTACAGCCTACCAAGACACATTTATAATCA
TGAGCCTAAGCTCCTGAATTTCAAATCAGCCAAGATCAGTAAGTATAATTCTTGTTTATA
GAAGTGAACCTGCATGGGGCTAAAGGCCAATAGAGCTTCAGTTCAGTGTTTAAAAATTTT
GGTTTTGCCTTCAAAAATAATAGTTAGGCAGTAAAATTGAGAGAGAAACTTCACTATGAG
AAGCAACACCTTTTTTTTGTAGTTCTTAGCTATTAATACCAAGCTGTACATATGTTAAAA
TAGACTGCAGTGGAAAGGTTAAGTGTTATCCTGCAGATTTGATAAACTCAACTGTTGTTG
TCACAGATCTTTAAATGACTCTATTGACGGTTTTTCTTTTTTTCCTCTTTCAGTGCCTGC
CATCGCGTGCTAAGTTTTCTCTTGGCTCAGCCTGGCAGGAAAAAGAGGAAACTAGAAAAC
CCCATTAGTTGTCCATTTGCAGAATACCCAGGCTTTACTCTCAATACACAAAGAAATACA
ACGGTAGGAAGTTGTTTCACATCCGAGCCAAGATAAGGTCCTGGAGGTTTATTATTTTTG
TTGCCTGATAGCATCAGGACTGGGGAGCAGGGGGCAGAGAAGGAACAGCAGATCAACATC
CCATGAGGACAACAGAAGGGAAGACAGACAGATAGCCAAGTGCCGACAGCTTCAGTCAGT
GCTCCCAGAGGAAGTGTTGGTTTCACCAGATGAAATTAATACACAGAAGTCTTTACAGAG
GCATTCAGATGTGACATTGTTTGAGGGGCCTGGCTATATGGCAGATGTATAAAGCACTGA
ATCATATGTTTACATATAATTAGGTCTGTATTGACAAGCCAGGTTTTACTTTTGTTTAAT
AATTTCCTACATTAGCATCAAAGAGCTTGTTTTTATAATGAGAACACATTTCCCTTTTTA
TTTTGCTTTGCTAAAGCTCTGTATTAACATCAAATGCAAATCATGACTCACGCAAAGGAG
ACCTGTATGTGTAAATATATCCATATTCATTTAAGGCCTCTAAAACAGACACAATGTTTA
AAAATTTCCTTAATTTGGATATATTCAGGTATTCTTTTTTTCTATGTGTTCCTGTGTAGC
CTTAAAAATTTTGTGACTAATACATAATTTCACTGTGCTTATTAACTTTCAAACATGTTG
GATAGAATTTAAGATTCCAATTTCTGGGTCAGGAATTGTTTCCTTAGATACTCTGTAGAA
AGGTCAGTGTAATGCTGTTAAGACTTCAGTGATCTAAGGGGTAATTATGCAGAAAACACT
ACAAAAATAGATTTTTAAAATATGAGATCATTTGATATGATTGGAATAGGAAGCTGTAAT
ATAATCTGGGCTTGGTTGGATTTGCCTCATTTGTTTTTAAATACATTTAAAATGTTTCTA
AACTCTACAGAAATAGCTGTAGATATTATAATAATAAAAGTTATAATCGATAACTAAATT
AGCATTTAGGATGTGAGAACAAAGTTGATAAAATTTTTCATCTAAGCTGAGGGAACTAAA
AGTGTTTTAAGATAAGTGTATCAAGATTACAAGAAACGAAGACTTCAGGGATGTTTAAAA
TTGAACAGGATTATTAAGAACTTTTATTCAAAAAGTATACACAACACAGTGTTGCCATTG
AGCACCATTTGATTAATATTTATTGGAAATTTTCAGTGTAGAAGTTGCTTATTTTATATA
TATATATATATTTGTGCTACCTTAGGAAACTGAATTTAGAATACTCAATAAATATGGAAT
CATGTTTTTTTTGCAAAATGGATAACCCTCTGATGTCTGAACAAATGCAATAGTGATCGA
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GTTTTCTCATATTTCTGCTTGGACTATCATATAGAACAAAGTTCTTGGAGACCCACAGTG
GAGGATGCCAGCTTTTTAGATTAACACTGCTGAAGTTTTCCAATAACTTTTACTTTAATT
TCTTATTTATTTTTTTTTTTCCTTAAGGCCGAGCCCCTGACACCAAAACTCTCAATTTGG
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TAGTCATGCTCTAGTGTATATCTTGTGTTTTGCACTTTTTCACTTGGCAGGACTGGAGTG
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ATGAGAGGTTATTGCTGATGTTTATCAGGGAGTGCATCATTGGTCAGAGGCTAATAATGA
TGTCTTTATCACTCTGATTATCTTTCTGTAATGTTTTTATCACTTTTGACATATGACTTC
ATACTGCCTGTGAATGCTGAGTGAAAGCAGTTCTTGCCTTCTGTAGCTGAGTACATTTAT
TGGAGATGACCATGACAAGTTCTGTGACGGTATTTTGGGTGTTAATTGAGACTAATCACA
AAACAGCTTTTCAGCTCCCTGACGCAAAATGCTTCAGACAAAACTACTTTCCTCTAGAAT
AAGAAAAAGTAATTGCTGAAAATAGTAAATGCATTTGAATTTTGTTCATGATTATGTTTA
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